Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MBOAT2_0003900
Sequence Length
662 nt
GC Content
0.4139
GUAUGCCUUACACUUUCUUGUACAAAGUGGAAUUUCCUACUGUAUCAUGAUCAUCAUAGGAGUGGAGAACAUGCACAAUUACUGCUUUGUGUUUGCUCUGGGAUACCUCACAGUGUGCCAAGUUACUCGAGUCUAUAUCUUUGACUAUGGACAAUAUUCUGCUGAUUUUUCAGGCCCAAUGAUGAUCAUUACUCAGAAGAUCACUAGUUUGGCUUGCGAAAUUCAUGAUGGGAUGUUUCGGAAGGAUGAAGAACUGACUUCCUCACAGAGGGAUUUAGCUGUAAGGCGCAUGCCAAGCUUACUGGAGUAUUUGAGUUACAACUGUAACUUCAUGGGGAUCCUGGCAGGCCCACUUUGCUCUUACAAAGACUACAUUACUUUCAUUGAAGGCAGAUCAUACCAUAUCACACAAUCUGGUGAAAAUGGAAAAGAAGAGACACAGUAUGAAAGAACAGAGCCAUCUCCAAAUACUGCGGUUGUUCAGAAGCUCUUAGUUUGUGGGCUGUCCUUGUUAUUUCACUUGACCAUCUGUACAACAUUACCUGUGGAGUACAACAUUGAUGAGCAUUUUCAAGCUACAGCUUCGUGGCCAACAAAGAUUAUCUAUCUGUAUAUCUCUCUUUUGGCUGCCAGACCCAAAUACUAUUUUGCAUGGACGCUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-171.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -184.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 124.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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