Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MBNL1_0005000

Sequence Length

671 nt

GC Content

0.3458

GUAAAUGAACAACUAAAGCACUCAAAAUCAGUAAGGCAAACAAGUAUCCAGAUGGUCACAUAUGGAUUGGAUGGCAUAACUAGACAUGAUAAAGUAGUCCCAAAGGUGGUUAUAGUUAAAUUUUAGAAGAUCCUCUGUUGCUAGCAUGGUUUAUCCUCAAUCCAGAAAUUGCCUGUGUUGCUGCUGUUCUAAGCCCCAAGCAUAGACUUUUCAUCAUAUUUUAAAAACCAGUUUCACUGAUAAUCCUGAUAAAAUAUCUGCAAGUUUUAGACUAAAUAUGCAAUUUUCAAUUAAAAUUUUGAUCUAUUAGGGUCCUAACUGGAAUCACUGUUACCAGGAAGUUUUUUUGUGGUUUGAUUUUUAACCACUGGUAUCUCCCAUGUAUUAAAACUUUGACAGAUUAUUAUAUAUACUGUGCUGGCACAUAUAUUCAAUGUGUCUUUCAGUGACAGAUUGACAUAUCACUUCCUUGUUUUCUCCUAAUAACUUAGGAGAUGAACUAACUAUAAGGCAUAACCUGCGCAGCAGUAUGUUUCAUAUAAAAGGUCCCUAAGGAGAAACUUCACAACUUUGUAAAGAAUAUCCUGUGAAUAUGCUGCAGUGUCAUCAACUCUGACAUAAACCUUUCUUUAAUGAAAUUCUCAAUAGCUGCAGUUGCUUUGGUGAAACUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-142.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -156.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 120.00

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(....(((((((((..............(.((..((...(((((.(((....))).)))))))..)).).......(((((......)).)))(((....)))(((((((((.....((((......)))).((((((((((((.(((....((((..((((..(.(((((((...(((......)))....))))))).).))))................((((...))))...(((((((((.......((((.((((......)))).))))....((((........))))..))))))))).....(((((((....))).))))((((((((...((((((........))))))(((......)))......))))))))....)))).....))).))))))))))))...(((((((((.((((.......)))).))))).)))).........((((((((((((....)))))))).)))))))))))))........((((((.((((((((((.(((..............((((....(((.(((....))).)))....))))))))))))))))).((((((.......)))))).....((((......)))).........)).)))).)))))))))....)..

Thermodynamic Ensemble Prediction

......{....((((((((({{,.....,(((..(.((..((,..{((((.(((....))).)))))))..)).).,.}}}.||{.,,.....||,}}}{{{..,,|}}(((((((((.....,{({......}}}|.{(((((((((((.(((....,,,,..((((..{.((((((({..(((......)))..},))))))).,.))))................((((...})))...{{(((((((.......((((.((((......)))).))))....((((........))))..))))))))),{,..{{||{,,..,,|||.}}}}{{||{{{,...((((((........)))))){((......))}.,....})))))))},}})}},.....))).)))))))))))),,.{{{{(((((.((((.......)))).))))).)))}.........((((((((((((....)))))))).))))))))))))}.{{{....,}||,{.((((((((((((((..............((((....(((.(((....))).)))....))))))))))))))))).((((((.......)))))).....|{{{......)))}.........))))})),}))))))))....}..