Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0000900
Sequence Length
2016 nt
GC Content
0.4866
UUACAUCUUAUAGCACCCAGUGAAUUAUGAUAUGGGGCUGCGGUUUAUUUGCUCUGGCGACAAUAUGGCUUACUUGCCGUGGAAUAUCCCGGUAUUUCAGAAGUAACAUAUUAUUUUUAAAGAGGGAGCUUUGCUUUCUCUAAAUCACAUGGUGCAAAGUUGGGAAUACAGUGGCCUGUAAAUUACAAAUAUUAUUUACAAACUAGAAGGAAAGCUGACAUGUGUUUGUGCCUGUGUGACAGUUUCACUAAGGAAUUCCAAAACUGUGGAUAGCCUGUUACUUGAGAAAAAUACACGGUGGCAGUCUUGCAGAUGUUUUUCCCGCCUGUUAGCCCUCCAGGUUCAAAAACUGUUUGGUGCAUUUUAAGGCGGCAGUCUCACCAGAUCGCAGGAUUCUAGUCUAAUUGGCUUCUAACCUUCAAUCUAACCUUGCCGGCUUCCUUGCAAAGCCCGGUGCAAGGGCCUCUUUCAAAAUGAACCCACUGGUGUGCCUAGCAGUCGGUAGAAGAAGCGGGAGGGCGUCCGGUCUGCACGCCCGCCGCGAGGUUACAAUGCUGAACGCAUGAGAUGGAAGAUACCAACGGGAGGCCGAGGGGAUCCACGGCGCCCGCGCGGGCUCCGGCUUCCUCCUGCUCUCGGCGCCGCUGGGCGACCGCCCAUGACCCGCUCUUGCGGGCUCUGUCCGGUUGACAGGCGACCCUGUGGCCCGGGGAAGCGCGGGAGGGCGCCGGCGGAAAGUUGAAGAGCGUUUUUCUCGCCGCCGCGUGCAUUAGGAGCUCGACGAGUCCGCCCUGGGCUUCCUGGUGGGGCUGGGCGGGCGGGGGAGGGGCCGCGCAGCAGCAGCGGAAGCCAGACCUCGGCGAUAAGAGGCUGCACAGCGACAUGCAACAGUCUUUUCACUGCAGCUGAAUGAGUUGUGGCGCCCACAAUGCUCCCAUGACAAGGAGCUGACAAGUUCCAUUUUCCGUCGCGGGCAUCUUGGAAUCAUGACUCCCACAAUGCCUUGGGCACUUGGUCGACAGUGGGGCCGCCUCUGAAAAAAAAAUGUGAGAGGUUGGUACUAAGAAGUGCCUUUCCUGACGUCUCUGCUGCUUGGAACCGCUUCUAGAGCAGUCUCUGCUUUUGCCUUGCUUGCUGCCAGCUAGACUGUGACGACAGCACAUCCACCCUCCACCUCUAGCCCAGACACCCCCAUUUCUACUUAUAAUCAAGAGAAAAGCUCUAAGUAUCUGGCAUUGCCCUAGGCUGCUUUAGUGUUAAAAGAAAAGUUUGCUGAAAAAGUAAGAUAUCUUCUGCCAGGAAAUCAAGGAGGAAAAAAAAAAUCAUUUUCUCGAUUUUGCUCUAAACUGCUGCAUCUGUCUAUGCCAAACUAAUCAAUACCGAUUGCACCACCAAACUCCAUUGCAAAUUCAGCUGUGAGGAGAUUCCCUUUCAGACAACUUUGCUGAAAGCAGCUUGGAAAUUCGGUGUCGAAGGGUCUGCCACGUUUUCAUGCUUGCAUUUUGGGCUCCAAAUUGGCACUGGGAAGGGGUUACUGAGAGCACAAGGCUGAUACCAGGCCCUACUUUUAAACGUUCAUCUACUUACAAUCCUAGUAUUUCUCUAAAAACCAAAACCUCUUUGAAUUAACAGUUUCAUGCUGUGAAUUUCUAGUGGGAGAUCUUUUCCUUGAUAUUGACGACACAAUUUUCCAUGUACUUUUAAAGCAGGGAGUGGGGAAAAGUAUUUUGAGGGGACAUUUUCAUCAUCAGUUCAGCUUUUUUUUUUUGGUUGUUGCUCUUUUUUGGGGGGGUUGGGUUUGUUGGUUUCACUGAAACAUUUAACUACCUGUAAAAUCUAAACAUGGCUGUUAGUGUCACACCAAUUCGGGACACAAAAUGGCUAACACUGGAAGUAUGUAGAGAGUUCCAGAGGGGGACUUGCUCACGGCCAGACACGGAAUGUAAAUUUGCACAUCCUUCGAAAAGCUGCCAAGUUGAAAAUGGACGAGUAAUCGCCUGCUUUGAUUCAUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-651.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -689.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 510.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.................((((((((((.......((((.((((((.(((((.(((..((((..((((((......)))))).......((((((((((..(((((((.............(((((((((...)))))))))...(((((((((((((((((((........(((..(((((((..........)))))))..))).........))))).....)))))))).))))))...........(((...((((......))))...))))))))))..))..))))).)))(((((((.(((((((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((.....)))))((((....(((.((((((.......((((.(.(((.....((((.....)))).....))).).))))....)))))).)))...))))((((((((.((..((((....((((...)))).(((((.(((((..(((((....((((.....((((..((((((.(.....).)))))).))))....))))..)))))..))))).)).)))..........((((..((((.((....)).)))).))))((((((((((.....((((((((((((((.(((((.(((((((((..((.(((((((....))))).))))..))))))........))).)))))))))))....))))))))((((((((((..((..(((.....)))..))..)))))).))))....)))))))).)).)))))).))))))))))))).)))))).))))))))))((((((((.(.(((((((((((((((((.((((.((((.((.(((((((((....((.....))..)))))))))....((((((.....))))))(((.(((((...(((((........)))))((((((((((((...........((((((..(((...........)))..)))))))))).)))).))))...))))))))((((((..............)))))).((((((....))))))..)))))).))))..(((((((((((....))))).))))))....))))))))..))).))))))).))....((((....))))........))))))(((...((((((..(.((((((.........((((((((((((((((((........((((((..(((...))).((......))...((((....((((((.....))))))...)))).))))))((((((...(((((((..........)))))))))))))((........)).((((......))))..................(((((..............)))))....((((((((((((((((((((.((((..(((((((((....)))).((((((....((((((((((((((.((((....(((((((.....(((((...)))))..)))).)))(((((((((..((((((.....((((.......))))...))))))..........((((.........))))................)))))))))(((((.(((((.....))))).)))))...)))).)))))))).............))))))...))))))(.(((((((......))))))).)..)))))..)))))))))).)))))).))).))))).))))))))..))))))))))..........)))))))..))))))....)))......)))))))........))))))..........((((((((.(((((...((.....)))))))..))))))))...((((..((..((...(((((((.....)))))))))..))..))))....(((.((((....))))..)))........))))))).)))).....))))))))))))))..))))))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,........,,,,,(((((({{{{..,..,{{{((,(((({,,{{{((,{{({,,..{,,{{((((.....,||||}({,...}}}}})}},|,,,{((((({,,..}}}}}}},..(((((((((...)))))))))...||||,,|||||,|||,||,.....{{{({{..(((((((..........)))))))..,,.{{{({{..{|,,{{{{(((((((.(((,((({{....(((({...(((...((((......))))...))),,,,,,)}}))....))))))((,(((((((.{(.{.{,(((({(((((((((((((((((((((..{{,,....,|||||((((....(((.((((({.......((((.(.(((.....((((.....)))).....))).).))))...,|})))).))}...}}}|{{{{{{{{.||,,||{{,,,.{{{{...})}}.(((((.(((((..(((((....((((.....((((..((((((.(.....).)))))).))))....))))..)))))..))))).)).)))......,,,.{(((..((((.((....)).)))).)))},(((((((((,,,..((((((((((((((.(((((.((((({(((..{{.(((((((....))))).))}}..})))})........))).)))))))))))....))))))))((((((((((..((..(((.....})),.))..)))))).))))....)))))))).})})))))).)))))))}))))).))))))}})))))))))|||||{|{.{.(((((((((((((((((.((({.((((.{,.{((((((((....((,...,)}..))))))))}....|{{||{.....||}}||(((.(((((...(((((........)))))(((((((({{{,......{{,..((((((..(((,........,,)))..)))))),})),))))}}))}...))))))))||{{|{.,..........,.||}}|}.((((((....))))))..}})))),))))..(((((((((({....}))))})))))).,,,))))))))..)))}})))))}.)).}}}}|||.}}...{|{{..{{{.|||||,{{{.,.((((((,.(.((((((.........((((((((((((((((((....,...{(((((..({{...||}.((,{{,,,,....,{{{,,,,{(((((.....)))))|...}}}},}}}}))|{{{{{...(((((({..........})))))))))))}((........)).||{{......)))),,...,,{{{......}}||{{{..............)))},....{((((((((((((((((((((((((..(((((((((....)))).((({{{.,,,((((((((((((((.((((...,{({((({..,,.(((((...))))).,)))).})}{((((((((..{(((((.....((((,....,,)))).,.}}}}}}...,,.....,||,........,}))}................}))))))}}(((({.(((((.....))))).}))))...)))).)))))))).....,,,,,,,,}}})})...}}|||}{.{((((({......))))))).),,)))))..)))))))))).)))))).))).))))}.))))))))))))))))))))..........))))))},})))))).}..)||{{{...))))),|||.{{.....}}.,..,.......((((((((.(((((.,.{{.....)})))))..))))))))...,((({{.{........).))))})))})))),.)))},,}))))))))))|,.,|||......)),..)))}))....,|||}}},,)))}....,||}|||}}}})))),.))))))})))))))...
Back