Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_METTL9_0001700
Sequence Length
625 nt
GC Content
0.3744
AUUGCACCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCCAGACUCCAUCUCAAAAAACAAACAAAACAAAAAAAGUUUCUCAUCCAGUCCAGUUCCACAAUCUUGUUCAGGUUUCUUGAAUAUUCUUUAAAAGAUAGUCUAUGUAAAUGUAAGUCUGUAUGUACAUUAAAAAAAUUAUACAGGCAGUUCCCAAUUAUAAAUAACUUCUGUUGCCUUUUUCCACUUAAAUGUAUCUAGGAAAGUAGUUCUUACCAGCACAUAUGUCUCCACAUGGUUGUCUACAUGUAAGCUGUAGAUGCUGGAGCUGGCGUGGACUGGUUCAUGAGAGCUGAUUGUUGUUUUGGUAGGAAUUUAAGUGAACUGGUUGUUAAACAUGGCCAUUAUUGAAAUUGACCAUGAUGGGAGUAUUUACACUAUAGAAAUUGGCAAACACUGCAAAUAGCCAUUUUCUUCUCCAAGCUGGUAGUUACACAUUUACCAGCACACCACUAGAUGUAUAACUUUACUAGAGGAGGUCUCUAGAUAGCAAUUUGCUUAGUAAUGUUUAAAAACAAAACACCCUCCCCUGUCCUCCCCCACUUUUUUUUCUUUCUUUCUUUUUCUUUCUUUUCUGAAAGGGACUUGCUCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-139.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -152.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((..((......)).))))))).(((((.((..(((...............((((((((....((((.(((((((((((((...(((......((((((((...)))))))).((((...))))..................(((((((((..............)))))))))................((((....)))).((((((((...............)))))).))......((((((..((((.((..(((((........))))).)).))))..))))))...)))..))))))))...))))))))).....))))))))..(((((...((((((((.....)))...(((((.((..........)).)))))..(((((............(((((.((((..............)))).))))).......((((((((........))))))))............(((......)))(((.(((((.........((((...))))..((..((((....))))..))..))))).)))..))))).)))))...)))))............(((((......)))))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{(,((,..((......)).,}))))}.(((((.((..{{{...............((((((((....(({{(((((((((((((({{,(((,.,{{,((((((((...)))))))).,,,,...,}}|.....,.{,,,,.,{...(((((((((..............))))))))).......,.,,,,...,{{{....}}}|,,,{(((((,.......}}.....)))))}.||,,....{(((({.,((((,,,..((({{...,...,))))).,)}))})},))})))))}))}..))))))))...)))))))))..,,.))))))))..(((((...((((({{{.....}}}...(((((.((.,........)).)))))..(((((............(((((.((((..............)))).))))).......((((((((........)))))))).......,,}.,||,......,,|((({((,{,.}}}}}}..((({...})))..|,..((((,...,,,,,,}),.,}}}}.,,}..}}))}.)))))...,))))...........,(((((......)))))))))).)))))
Back