Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0069500
Sequence Length
658 nt
GC Content
0.5213
UUCUUCCUCGGCAAUCAGUUUGGGGAUUCUCAGCAGUUGCGGCUGGUCCGUAUUCUGCGCAGCACCGUGAUGGUUCGCGUUGGUGGAGGAUGGAUGGCCUUGGAUGAAUUUUUAGUGAAAAAUGAUCCCUGCCGAGUUCACCAUCCUGGGAGUAAAAUAAAGCGCUCUGAUUCCAGCUCUUCGAUUUCCAGUCAGUCUCCCAUAGCACGAGGUAGAACUAACAUUGAACUUAGAGAGAAAUUCAUCCUACCAGAGGGAGCAUCCCAGGGAAUGACCCCCUUCCGCUCACGGGGUCGAAGGUCCAAACCAUCUUCCCGGGCAGCUUCCCCUACUCGUUCCAGCUCCAGUGCUAGUCAGAGUAACCACAGCUGUACAUCCAUGCCAUCUUCUCCAGCCACCCCAGCCAGUGGAACCAAGACUUCACUUCAGUUCUCUCGCUGUUAUGACAAACCCUGGUUGGUAAACAGUAAAGCUGGCACCCCUAUCAGGGACAGCCAUUCUCCUGACCUCCAGCUGCCCACCCCCGAGGUUAUCCCAUCAUCAGGUAGCAAGUUGAAACGACCAACACCAACUUUUCAUUCUAGUCGGACAUCCCUUGCUGGUGAUACCAGCAAUAGUUCUUCCCCGGCCUCCACAGGUGCCAAAACUAAUCGGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-183.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -197.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 240.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((........((((((((..(.((((.(((((.....)))))..)))).((.((.(((((....))))).)).)).(((((((.(((.(((((..((((((((....))))))..))....))))).))))))))))((((((......(((.(((........))).)))..)))))).)..)))).))))..)).))))).))))((......((((((((((.(((.......(((((.((((((....((..(((...((((((...........))))))((((((.......))))))..((((((((.....(((((...(.(((......))).)...)))))......(((((.......(((((.(((..(........((((((((.((..........(((...((((......))))...)))....))))))))))......)..))).))))).((((...)))))))))................))))))))...)))..))...))))....)).))))).((((((.............))))))))).)))))...((.....))((((((((...)))))))).))))).......((((....))))(((...........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,.,(((((({.....|,|||||||....,.({((,((,{(.{{{,||||,,,|}||.,.{{({(((((,{{.,}|}|,{(({(({(((.(((((((..((((((,{({{{{.,,,|,,,||,.||.{{,,,|{{{||||,.,.{(((((((......{((.(((........))).)))..))))}}}}..,{{|||||...,,.,},)).})}}||.....,}}}}}|,|,||||,..}},},},,..,{.((((((..(((.(((({.((((((...........))))))((.(((....))).))))))))))..))}})).,{((((...{.(((......))).}...))))).....,|||}}.}}}))).)))))))}}))),,)}},,,{{||,((,(((,,.,,,...,,,}}},,|},,,,,.}})),..,,.....{{{{|||,|{,...((({...)))),.,,||,.}}})))),}})),......}}}|,,,,.,}||||{,....,.|}}|||,.,}},,,,,..))),)).,{{{{...,,,,}}.}..))))),.........,,.||,...,,.((((((((...))))))))..},,..,,,,,{(({,,....)),}}}..,,,,....)))}))
Back