Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0002100
Sequence Length
1386 nt
GC Content
0.4214
AACUGCAUGUUGGGUAAAUUCAAAACCCACAUGCUCGUCCUCUUGCAGUGGAAUAAGUCACAUCUGAUGGACAUUUUCUGUGCUUAUAGCAUAGUAAUGAACGUCUGACAGGCGCGACCUUUCAUAAGACAACCCACACUAUUGGCUUUCUGCCCAGAAUAUUGCUGCAACACUAUCUGUGAUUGGUUAUCUCUCUAUCAUGCAUUGCUUCACAAGGGGAAACGGCCCCUUUUUUUAAUAAAUCUACGAUGGCUGGCUGCAAUAUGCCUCACUGUAAGUAUUUUGUGUAUGUAUGUGUGGGAGAGAGAGAGAGAGGCUGACUUGAAUAUUACUUAGUCUGGUAUCACAUGGCAAGGUUGUGAUACUGUAGGACAUCAGUGAAGUGCUACUUAGUAAAUCUUAACCUAUCUCUUUUUUCUACAGGUUGGUACUAAGAAGUGCCUUUCCUGACGUCUCUGCUGCUUGGAACCGCUUCUAGAGCAGUCUCUGCUUUUGCCUUGCUUGCUGCCAGCUAGACUGUGACGACAGCACAUCCACCCUCCACCUCUAGCCCAGACACCCCCAUUUCUACUUAUAAUCAAGAGAAAAGCUCUAAGUAUCUGGCAUUGCCCUAGGCUGCUUUAGUGUUAAAAGAAAAGUUUGCUGAAAAAGUAAGAUAUCUUCUGCCAGGAAAUCAAGGAGGAAAAAAAAAAUCAUUUUCUCGAUUUUGCUCUAAACUGCUGCAUCUGUCUAUGCCAAACUAAUCAAUACCGAUUGCACCACCAAACUCCAUUGCAAAUUCAGCUGUGAGGAGAUUCCCUUUCAGACAACUUUGCUGAAAGCAGCUUGGAAAUUCGGUGUCGAAGGGUCUGCCACGUUUUCAUGCUUGCAUUUUGGGCUCCAAAUUGGCACUGGGAAGGGGUUACUGAGAGCACAAGGCUGAUACCAGGCCCUACUUUUAAACGUUCAUCUACUUACAAUCCUAGUAUUUCUCUAAAAACCAAAACCUCUUUGAAUUAACAGUUUCAUGCUGUGAAUUUCUAGUGGGAGAUCUUUUCCUUGAUAUUGACGACACAAUUUUCCAUGUACUUUUAAAGCAGGGAGUGGGGAAAAGUAUUUUGAGGGGACAUUUUCAUCAUCAGUUCAGCUUUUUUUUUUUGGUUGUUGCUCUUUUUUGGGGGGGUUGGGUUUGUUGGUUUCACUGAAACAUUUAACUACCUGUAAAAUCUAAACAUGGCUGUUAGUGUCACACCAAUUCGGGACACAAAAUGGCUAACACUGGAAGUAUGUAGAGAGUUCCAGAGGGGGACUUGCUCACGGCCAGACACGGAAUGUAAAUUUGCACAUCCUUCGAAAAGCUGCCAAGUUGAAAAUGGACGAGUAAUCGCCUGCUUUGAUUCAUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-367.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -394.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 334.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.((((.........))))))))))..((((((((.(((((((((...........((((..((((..(((((((...))))))).))))..)))).(((((((.(((((((((..(((((((((((.......(((.....)))(((.......)))((((((.....))).)))....(((((((.((((((((.....(((((((((......)))))..............((((.(((..(((........)))))).)))).......)))).....)))))))).)))))))((((((((((((.((((.......((((.((((((.((...((((((((.........(((((((.((((.((((((((.(((((((....(((((((...............)))))))))))))).)))))..))))))).))).))))....(((((....)))))((((((...))))))..)))))))))).)))))))))).((((....))))...........(((.((((............((((((((((.(((.......((((.....))))((((((.(((.((((..(((((((((((((((.........((((((..(((((..((...((.(((((((..((((((..(((((((.......((((((........))))))((........)).((((......)))).....(((((......)))))..........)))).)))....)))..)))..))))))))).)))))))..)))))))))).)))))))))))....(((((((((((((((((.((((....(((((((.....(((((...)))))..)))).)))(((((((((..((((((.....((((.......))))...))))))..........((((.........))))................)))))))))(((((.(((((.....))))).)))))...)))).)))))))....)))))))))).....))))...))).))))))...)))..))))))))))...........)))))))...........)))).))))))))))))...)))..)))).)))).....))))))))).))))))).)))))))))....((((.((.....)).)))).......((((((((.(((((...((.....)))))))..))))))))...((((((.(........).))))))))))))))........(((.((...((((((((........))))..)))).....))))).))))...((((((.(((((......)))))...))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((,,((((.........))))))))))..((((((((.(((((((((.,,......,,((((..((((..(((((((...))))))).))))..)))),(((((((.(((((((((..{(((((((({,......,(((.....}}}{{(,,....{|,|((((((.....}}}.})),...(((((((.{(((((({,((..(((((((((......))))),........,,,,.((((.(((..(((........)))})).)))).}.,..,}))).,.)))))))))).))))))|((((((((((((.((((.......,(((.((((((.(({,.((((((((.,.,,..,.(((((((.((((.((((((((.(((((((....(((((((...............)))))))))))))).))))).})),)))).))).)))),{{{(((({....})))}||||||,..)}))}},.)))}))}})).)))))))))|.{((({.,.,,})},,........(({.{(((...,........((((((((((.{({......,{|||,,..,||}}{(((((.(((.({{(..(((((((((((((((.........((((((,{(((({..{{...({.{((((((..((((((,{({{{(((,,,....{{{{{{..,,,,,.))))))((........)).((((......)))).....{((((......))))}..........}}}}.})),,..,},..))).,)))))))}}.})))))).,)))))))))}})))))))))))....(((((((((((((((((.((((...,{({{(({..,,.(((((...))))).,)))).})}|((((((((..{(((((.....((((,....,,)))).,.}}}}},...,,.....,||,........,}))}................}))))))}}(((({.(((((.....))))).})))),..)))).)))))))},..,,)))))))).....)})}...))).)))))}....}),.))))))))))....,......)))))))...........)))).)))))))))))),..,))))))}}.,,,,.,,,}))))))))).))))))),)))))))))....,,{{.{{.....}).,,,,.......((((((((.(((((.,.{{.....)})))))..))))))))...((((((.(........).)))))))))))))).......,(({,{{...,(((,(((.....,,,)}}),,,}},....,)))}}.))))...(((((({(((((......))))),}.))))))....
Back