Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MBNL1_0004800

Sequence Length

690 nt

GC Content

0.2942

AAGACCUGCUUCUACAACAUUUGGAAACAUUGUGAAACAUUACUAUUCAGUUGCUAUUUUUCCAUCUCAAAAUAUUUUUUUUUAGUUGCUGCUCACUUAUGGCCACAGAACAGUCCCUUUUUGAGUAAAGCAGCAAGGUUGCUUAAUGACAUGCUAUGUGGUUAACAAGAUUCAACUGCCACAUCAAGGACUUUAAAUAAUUUCAAGAUUUUAAAUGUAUUUAUGAAAUGAACUCAUUACAGCAGCUAAUCAAUGCAAACUUUGUCCUUUUUCUUUGUCUUUCUAAGAGAAACUGAAUUUAAUUUAAAUUUAAAUUACAGUGUCUAAAACUUGGUAAAAUAUUUUAAAUUUGAAUAAGAGGAAAAAAAAAACAUGAAUUUAUUUAUGAUGGAGCUUCAUACCCAGGACAGUAGCUUCUUAAAUGUUAGUAAAAUAAUUAUGUUAAGCAUUAAAACAAUUUUGAAUAUGUAAUUAAGCAUUUAUGUUAAAAAACAUGUUUCUUACGUGUGUGUGUAUAUAUUUAUAACUGACACAUGUGAUUCUUUGUACAGUAUUUAGAAUCCUUCCCUUCAGAUAGCAGUCCUCUUGUAUUCAGUCUUGUGGCUAAAAUAGAUCAAAAACAUAUUUUAAAACUGUUAAAGUAACUGUAUGACUCAUGCUUGAAGUUCUGAAAUUUGGGAGCGUUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-118.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -137.18

Frequency: 0.0000

Diversity: 241.20

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((..((((((((.........((...(((((((((....((..((((((((....(((((((.(((.((((((((((.....((((((((((.(((((.((..((......))..))...)))))..))))))..(((((((((((((......(((((((...............)))))))...............((((((((((.........)))).))))))....)))))).))))))).......((((...))))...(((((((.(.....).)))))))(((((((((((.......))))))).))))......))))....))))))))))...........))))))))))...))).))))).)))))))))))...)).........))).))))))))(((((((((.............((((...))))............((((((((..((.((((....)))).))..))))))))...((((((((...((((....))))....))))))))((((((..(((...)))..))))))..((((...((((..(((..(((..((((..((((..((.(((..(((((....((((....))))....)))))..))).)).....)))).))))..).))..)))..))))))))))))).))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(,({.,(((({((..,,,...{(({{,{{{,(({,,..,{{{,,{({(({{{{,..{((((((.{({.{{({....,,,,,,.,{((((((((.(((((.((..{{......)}.,},...)))))..)))))))}(((((((((((((..,.,,(((((((...............)))))))..,}.,.........(((((({(({.........}})).))))))....)))))).))))))).......{{,....}}}|..,{((((((,,.....|.})))))}|{{|{{,,{,({{{{{{{|||||}|,}}}|.,||....,}})),}}..,,.)))}}}}})))}}.)))))))))}...}}|{||||,...}}}}}),,((((({.,...,....},..}.)))))),,,{{{|{|,,|,,..,,.}}||||,.,}}}},.......,.,}|||||{||,,|,.{{||...,||||.....)))))))},,.((((((((..{((((....)))),}..))))))))((((((..(({...}))..)))))).........}}|.}}|}}}}.}({{(({,,.((((....)))}..,,,{{.,,,...,,.{{||||{,..,,.))}})))}..,||,||,.,}|}}}.,,|,{{{||.,..,.},)))))},)}))))