Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MBOAT2_0003700

Sequence Length

432 nt

GC Content

0.4236

GGAUGUUUCGGAAGGAUGAAGAACUGACUUCCUCACAGAGGGAUUUAGCUGUAAGGCGCAUGCCAAGCUUACUGGAGUAUUUGAGUUACAACUGUAACUUCAUGGGGAUCCUGGCAGGCCCACUUUGCUCUUACAAAGACUACAUUACUUUCAUUGAAGGCAGAUCAUACCAUAUCACACAAUCUGGUGAAAAUGGAAAAGAAGAGACACAGUAUGAAAGAACAGAGCCAUCUCCAAAUACUGCGGUUGUUCAGAAGCUCUUAGUUUGUGGGCUGUCCUUGUUAUUUCACUUGACCAUCUGUACAACAUUACCUGUGGAGUACAACAUUGAUGAGCAUUUUCAAGCUACAGCUUCGUGGCCAACAAAGAUUAUCUAUCUGUAUAUCUCUCUUUUGGCUGCCAGACCCAAAUACUAUUUUGCAUGGACGCUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-104.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -111.13

Frequency: 0.0000

Diversity: 137.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((..((((.((((((....((((.((((((...)))))).))))...(((((.(((.(((..((..((((((((.(((((...(((((((((......((((((...((((.......(((((......))))).........(((((((..........((...((((.((((........))))..))))....))...........)))))))......)))))))))).....)))))))))))))).)))).))))..)).)))))))))))..........((..(((((((((..(((.....)))..))))).....))))..)).......(((((......))))).........)))))).)))).))))))((.....(((..(((....((((......))))..)))..)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((..((((.((((({....((((.((((((...)))))).)))),,.,{{((,{{{.{{(..((..{({({(((.((((({,,(({{{{|||,,,...{(((({,.,((((,,,,,..{(((({.{{{.|||,|,........{{{||,|}}}}}}}}},,....((((.((((.{....,}))))..))))....||.,,|.|.{{{{||},,}|......}}}}))))}}.,,,,))})||||}|||||,|||}.||||,,|}.}||||||}}|{{{{,,,,,,.,|..,,,,{(({{..{{{.....))),,)))}),,,..)))}}}).....}}}||||{,}}},,})))},,,,...,.}))))).)))).)))))){|....,(((.,(((....{(({......))))..)))..)))))