Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MBOAT2_0003800

Sequence Length

584 nt

GC Content

0.4178

UUACUGCUUUGUGUUUGCUCUGGGAUACCUCACAGUGUGCCAAGUUACUCGAGUCUAUAUCUUUGACUAUGGACAAUAUUCUGCUGAUUUUUCAGGCCCAAUGAUGAUCAUUACUCAGAAGAUCACUAGUUUGGCUUGCGAAAUUCAUGAUGGGAUGUUUCGGAAGGAUGAAGAACUGACUUCCUCACAGAGGGAUUUAGCUGUAAGGCGCAUGCCAAGCUUACUGGAGUAUUUGAGUUACAACUGUAACUUCAUGGGGAUCCUGGCAGGCCCACUUUGCUCUUACAAAGACUACAUUACUUUCAUUGAAGGCAGAUCAUACCAUAUCACACAAUCUGGUGAAAAUGGAAAAGAAGAGACACAGUAUGAAAGAACAGAGCCAUCUCCAAAUACUGCGGUUGUUCAGAAGCUCUUAGUUUGUGGGCUGUCCUUGUUAUUUCACUUGACCAUCUGUACAACAUUACCUGUGGAGUACAACAUUGAUGAGCAUUUUCAAGCUACAGCUUCGUGGCCAACAAAGAUUAUCUAUCUGUAUAUCUCUCUUUUGGCUGCCAGACCCAAAUACUAUUUUGCAUGGACGCUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-147.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -158.68

Frequency: 0.0000

Diversity: 107.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(....)((..((((((((..(((.((((......)))).)))...(((((.(((.....(((((..((.(.((.(((((((((((((.((((((((((.(((..(((((...........)))))...))).)))))).)))).))).).))))))))))).).))...))))).((((.((((((...)))))).))))..((..(((....)))..))..))).)))))...(((((((....)))))))....(((...(((((((.((...(((((.(((.(((.((...........)).))))))))))).....((((.((((........))))..))))((((((.(((((.((((((...(((.........)))....)))))).)((((.(((((((((..(((((((...((((((..(((((((((((........................))))))))..)))..))).))).....))))))).)))))).))).))))..((((.....)))).....))))))))))))))))))).)))............)))..))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(....}((..((((((((,.(((.((((......)))).)))||,(((((.(((((,{{(({{{..,|,|,||,(((((((((((((,(((,((((((.(((..(((((.{{.....,}.)))))...))).)))))).)))).))).).)))))))))}},},}},,}),}},.((((.((((((...)))))).))))..{{..(((....)))..}}..,)).)))))..{(((((((....))))))},,..(((.,.(((((({,((...(((((.(((.(((.({...........)).))))))))))).....((((.((((.{....,}))))..))))((((({{(((((.((((((...,({...,,....)))....)))))).)((((.(((((((((..(((((((...((((((..(((((((((((..,.......,,............)))))))}.,)))..))).))).....))))))).)))))).))).))))..((((.....)))).....))))))))))))))))))),))),,,.........))).,))))).))