Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0008600
Sequence Length
625 nt
GC Content
0.3568
GUAGUCCUAACAGGUAUUGCAGUGAUUUGGCGUGGUAUAUCAAAAGCCAGAGACACUGGUACCUUGUAUUAAAACCCUGGAUAUUGUGUGCUGGCACCUGAAGGAAGGUUGUUUAGAAAACUUAAACUGAGAGUAAAACUCAAACCAAGUGUUUCCGUGAACAUUUGUGUCUUCUUAAUUUGAAAAAGGCCAUGUAUUAAACCAGUGCUCCUGUCAGUGUGGAACUUUCUGGUUUCUCAAGAAGAGUCUCUUAAAUUAAGCACUAAGUUAAUAUUACACAUUUAAACAUUUUCGCUUUCGAAAACAUACAUUGUUGUGAAAGUAAAAUAUUAAAUGUAGAGAGAAAUUAUCACUUACACGUGUACCUUAUUUUGUAGACUAUAGAGUCCAUUUGUGCUAUUAUUAUUUUCAGAUGUGCCUGUAAAGUGGCUUCUUUUGCUGUUCUUUUCUUCCUGCUCUCUCUGUAUACACAAAUGUCCAUACAGAUGGAAAGGCACACAAAGACACACAGACACCCAUGCUUUUGCUUUUACUGUAAAAGAGUCAUACUAGAGUAGAAAUUACGUGACAUUAAUUCUCUGUAAUUCUCUAUUUCUUUCCUUUCAUGGCUAUGUAUGCCUGAAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-138.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -151.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((...))).)))))(((.....((((((...........(((((..((((.((((((...............)).)))))))).))))).((((((((((((..((..((((((((((......((((...))))..(((((((((((....))))))))).))...((((((((((...(((((.......(((((((.(.(((.........))).)...)))))))........).)))).))))))))))...))))))........((((((((..(((((.(((((((..((((.....)))).)))))))))))).))))))))(.((((((.(((.......((((((....((((((((((((((((((.((.((((((...............)))))).))))))...((((.....((((.((((((((....(((..(((.(((((((..((....))..))))))).))).))).....))))).)))))))...)))).(((((((.......))))))))))).))).)))))))....))))))....))))))))).)..))))..))..)))))).)))).)).....))))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((...})).)))))(((..,,.((((((,.,...,....{((((..{{{{,|{({({..||...........)).)}}})))),))})}.({((((((((((..((.,(((,,,,|||...,{,({{,...,))),.{{(((((((((....))))))))).}}.,,((({{{{{{{...{((({.,,,.,,(((({((.(,({(.........}}}.|...}})))))..,,..,.}.)))).))}}}})})),,,},,})},,......((((((((..(((((.(((((((..((((.....)))).)))))))))))).)))))))){.(((({{{(((.......((((((....{(((((((((((((((((.((.((((((....,.....,....)))))).)))))),..{{{{.,,,,{{((.((((((((....(((..(((.(((((((,,(,...,))..))))))).))).))).....))))).))))))}...}}},.(((((((.......)))))))}))).))).))))))}....))))))....))))))))).),.})})..))..))))))}}})).)),}},.))))))...)))
Back