Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0009000
Sequence Length
773 nt
GC Content
0.3079
AAUACAGACUUUUCCUCCAGGAUGAGUCAUAGAUUUUAAAAAUUAAGAUGAUAUUUACCAUUUAGUCUACAGUUUUGAGAAUGAUAGUUCUAUUGCUUGAAAGAGUUAGAUACCUUCCAAAAGAGAAAAGGAAUGUAAUGGGAGGAGAGAUAGGCAACAGAAAACAAGCAUCUGUCCCUUAUGGAGAAAAAUGUAUUUUUAACAGAUACUAGAGAAUAUAGAAGUUGCUAUAUCAACAAAAAAUUUUUAUUUGCUCAAACAGGUGGAUAAGCCAAUGUGUAUUUACUGAAUAAAUGAGUAUGUGCUAGUGGAAAUCAAUGAGUGAGUGAAUAAGUGAACAAGUAAAUGGAUAAACUCAGUAGGUAACACAUUAUUCUUCCUGUUUAUUAUUUUUAGGAAACAAUACUUAUUUGAAAGUAUUACAAAGAAUUCACUUAAAGAACCCUGGUGAAAUUCCUCAUUUUCUCUUGUGGUAAUAGGCAGUUGUUAUAGUACAGUCAUAAUCUUUUGGUUGUAAUUUAUUAUGUAGGUUGAAUUACUCUACAUUUACAGAGCUUUUGGGAAUCAGGAGAUGAGAAAACACAAAUAAUAAGCAAAAGGGCAGUUAGUACUAUCCUAAAAAUAAACAUUGGCCCAUGUAAUCACAUCCUAAAUAAAAUAAACUGAAGUGGGUUAAGAAAAUUAUAGCGGUUUAGAAGAAUUUAGUGUGUUUUCUAGCCCCAUUUUCAUUUGAUUUUGAUAGUAAUGAUUAUUAAAGGAAGACAGAGUACUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -165.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 265.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.(((((.(((....))).))))).................(((((........))))).((((((..((((((((((((....)).))).)))))))..).)))))..(((((............(((((.((((((.(((.((((..((............)))))).)))....((..(((((.....)))))..))....((((((((((((...((((......)))).........(((((((((......)))))))))((((((((.(((((...((..(((((((....((((((.((...((..((((((((((((((((((..........(((......)))........))).))))))((((((...........))))))..(((((((......))))))).......)))))))))..)).))))))))......)))))))..))((((((((((((....)))))))..)))))..((((((....))))))..((((((((....(((...(((((((..(((..((((...))))..)))..)))).)))...)))....))))))))....((((.(((....))).))))..))))).))))))))..((((....)))).((((((....(((((((..((((..........))))..))))))).....)))))))))))))))))).))))))..)))))...(((((((((....)))))))))))))).....)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{,.(((((.(((....))).)))))....((((({,...})}}}}|{...,{{{{{|||{,((((((..((((((((((((....}},))).)))))))..)}})))).(((((((..,.,......,..,.,..||||}||,.,((({{((,{{.,.......,,,}}},||||}}}}|}.,,....|(({(({{,...,,,},},.|||,,||||,..|||}}}.}}}}...........|{((((((((((..{{.,|,({{...(((,(,.((((.((((.{.....}.)))).}))),.|}))...}}..}}..)))))))))}}|,,......}}}}}}}.,,,,.}},,}},,,..,}}.|},}||(((((((({{{{...{{{{{{|...(((((((......))))))).....{{{((((((....,....,,))))}}}))),,...,,.,,,,{(({((.(({(((...{({{({(((((,,.,,...(({{{{|,||||.,{{{,,,(((({{((,...,,||,||}}||,..{{,,.{{||||..,}}}})))).}}}...,,}..,,)),)))).}}}}}||,.,{,..}})))}),,,.......}))),,.)))..}|}.}}}))}}}}|}}}.,.}}|}||}{((((((((((,{((((({,{{,.,{{(({....})))}..,)}})))))))))}))))}))))}.,,..,||{{{{{{{....)))))))}}))}})}....}},,,,,
Back