Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MBOAT2_0001200

Sequence Length

1467 nt

GC Content

0.3988

UUACUGCUUUGUGUUUGCUCUGGGAUACCUCACAGUGUGCCAAGUUACUCGAGUCUAUAUCUUUGACUAUGGACAAUAUUCUGCUGAUUUUUCAGGCCCAAUGAUGAUCAUUACUCAGAAGAUCACUAGUUUGGCUUGCGAAAUUCAUGAUGGGAUGUUUCGGAAGGAUGAAGAACUGACUUCCUCACAGAGGGAUUUAGCUGUAAGGCGCAUGCCAAGCUUACUGGAGUAUUUGAGUUACAACUGUAACUUCAUGGGGAUCCUGGCAGGCCCACUUUGCUCUUACAAAGACUACAUUACUUUCAUUGAAGGCAGAUCAUACCAUAUCACACAAUCUGGUGAAAAUGGAAAAGAAGAGACACAGUAUGAAAGAACAGAGCCAUCUCCAAAUACUGCGGUUGUUCAGAAGCUCUUAGUUUGUGGGCUGUCCUUGUUAUUUCACUUGACCAUCUGUACAACAUUACCUGUGGAGUACAACAUUGAUGAGCAUUUUCAAGCUACAGCUUCGUGGCCAACAAAGAUUAUCUAUCUGUAUAUCUCUCUUUUGGCUGCCAGACCCAAAUACUAUUUUGCAUGGACGCUAGCUGAUGCCAUUAAUAAUGCUGCAGGCUUUGGUUUCAGAGGGUAUGACGAAAAUGGAGCAGCUCGCUGGGACUUAAUUUCCAAUUUGAGAAUUCAACAAAUAGAGAUGUCAACAAGUUUCAAGAUGUUUCUUGAUAAUUGGAAUAUUCAGACAGCUCUUUGGCUCAAAAGGGUGUGUUAUGAACGAACCUCCUUCAGUCCAACUAUCCAGACGUUCAUUCUCUCUGCCAUUUGGCACGGGGUAUACCCAGGAUAUUAUCUAACGUUUCUAACAGGGGUGUUAAUGACAUUAGCAGCAAGAGCUAUGAGAAAUAACUUUAGACAUUAUUUCAUUGAACCUUCCCAACUGAAAUUAUUUUAUGAUGUUAUAACAUGGAUAGUAACUCAAGUAGCAAUAAGUUACACAGUUGUGCCAUUUGUGCUUCUUUCUAUAAAACCAUCACUCACGUUUUACAGCUCCUGGUAUUAUUGCCUGCACAUUCUUGGUAUCUUAGUAUUAUUGUUGUUGCCAGUGAAAAAAACUCAAAGAAGAAAGAAUACACAUGAAAACAUUCAGCUCUCACAAUCCAAAAAGUUUGAUGAAGGAGAAAAUUCUUUGGGACAGAACAGUUUUUCUACAACAAACAAUGUUUGCAAUCAGAAUCAAGAAAUAGCCUCGAGACAUUCAUCACUAAAGCAGUGAUCGGGAAGGCUCUGAGGGCUGUUUUUUUUUUUUGAUGUUAACAGAAACCAAUCUUAGCACCUUUUCAAGGGGUUUGAGUUUGUUGGAAAAGCAGUUAACUGGGGGGAAAUGGACAGUUAUAGAUAAGGAAUUUCCUGUACACCAGAUUGGAAAUGGAGUGAAACAAGCCCUCCCAUGCCAUGUCUCCGUGGGCCACGCCUUAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-375.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -405.98

Frequency: 0.0000

Diversity: 360.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.(.(((((((...(((.(((.((((......)))).)))))).......(((((((........)))))))(((((((((((((.((((((((((.(((..(((((...........)))))...))).)))))).)))).))).).)))))))))..(((((.............))))).))))))).)...)))..((((((((...(((..((((....))))....(((((((....)))))))(((((((((..((((((((....(((((.(((.(((.((...........)).)))))))))))((((.((((.((...((((((((((.....(((((........(.((((((...(((.........)))....)))))).)((((.(((((((((..(((((((...((((((..(((((((((((........................))))))))..)))..))).))).....))))))).)))))).))).)))).....((((((((((((...(((((((.((((((((......((((......))))..((((.(((.(((((((.((((((((.(.(((...(((.(((...(((((((.((((((....((((.......(((((((......(((((((((((.(.(((........))).).))).......((((((....)))))).))))))))..(((((((((((((((......))))))).)))).))))......)))..)))).......))))..)).)))).))))))))))...)))..(((.....))).((((...))))...........))).).)))))))).)))))))))).((((((.......(((((.(((......(((((((((........))).)))))).......))).)))))...((((.((.(((((...(((((.....)))))..))))))))))).((((.((((((((.............((((.....(((((...((((((((.((((...........))))...))))))))..))))).....))))..............))))))))..)))).(((....))))))))).....))))....(((((.((.(((((((..((((.......))))...))))))).)).)))))..((((.(((.((((((..((((((((((((..((((.(((((((((.....))))))...))).).)))..))))))))))))..))))))))).))))....((((((((((.((((((...)))))))))))...)))))....))))))))..))))))).....))))..))))))))....)))))....)))))))))))).)))).)))).....)))......))))).))))))))))))..))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,.,.((((({(,..(((.(((.((((......)))).)))))).......(((((((,,......)))))))(((((((((((((,(((,((((((.(((..(((((.{{.....,}.)))))...))).)))))).)))).))).).))))))))),,({{{{...,.....,,,,}||||,|}}}))),),.,)))..((((((((...(((..((((....))))....(((((((....)))))))(((((((({..(((((((,...,(((({.{{{.|||,|{...........}}.}})))))}}}}((((.((((.((...((((((((((.....(((((.,......(.((((((...,({...,,....)))....)))))).)((((.(((((((((..(((((((...((((((..(((((((((((..,......,{,....,,......)))))))).,)))..))).))).....))))))).)))))).))).)))).....((((((({((((.,,({(((({,{((((((({{..,,({((,,,,,.,,,|{.|||..|||||,.(((((((.....((((.(((((((..((((.(((({({(({.((((.((((((.((((((.{.(({((((,,..{{{{{(((((({,..,,.......,{{{.{{||..,,,...((((((....)))))).,,)))}},..,||,||||,||||{({{{,..}}}||||.||||.,,}),|.}},}..}}.))})},((((((((,..{{{..{,{((,.((((....)))).(((.....))).{{{,...,}||,,.{{{..{{{{{.,,.})}|},,}}},}|||||,|....)))}.)}}},{{|{|.{{{{,.{{,(((((((((........))).)))))).......)))})))}}..,.))))))))..}},}}||{{{..|}}))},)}|)))))).))))))|||....,,......||,,...,,,...}))),)}}.,))})))).))))..)))))))))))..))))))).}))),}|,{{|||,|||.}}}}||,,....(((((((((.............((({....}))).,((((.,.({{,{{....,)})}),..,)))}...))))))))).,{{{{{.{{{{{{|,.||{{{{{{..{(((.((,{((((((..(((((((((((({(((.{.(((((((((.....))))))..,)),.,))).}}))))))))))))..))))))))).)))}.....,,.,{{{((,,((((....)))))))})})})))))))}}}})),))),,}}))))))).,}}.))))..)))))))}....}))))....)))))))))))).)))).)))).....)))...,,.))))).))))))))))))..))))))))