Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0007200
Sequence Length
553 nt
GC Content
0.4882
CAGUCACUCAGGAAAUGUUGUUUAAGGGGAACCUUCUGGAUCCUUUUCAUGGCACCAUGGCAAGAAGAAGCUGUAUCUUAUCUAUGGAAGAUAAAGCAUGGAGUUGGCUAAUGGAUGCUGAUAGGACCAUCUAGUUGCAGGAAAACAAGCUCAGGGCUCCCACUGAUUCUACAUUAUGGGCCGUUGCUCCAGGGAGAACUGCAAAUAUCUUCAUCCACCCCCACAUUUAAAAACGCAGUUGGAGAUAAAUGGACGCAAUAACUUGAUUCAGCAGAAGAACAUGGCCAUGUUGGCCCAGCAAAUGCAACUAGCCAAUGCCAUGAUGCCUGGUGCCCCAUUACAACCCGUGCCAAUGUUUUCAGUUGCACCAAGCUUAGCCACCAAUGCAUCAGCAGCCGCCUUUAAUCCCUAUCUGGGACCUGUUUCUCCAAGCCUGGUCCCGGCAGAGAUCUUGCCGACUGCACCAAUGUUGGUUACAGGGAAUCCGGGUGUCCCUGUACCUGCAGCUGCUGCAGCUGCUGCACAGAAAUUAAUGCGAACAGACAGACUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-157.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -168.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 131.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((...(((((((((((((((.((....)).)))))))...(((((((.((((.......(((.((((((........)))))).)))((((.((((((((.(((..(((((((((.((((....((((..(((..((((..(((..(((((...............(((((....)).))))))))..)))((..((((((((..........................))))))))..))..........)))).))).))))......)))))).))))))))))((....))...)))))))).))))..)))))))))))............((((...((....))...))))...........((((((......((((.((.(....(((.((..((((((((.((((....))))..)))))))).)).)))...).)).))))......))))))((((((((..(...)..))))))))...(((((((...))))))).(((..........)))))))).)))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((...(((((((({((((((.((....)).))))))}...(((((((.((((.......(((.((((((........)))))).)))((((.((((((((.(({{(((({..,{{,,||||||{((((,,{....{,{{|,,{{,,{{{|,.{(({.,{....,,,((,(({{{{||{{{{,,,,,.,|||(...,,,,,,,,.....................}}})}))))),},,,))}.}.)},,...,,),,))}),,,..,....,||{{,,,,)))))}}}}...}})),.)))))))).))))..)))))))))))............((((.,.({....}},||))))...{{...|,.{{{{,{{,....((((,{(,,....(((.((..((((((((.((({....})))..)))))))).)).)))...),}).)))).....,}}))))((((((((..,...}..))))))))...((((({(...))))))),|||..........))})))))}}))..))))))
Back