Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBNL1_0014200
Sequence Length
341 nt
GC Content
0.4604
CACCCAGUGUGAUACUACAGAAAAAAAAUGUUAAAUUGGAAAACAGGAAUUCAAGAAUUACUGCAUGUGAUGUUGCUAAUUAGGUAUGUCGAGAGUACCAACGUGGCAAUUGCAACCGAGGAGAAAAUGAUUGUCGGUUUGCUCAUCCUGCUGACAGCACAAUGAUUGACACCAAUGACAACACAGUCACUGUGUGUAUGGAUUACAUCAAAGGGAGAUGCUCUCGGGAAAAGUGCAAAUACUUUCAUCCCCCUGCACAUUUGCAAGCCAAGAUCAAGGCUGCCCAAUACCAGGUCAACCAGGCUGCAGCUGCACAGGCUGCAGCCACCGCAGCUGCCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-97.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -101.52
Frequency: 0.0015
Diversity: 68.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.(((((..............))))).)))))......((.((((..((..(((((((........)))......))))..))..)))).))..(((((((.((((((((((.((........)).))))))...((((..((((...))))..))))...((((((.((((......)))).)).))))(((.....)))....(((((...)))))((((((((((....))))))..))))((((.......(((.(((........)))))).......)))).......((((((((((.....))))))))))...)))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,..(((((.(((({..............})))}.)))))......({.((({..{{,,((({|,{.,,,,,,,|||,,....||||,.}}..}}))}))..{{|||||,|{((((((((.((........)).)))))),},((((..((((...))))..))))...{{{(((.((((......)))),)).)))){{{,....}}}....(((((...)))))((((((((((....))))))..))))((((.......((|{(((........)))))).......)))).......((((((((((.....))))))))))...)}}}.}))))))
Back