Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBOAT2_0001900
Sequence Length
1429 nt
GC Content
0.4157
GUCAACUUUGUAGUGUGCCAACUCUUUGCCUUGCUAGCAGCCAUUUGGUUUCGAACUUAUCUACAUUCAAGCAAAACUAGCUCUUUUAUAAGACAUGUAGUUGCUACCCUUUUGGGCCUUUAUCUUGCACUUUUUUGCUUUGGAUGGUAUGCCUUACACUUUCUUGUACAAAGUGGAAUUUCCUACUGUAUCAUGAUCAUCAUAGGAGUGGAGAACAUGCACAAUUACUGCUUUGUGUUUGCUCUGGGAUACCUCACAGUGUGCCAAGUUACUCGAGUCUAUAUCUUUGACUAUGGACAAUAUUCUGCUGAUUUUUCAGGCCCAAUGAUGAUCAUUACUCAGAAGAUCACUAGUUUGGCUUGCGAAAUUCAUGAUGGGAUGUUUCGGAAGGAUGAAGAACUGACUUCCUCACAGAGGGAUUUAGCUGUAAGGCGCAUGCCAAGCUUACUGGAGUAUUUGAGUUACAACUGUAACUUCAUGGGGAUCCUGGCAGGCCCACUUUGCUCUUACAAAGACUACAUUACUUUCAUUGAAGGCAGAUCAUACCAUAUCACACAAUCUGGUGAAAAUGGAAAAGAAGAGACACAGUAUGAAAGAACAGAGCCAUCUCCAAAUACUGCGGUUGUUCAGAAGCUCUUAGUUUGUGGGCUGUCCUUGUUAUUUCACUUGACCAUCUGUACAACAUUACCUGUGGAGUACAACAUUGAUGAGCAUUUUCAAGCUACAGCUUCGUGGCCAACAAAGAUUAUCUAUCUGUAUAUCUCUCUUUUGGCUGCCAGACCCAAAUACUAUUUUGCAUGGACGCUAGCUGAUGCCAUUAAUAAUGCUGCAGGCUUUGGUUUCAGAGGGUAUGACGAAAAUGGAGCAGCUCGCUGGGACUUAAUUUCCAAUUUGAGAAUUCAACAAAUAGAGAUGUCAACAAGUUUCAAGAUGUUUCUUGAUAAUUGGAAUAUUCAGACAGCUCUUUGGCUCAAAAGGGUGUGUUAUGAACGAACCUCCUUCAGUCCAACUAUCCAGACGUUCAUUCUCUCUGCCAUUUGGCACGGGGUAUACCCAGGAUAUUAUCUAACGUUUCUAACAGGGGUGUUAAUGACAUUAGCAGCAAGAGCUGUAAGUAUCAAGAAUUUUAUUUUACAAUUCAAUGGUCCACUUGAACUGUUAAAAAGGCUGAGUACAUCUCUCUUACAAGGUAGACCCUCUUUCCUUGGUCGUGGUCAGUAUUGUCCUUUCCACUAGAAGCGAGGUGUGUACUGCGUGCAUGUUUGCUGAGCGCUCACCACGGGCUAGGCUCCAUGCCCAGUUCCUGUGAGGAGAAAACACGUUUCUAUGUGCCCGGCAGGUAGGAGGCACUCACAAAAUGUUACUUUGUCUUUACAGAAUUUUCUGAAGGAGAGAUAAAAACUGAGUUAAAUAAAGAUGAUCAGAAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-390.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -417.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 313.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((.(.(((((..((.((((((.(((((((((((....)))..............(((((((((((((.((((....(((((.....)))))..))))(((....)))................)))))).)))))))((((((..(((((..((((((....(((((((.....(((((.((((((((((....(((((.((((..((.((((((........)))))).)).(((((((((((((.....(((((((((.......(((((((........)))))))(((((((((((((.((((((((((.(((..(((((...........)))))...))).)))))).)))).))).).))))))))).((((((((((((...((((.((((((...)))))).))))..((..(((....)))..))...((((((((((((((((((....)))))))....(((...(((((((.((...(((((.(((.(((.((...........)).))))))))))).....((((.((((........))))..))))((((((.(((((.((((((...(((.........)))....)))))).)((((.(((((((((..(((((((...((((((..(((((((((((........................))))))))..)))..))).))).....))))))).)))))).))).))))..((((.....)))).....))))))))))))))))))).))))))))))........(((((((.(((((.(.(((((....(((((.....(((((....))))))))))......))))).)))))).))(((((......)))))..((((.(.(((........))).).))))(((...((((((....))))))...))).....(((((((((((((((......))))))).)))).)))).(((.....))).))))).....))))...)))))))).))))..)))))))))))))))).))))))........((((((((((...)))))))))).(((.(((.(((((....))))).))).))).(((((.........)))))...((((.((((....(((....((((..(((.....)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))).......)))))))....)))))).)))))..)))))).....)))).))))(((..((((((((.(((.....))).))..))))))..)))....(((((....)))))...)))))).))..))))).)............(((.(((((.((((....))))))))).)))...............)))))).))))(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.((((((.(.(((((..((.((((((.{((((((((,({,..|||....,.........(((((((((((((.{({,{(({....}}}}..,}}}},,}}},(((....)))..........,,....,)))))}}})))))((((((..(((((..((((((....(((((((.....(((((.((((((((((....(((((.((((..((.((((((........)))))).)).{((((((((((((.....(((((((({.......(((((((,,......))))))){((((((((((((,(((,((((((.(((..(((((.{{.....,}.)))))...))).)))))).)))).))).).))))))))}|{{{,{{,,,||,...{{{{.{(((((...)))))}.}}||,,,,..(((....||}{{{{...{((,((((({{(((((((....))))))},,..(((.,.(((((({,((...(((((.(((.(((.({...........)).))))))))))).....((((.((((.{....,}))))..)))){(((({{(((((.((((((...,({...,,....)))....)))))).)((((.(((((((((..(((((((...((((((..(((((((((((..,.......{,....,.......)))))))}.,)))..))).))).....))))))).)))))).))).))))..((((.....)))).....))))))))))))))))))),))),...........{{{{|{.{,|.,||||}}}}||,....,}}}||.}}))}}}|{|,..{((((((.{(((((....((((,|||,,.|}|{(((,,....|||||{{((((,{.,{{........|||.|.||,.,,,.,.((((((....)))))).,})))}},..,{{{|{{|{|{{{((,.....))}}||}.|}}}.}})}.|.,,.,..}},))))),....))))..))}}))).))))))),})))))))))))))))).)))))}......,,(({{{(({,(,,,|}}}|))))).{||.{{{.(((((....))))).}}}.}}},(,,((,,.....{{|,|||{{.(,,,.,|||}}}.}}}..,,}|,,,,{{|.,,.,)})}}}},,,)))},))))))))))))))))))))))))))))..,....)))))))....)))))).)))))..)))))),}}.})))),}))}(((..((((((((.(((.....))).))..))))))..)))....(((((....)))))...)))))).))..))))).},,.....,{,..(((.(((((.((((....))))))))).))),,,..,,........)))))).))))(......)
Back