Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0003300
Sequence Length
1514 nt
GC Content
0.3930
AGCAGUCUCUGCUUUUGCCUUGCUUGCUGCCAGCUAGACUGUGACGACAGCACAUCCACCCUCCACCUCUAGCCCAGACACCCCCAUUUCUACUUAUAAUCAAGAGAAAAGCUCUAAGUAUCUGGCAUUGCCCUAGGCUGCUUUAGUGUUAAAAGAAAAGUUUGCUGAAAAAGUAAGAUAUCUUCUGCCAGGAAAUCAAGGAGGAAAAAAAAAAUCAUUUUCUCGAUUUUGCUCUAAACUGCUGCAUCUGUCUAUGCCAAACUAAUCAAUACCGAUUGCACCACCAAACUCCAUUGCAAAUUCAGCUGUGAGGAGAUUCCCUUUCAGACAACUUUGCUGAAAGCAGCUUGGAAAUUCGGUGUCGAAGGGUCUGCCACGUUUUCAUGCUUGCAUUUUGGGCUCCAAAUUGGCACUGGGAAGGGGUUACUGAGAGCACAAGGCUGAUACCAGGCCCUACUUUUAAACGUUCAUCUACUUACAAUCCUAGUAUUUCUCUAAAAACCAAAACCUCUUUGAAUUAACAGUUUCAUGCUGUGAAUUUCUAGUGGGAGAUCUUUUCCUUGAUAUUGACGACACAAUUUUCCAUGUACUUUUAAAGCAGGGAGUGGGGAAAAGUAUUUUGAGGGGACAUUUUCAUCAUCAGUUCAGCUUUUUUUUUUUGGUUGUUGCUCUUUUUUGGGGGGGUUGGGUUUGUUGGUUUCACUGAAACAUUUAACUACCUGUAAAAUCUAAACAUGGCUGUUAGUGUCACACCAAUUCGGGACACAAAAUGGCUAACACUGGAAGUAUGUAGAGAGUUCCAGAGGGGGACUUGCUCACGGCCAGACACGGAAUGUAAAUUUGCACAUCCUUCGAAAAGCUGCCAAGUUGAAAAUGGACGAGUAAUCGCCUGCUUUGAUUCAUUGAAAGUGAGUAACUAUUAUAUUCUUUUAAGGAUAUUCAAUGAUUGAAUGAGGGGUAUAUGGACAUACAGUUCUCUGCAUAUGGGAUUAUGGAUUGCUUUGUUCAUAGUUUAGUUAUACAGUGUGUUGAUGAUGUUGGGCUGGGGAACUUUACGAGAAGCAGUAGAAUCAAGUCUGGCCAAACUUUGUUAUGAAUAACUUUAUCAGUCCUUUCACUGCAUGUUUUUUUUUGCUAGGGCAGAAAGUGUUGACAUAUUUUUCACUUAGUAAUGGCAAAGUGUCUGUCUGUCCCUGGAAAUGGUAAAUGUAGCUACCUGUGAGUGUUUAGCAUAUGCAUAUAUUAUAUAUAAGGCCAUGGCAAUAGCUGAAUGAGGAUGAUUUUUAUUUGUUGGUAAAGGCAUUGUACAGUUGCAAAAGAGAAGCAGAUUUAAAAUCAGCUAAACUUGGAUAGACUUUUUACUCUUUUAAUAUUUUGACAUUUUAGAUUUUCUUUUUAUUUUGUGGGCAUUUUAUUUUCAGGCCAGAGCCACGCAUUUUAUGGAAAAUGUAACUAGAAGUAAGGUGCUGAACUGCUGCUACAGCACCUUACCUGAGGCACAAACUUUGUUGCAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-371.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -405.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 391.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...)))))(((((((((((.((((..((((((((((((((((.((((.(((((...(((.........(((...((((((((((.(((((((..(((((((.(((((.....((.((((((...(((...)))(((((((((((((.((((....((((((.....))))))...))))..((((.((((((...(((((((..........)))))))))))))((........)).((((......)))).(((((((.(((..((((((.(.((.(((((.......((((....((((((((((((((((((((.((((..(((((((((....)))).((((((....((((((((((((((.((((....(((((((.....(((((...)))))..)))).)))(((((((((..((((((.....((((.......))))...))))))..........((((.........))))................)))))))))(((((.(((((.....))))).)))))...)))).)))))))).............))))))...))))))(.(((((((......))))))).)..)))))..)))))))))).)))))).))).)))))(((((..........))))))))).....))))))))))))))..))))))))))............((((..(((((.........))).))..))))(((((...((.....)))))))....))))))))))).)))))).((((.(((((((.....))))))).)).)).)))))).))(((.((((....))))..))).......((((....))))......((.(((....))))).)))))..))).))))..)))))))......(((((((....))))))).........))))).)))))...))).(((((((....)))..)))))))...)))))))))))).)))))))))))))...)))).((((.((((((((.(((((((....(((((........)))))......))))))).)))...))))).)))).........(((....((((...((((((........))))))...))))..))).............))))).))))))(((....((((..((((((((((..(((((((((((.(((((.((.((....(((((.......)))))..)).)))))))...)))))...(((.((((.((((((((....)))))))))))).).)).((((((((((((((.(((((((((((.........(((((.(((........)))))))).........))))))))))).)))))).)))))))))))))))))))))))).))))..)))(((((((....)))))))..((....(((((((((((...........)))))))))))...))((((((...))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((...))))){((((({{(({.{(((,,((((((((((((((((.((((.((((({{{{{{,{,.,.((((((,.(.((((((.........((((((((((((((((((....,...{(((((..({{...||}.(({{{,,,,....,{{{,,,,{(((((.....)))))|...}}}},}}}}))|{{{{{...(((((({..........})))))))))))}((........)).||{{......)))),,...,,{{{......}}||{{{..............)))},....{((((((((((((((((((((((((..(((((((((....)))).((({{{.,,,((((((((((((((.((((...,{({((({..,,.(((((...))))).,)))).})}{((((((((..{(((((.....((((,....,,)))).,.}}}}}}...,,.....,||,........,}))}................}))))))}}(((({.(((((.....))))).}))))...)))).)))))))).....,,,,,,,,}}})})...}}|||}{.{((((({......))))))).),,)))))..)))))))))).)))))).))).))))}.))))))))))))))))))))..........))))))},})))))).}..}|{(((...))}}}.,,{.{{.....}}.,,.{(({....((((((((.(((((.,.{{.....)})))))..))))))))....)))).(((((((((((({{{(,,,,.|||}}{(((((,{({{,{{...,(((,(((,....,,,)}})}},}},....|||}}}.,|||.,...|||,{||||},,,,}}}.}))}){||{{{{...,)))))),,{{{.,(((((((({......|{((({|...}))))}))))))))))})}........,)))))))))))})),...)))))))))))),}))))))))))))...}|||,{{{(,(((({(({.(((((((....(((((........)))))......))))))).})).,,))))}.}}}}|}..,||{{({......)))).|,|.......,{{{,{{|}}}|{(((((..,,.,,,,}},,},)))))))).)))))}(((,...((((..((((((((((,.{((((({{{{{.{((((.(({({,.|||{,{|}.,,,,.,,}}}|}}}.}||}}}}|..||}}}{,,{{(.(({{.{{{|||{|,...)))))))))))).),},.{{((((((((((((.((((((((((({,,..,,..{{(((.(((........)))}))}}...,}}),.,)))))))))).)))))).))))))},)))))))))))))))).))))..)))(((((((....)))))))..,{,,..(((((((((((..,....,.,.))))))))))),,,,}{{{{{,...,))},))..
Back