Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MAT2B_0000600
Sequence Length
462 nt
GC Content
0.4416
CCCCAUGUUAUAGUACAUUGUGCAGCAGAGAGAAGACCAGAUGUUGUAGAAAAUCAGCCAGAUGCUGCCUCUCAACUUAAUGUGGAUGCUUCUGGGAAUUUAGCAAAGGAAGCAGCUGCUGUUGGAGCAUUUCUCAUCUACAUUAGCUCAGAUUAUGUAUUUGAUGGAACAAAUCCACCUUACAGAGAGGAAGACAUACCAGCUCCCCUAAAUUUGUAUGGCAAAACAAAAUUAGAUGGAGAAAAGGCUGUCCUGGAGAACAAUCUAGGAGCUGCUGUUUUGAGGAUUCCUAUUCUGUAUGGGGAAGUUGAAAAGCUCGAAGAAAGUGCUGUGACUGUUAUGUUUGAUAAAGUGCAGUUCAGCAACAAGUCAGCAAACAUGGAUCACUGGCAGCAGAGGUUCCCCACACAUGUCAAAGAUGUGGCCACUGUGUGCCGGCAGCUAGCAGAGAAGAGAAUGCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-128.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -137.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 119.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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