Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0006000
Sequence Length
411 nt
GC Content
0.3990
UAAGAAAUGCCUGACACGUAGUAGACUGACUAGAAGUGUACAUUGAAUGUUUGCUGGUUAAAGGAAUGGAACAUGGACUUCACUCAUAGAGACCUUACUAUUUGGUUGAAGAGAUAAUGCAUACACAUGUGACAUGAAGAUUUUAAAGGGAAAAAAAUUAAAAUAAAAAAACUUUUUGGGAAAAAAAUUCACUACAUAUGGAUAUAAAUAACCUGAAUGGAGGAUACUUGUGGAGAGGUGGGCCGUUGCUCCAGGGAGAACUGCAAAUAUCUUCAUCCACCCCCACAUUUAAAAACGCAGUUGGAGAUAAAUGGACGCAAUAACUUGAUUCAGCAGAAGAACAUGGCCAUGUUGGCCCAGCAAAUGCAACUAGCCAAUGCCAUGAUGCCUGGUGCCCCAUUACAACCCGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-80.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -87.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 73.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((......)).)((((..(((.(((.......))).))).......(((((((((........((((..((((..((((.(((.....((((.........))))...))).......(((..((((((...((((..((((((((((.....................))))))))))......))))...))))))..))).......((((((.(((......(((((.(.(((((((.(((.(((....)))))).))............))))))))))).........((.(((...........))))).....))).))))))..))))..)))).))))......)))))))))(((.((((.((.........)).)))))))............))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((......)).)((((..(((.(((.......))).))).......((((((((({{{,....((((..((((..((((.(((.....((((.........))))...)))....,..(((..((((((...((((..((((((((((.....................))))))}}}},,,...))))...))))))..))).......((((((.(((..,,..(((((.(.(((((((.(((.(((....)))))).))............)))))))))))..,,.....{{.(((.,.......}.}}))).....))).))))))..))))..)))).)))).})}},)))))))))((,,((((.{{.,.......}).)))))))............))))
Back