Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBOAT2_0001500
Sequence Length
1262 nt
GC Content
0.3994
GUCAACUUUGUAGUGUGCCAACUCUUUGCCUUGCUAGCAGCCAUUUGGUUUCGAACUUAUCUACAUUCAAGCAAAACUAGCUCUUUUAUAAGACAUGUAGUUGCUACCCUUUUGGGCCUUUAUCUUGCACUUUUUUGCUUUGGAUGGUAUGCCUUACACUUUCUUGUACAAAGUGGAAUUUCCUACUGUAUCAUGAUCAUCAUAGGAGUGGAGAACAUGCACAAUUACUGCUUUGUGUUUGCUCUGGGAUACCUCACAGUGUGCCAAGUUACUCGAGUCUAUAUCUUUGACUAUGGACAAUAUUCUGCUGAUUUUUCAGGCCCAAUGAUGAUCAUUACUCAGAAGAUCACUAGUUUGGCUUGCGAAAUUCAUGAUGGGAUGUUUCGGAAGGAUGAAGAACUGACUUCCUCACAGAGGGAUUUAGCUGUAAGGCGCAUGCCAAGCUUACUGGAGUAUUUGAGUUACAACUGUAACUUCAUGGGGAUCCUGGCAGGCCCACUUUGCUCUUACAAAGACUACAUUACUUUCAUUGAAGGCAGAUCAUACCAUAUCACACAAUCUGGUGAAAAUGGAAAAGAAGAGACACAGUAUGAAAGAACAGAGCCAUCUCCAAAUACUGCGGUUGUUCAGAAGCUCUUAGUUUGUGGGCUGUCCUUGUUAUUUCACUUGACCAUCUGUACAACAUUACCUGUGGAGUACAACAUUGAUGAGCAUUUUCAAGCUACAGCUUCGUGGCCAACAAAGAUUAUCUAUCUGUAUAUCUCUCUUUUGGCUGCCAGACCCAAAUACUAUUUUGCAUGGACGCUAGCUGAUGCCAUUAAUAAUGCUGCAGGCUUUGGUUUCAGAGGGUAUGACGAAAAUGGAGCAGCUCGCUGGGACUUAAUUUCCAAUUUGAGAAUUCAACAAAUAGAGAUGUCAACAAGUUUCAAGAUGUUUCUUGAUAAUUGGAAUAUUCAGACAGCUCUUUGGCUCAAAAGGGUGUGUUAUGAACGAACCUCCUUCAGUCCAACUAUCCAGACGUUCAUUCUCUCUGCCAUUUGGCACGGGGUAUACCCAGGAUAUUAUCUAACGUUUCUAACAGGGGUGUUAAUGACAUUAGCAGCAAGAGCUAUGAGAAAUAACUUUAGACAUUAUUUCAUUGAACCUUCCCAACUGAAAUUAUUUUAUGAUGUUAUAACAUGGAUAGUAACUCAAGUAGCAAUAAGUUACACAGUUGUGCCAUUUGUGCUUCUUUCUAUAAAACCAUCACUCACGUUUUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-316.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -341.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 252.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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