Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0012400
Sequence Length
732 nt
GC Content
0.4754
GGCCGUUGCUCCAGGGAGAACUGCAAAUAUCUUCAUCCACCCCCACAUUUAAAAACGCAGUUGGAGAUAAAUGGACGCAAUAACUUGAUUCAGCAGAAGAACAUGGCCAUGUUGGCCCAGCAAAUGCAACUAGCCAAUGCCAUGAUGCCUGGUGCCCCAUUACAACCCGUGCUUUUGUGUUUCAGAAACAAACAUUAUUAAACGAAGCAUUAAACUUCAAGAAUUAGAAUUGAGACUCUAUUAGGAAGUUAAAAAUGUACUAUGAAUAAGCCAAUGUUUUCAGUUGCACCAAGCUUAGCCACCAAUGCAUCAGCAGCCGCCUUUAAUCCCUAUCUGGGACCUGUUUCUCCAAGCCUGGUCCCGGCAGAGAUCUUGCCGACUGCACCAAUGUUGGUUACAGGGAAUCCGGGUGUCCCUGUACCUGCAGCUGCUGCAGCUGCUGCACAGAAAUUAAUGCGAACAGACAGACUUGAGGUAUGUCGAGAGUACCAACGUGGCAAUUGCAACCGAGGAGAAAAUGAUUGUCGGUUUGCUCAUCCUGCUGACAGCACAAUGAUUGACACCAAUGACAACACAGUCACUGUGUGUAUGGAUUACAUCAAAGGGAGAUGCUCUCGGGAAAAGUGCAAAUACUUUCAUCCCCCUGCACAUUUGCAAGCCAAGAUCAAGGCUGCCCAAUACCAGGUCAACCAGGCUGCAGCUGCACAGGCUGCAGCCACCGCAGCUGCCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-210.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -223.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....)).)((((.((..((((...((((((((..........................))))))))..((..((((.(((.(((...((((((.....((((((...((((((...((....)).....))))))))))))..((.((((((............(((......((((((.......))))))......)))..(((((.((((((......((((........))))....))))))...)))))(((..(((((......)))))..))).)))))).))......((((((......((((.((.(....(((.((..((((((((.((((....))))..)))))))).)).)))...).)).))))......))))))((((((((..(...)..)))))))).((((((...))))))))))))..)))...))).))))..))....((((((.(((((.......)))))...(.(((....((((((((.((........)).)))).))))((((..((((...))))..))))...((((((.((((......)))).)).))))(((.....)))....(((((...)))))((((((((((....))))))..))))..((((....))))((((........)))))))).....)))))).....((((((((((.....))))))))))...)))))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((....)).}((((.((..((((...((((((((........................,.))))))))..{(..{(((.{{{.{({..,((((((.....,(((((...((((((...((....)).....))))))))))}|{{((.((((({............,{{{{{,..(((({,..,,,,,|}}}}|,,,,..,,}..(((((.((((((..,,..((((........)))),}..))))))...))))).....,|||||,,...})}}}},.,..)))).},))...}.}}}}}..))}}},((((,{(,.....(((.((..((((((((.((({....})))..)))))))).)).)))...)}}).)))){{{,..||}))}((((((((..,...}..)))))))).{{((((,,|}}}))))))))),,.,,...}}}.))))..}}((((.(((...})}.)))){{{{|||||,.,,}}},....((((((((.((........)).))))))})){{{{.,||||,..}}}}..}}}},,,{{{(({.{{((....,,)))).)),)))),{{.....}}},...{|{{{.,,)))))((((((((((....))))))..)))){{((,......|||{(((........)))))).......)))).......((((((((((.....))))))))))...)))))).)).))
Back