Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_METTL9_0000200

Sequence Length

1597 nt

GC Content

0.4239

GUGCAUAGGGUGAGGUGUGGGAGGUGGUGUAGAGUUUCUCUUUCCUCUGAUGAGCCACCCAACCAUCAUAUCAAUGUAUUCAGCAAACUAAAAGCUCCCAGGACCCCAUAGUUUAGGGGUGUCAUUACAUAGGCAUGAUUAGACUCAGUCUUCAACUCCUUUCUCAUCCUUGGAGAUUGGAAGGUGGGGCUGAAAGUUUGAACCUUAUACCCACAUCCUGGUCCCCAUCCUGAAGCUGUCUGGGUCUCCCACCCCUAUCAGGAGUCAUCCUGUUAGCAUACAAAAGAUACUCUUAUUACCCUGAGAUUCCCGAAGGGUUUUAGGAACUCUCUAUCAGGAACCUGGGACAAAGAUCAAAUAUGUAUUUUUUAUUAUACCACAUCAUCUAAAAUCAGUCAGUUUUUAAAAUUACUUUCUGACUCUGCUAGUGUGCUUAAAUCCUUUGUAUUUUGGGAAUGUUGUAUUUUGGAUAUGUUGUAUAUCACAUGUUUGAUUAGUUGAUAAACUCCAAAAAUAAUUUCAGAAAAACUUUUAACCAUAUUUGGUCUGAUUAGCAAAUCUAAUUUUAUAGGAAAAUUGCAUUCCUACUUUGAACGAGUGAUUCAUCAACCAAGGUUAUAUAUAAAUAUUAGGAGGAGUUCAUGGGCUUAAUGAGAAAUUUUUUUUUUUUUUUUGACAGUCUUGCUUUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACACUCUGGGCUCACUACAACCUCUGCCUCUCUGGUUCAAGUGAUUCUUUUGCCUUAGCCUCCCAAGUAGCUGGAAUUAUAGGUUCCUGCCACCACGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCUUGACUUCAAGUGAUCUGCCCACCUGGGCCUCCAAAUUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCAUCGUAGCCAGCCAGGAAAUUUUUAAGACAGUAUGACCUAAUAUUUAAUAACUUCGGUUGGCGAAUACUGUCAGACAUGCAUUCAAAACGCGUGGCAGCCACCUGAUUUGGCUGUUUACUGCCUGGCCAAUUAUUAGUAUCUUUGCAGUUGUGUUGCCAGUAGGGAGAAUAUUGCUAUUUACUGUAAUUUUUAGAUAUCACAUCCUGUUCUGUACUUGGCAUCAGCAGAUGACUGAAUGGAAUCAUUCUCAUUUGAUUAGAAUUUGUCAUUUAAAAGAUUCCCUUGUUUAUUUAGAUGAAACAACAUUUGAGUGAGCUUUAAAGGCAGAUGCUAAUAAGAUGCUUUUUCAGACAUGGUAGGCUCCAGCCAAGGAGUCCAGCCUCACAGUAGAGUGGGCGUGUAGUCCUGUCAGUGUGUGAAUUUAACGGGCAUAGUACUUUGUUCUUGCCUGUGCACCUUUGUCUCUGUAGUCUUUAAGGAGCACACAUUUAAAGAACUCACCUGCGGCUGGGCGCAGCGGCUCACGCCUGUAAUCCUAGCACUUUGCGAGGCCGAGGCAGGCAGAUCACCUGAGGUCAGGAGAUCAAGACCAGCCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAAUUAGCCAGGCGGGGUGGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-613.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -635.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 280.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.((.(((((((.((((((((.((((((.(((((..........)))))....))))))........................((((((...(((.((((..(((((........)))))(((........))).(((..((((...)))))))..(((..((((.......))))..)))...)))))))...))))))...))))))))..)))))))(((((..((((((........((((.....))))(((.(((((....))))).)))........(((...(((((..(((((..(.....)..)))))..)))))....))).))))))....)))))...((((((((((((.........(((((.((((.((((((((((((.((.((((((((((.((...........((......))...........))))))))))))))))).))))))))))))).)))))..))))))))))))((((....))))......((((((((((....((((.(((((....(((((.((((.((((..((........((((((.......))))))........)).)).)).)))))))))))))).............(((((.......((((.....(((((.................(((((.......)))))((((((...((.((((....)))).))))))))(((((..((((...........))))..))))))))))..))))...))))).))))..))))))))))..)).)((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((..(((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((......(((((.(((...........((((((((...(((((..............)))))...))))))))...(((((.........)))))(((((((.......)))))))...))).))))).........(((....))).(((((((((((.((((((((...(((((........)))))...(((((.((((((.(((.((((.....((((((..(((((((..(((((....))))))))))))(((((.(((((((.((((((..........(((((((((((((......)))))))))))))))))))))))))).)))))..))))))....)))).......(((....))).((((.(.(((((.(((......)))))).)).).))))..))).)))))))))))(((((((.((.((...)).)))))))))....(((((....(((..(((....)))..)))....)))))..))).))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))).)))..)))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.((.(((((((.((((((((.((((((.{((((..........))))}....))))))...,,,||{{.,,.,|||,...,,({{{{{...{|||(({,,.(((((........))))){{{........)}},|||,,(((({{{||||||,.{(((..((((.......))))..))}.}.})))))),..})))))...))))))))..))))))}(((((..((((((,,.,.,.{((({..,..)}}}(((.(((((....))))).)))........{{|...(((((..(((((..(.....)..)))))..)))))....,,,.))))))....)))))...((((((((((((.........(((((.((((.((((((((((((.({{(((((((((,,((.....,,....((......))...........)))))))))))))}})).))))))))))))).)))))..))))))))))))((((....))))......((((((((((....((({.{{(((,...{||||.{(((,{{,,..,|,,,,,...((((((.......)))))),,,,|...||.,,....}))}}}))))))}}.............(((((.......((((..,,.((((((......,,}},,....(((((.......)))))(((((({..(,.((((....)))).))))))))(((((..((((...........))))..))))).,,,}..))))...))))).})))..))))))))))..)).)((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((((..(((.((((((((((.(((((((((((((((((((((((...,,.{(((({((({..........((((((((..,(((((..............)))))...))))))))...(((((.........)))))(((((((.......)))))))...|||,}|||}...,.,,..(((....))).(({{{{{{{((,{{(|((((,,.{((((........))))).,|{{{{{.{{{{{{,(((.{(((.....((((((..(((((((..(((((....))))))))))))(((((.{((((((.((((((.,........(((((((((((((......)))))))))))))))))))))))))).)))))..))))))....)))),,.||,.((({{{.,,,.,|||}|}{,(((.(((......)))))}.}}.},)))|..}}|,|))})}}}}},{{(((((.{{.{,...}}.}})))))||{{.{{{{.{.{{.,..,}.,...}})).))))},.,,,,,)).,))).)))}}))),,)}}))})}))))))))))))))))))))))).)))).)))))).)))..)))))))))).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))