Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_METTL9_0001900
Sequence Length
2245 nt
GC Content
0.3768
UAGGUGGCAAGUGGGAGAAACCAUCAGAAAUUUUGGAAAUCAAAGGACAGAACUGGGAAGAACAAGUGAAUAGUCUGCCUGAAGUUUUCAGAAAAGCUGGUUUUGUUAUCGAAGCUUUCACCAGACUACCAUACCUGUGUGAAGGCGACAUGUAUAAUGACUACUACGUUCUGGAUGACGCUGUCUUUGUUCUCAAACCAGUAUAAACACGUGGAGGUCGAAGUCUUCAGAGUCCGCACCCUCCGGGAUGUGCCCUUGGAAGAGGGUCUGUGUUCACAAUUACGUGAAGGGAGGACCCUUGGGGACCGCCAUUCUAAAUAUCAUGUAGGAAUUUAAAAAGCCAAAAUACUAAUUAUUUCUUUGUAGUGUGUAAAGGAAUGUUUUUAAAAGACAAAAACCCAACUCUUUGUGGAUUUUUAUCAACUCUUUACUCAGAGCCACUCUCCAAUGCAGGUCACACUCCAAUUAUGAUGGAAGAUAUUUUUUAUACUUAAUUGCAGUAGGGACUCAUUCCCAGACAAAGCAAUAGUCACGACUUCAUGGAACCAAUCAAUGGAUUGUUUUUUGAAGACUGGCAAUAAAGCUGUCCAUUCAAUUCCAAAUACUGGUUUUAAGGUAUAGCCACUGAUAUUCUUUCAUGUUUAGAAAUUCUUUCUGUUAUUAUUCAAGAAAAUGUUUUUAAUCAUGCUAAUAAACUUUUUUGGAGAUGACUUUGGCAUCAUGUUUGAAUUCAUAUAAAGCUCCCCUAGCAUUUUUUAUUGGUUUGGCUUCAGGAGUACCCAAAUAGUAGCAUUAUGAGAAUGACGCAGACAAUUUGAAUAGGGGGGAAGGAAGGCUUCAGACUUGGGGGAAGGGGAGAUUAUUGCAAAUUGCAGUGAACACUGAGUCAGUAAAAAAAAAAAACAGAAACAAAAACCCAGCCUCAUUCAGAUACAGAACUUCAGGGACCCCUCCCCCCACCCCCCCAGUUAAUGCUGCUGUGAAAAAUGCAAAAUAACCUGGUUCUGACUUUGUGAUCACUCAUGUCCCAUACACUGAACUUUGUUUUUUUCUGGACAAUCUCAGGUUCUCAGAAUUGAAACAUUCAGUUUUGUCUACUGACAAAAUGCAACUAAAAAUGUUUUAAUUCAACUUCUUACUCUACACUUAUAUACCUCUCUCCCAGAGCUUGGCUCUUCCCUGAAAUCCUUAAAGGAGUUUAUUAUUUGCCAAGAAUAUGGUUUGAUGAAGACCGUGUCAGACUCAUGCAUUCUGGAAUCCGUGAGUGCCUCCAACCAUAAACCCAGAAAUGCUGCCAUAGAGGAACCCAUUAGCAAGAUCAAUAACCAUCGUGGAUAUUCCAAAGAGCAGAGCAUUUAACCCAGAAUCUGAAAUCUCAGUAAUAACAGAAAUGUCAAUAUGAGAUUGUGGUUAUUAACAAUAUGUUAUCCUCACUACUUUAUUUCUUUUUUCAUCCAGGUGUUUCAUUAAGUAUUCUCAUUUAUAUGCUCAUAGAAGUCAUCAGAUCAACACAUUCACUCCAACACCUGGGUAUAAAGGCGAAUUAAAACCUGAAGAAUUACUUUAUUAUUCAUUAAGAACUGCAUUCCCACAUCCUCACACCAAUAUCUUCCACUGUUACUGUGCAGUCAUAAUAAGAGUUGGGUUAUGUGAUUUAUGCAAAAUUGUUAUUGGUGUGUUCUAAUGAUUUUUUUCCAGGAAUUCAAGUAAGUGAAGUACAAAUACUUAGCACCAUAGAUUGUAAAAAUAGAAAGAGGAAAUGAGAAAACUUAAUGUCGUUCUUGUACAGUUGAGUUUUGCUUCUUUAUAAACUGUCUGUUAAAAUCAGGGGUUGCUGUUAGACUGUCAAGCAGAAGUGAUGGAUGUUCAAGGAGGCAGGUUGCCCCAAAGUGUUUUCUAACUUUCAAGUAGAGAACUUUAUGCUCUAAUAAGAAAAAUACAACUCAUUCUUAACCACCCCCCCAAAACAGAGAAAACACAUACAUUUAUGCAUUUUAAAGAUAAAAAGUAGUUUCUCAAAAAAAUCUGAAGUUCUCUGAAAACCAGCUUAUUAAAAGUGCUGUUUUGUGGUGAAAAUUGAAACCAAAUCCACUCACAUUUCCUAUCGGGUCUUGAAAUUCUUGGUGGUGUGUCACCAUUCCACUAGAUGGCAGUGUUGCUUACUGAGUGUCAAUGGCUUUUUUCCCCGUAAAUGGAAUCAUGUUUUUCUCCCCCAAAGUACAAUAAAGCUGCCUUGUCUGCACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-535.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -581.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 639.84
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((..(((((((.(.((((((((((.((((((((((...(((.((((.(((...............))))))))))...))))))))))(((((((((((.........(((((((((((..........))).))))))))(((((((.((((((((((...(((((((.((((((.(((((((...(((((((((((((.....((((((...(((((((((.(((..(((((((...))).))))..))).))))(((((((.(.(((((......))))).)..)))))))((((((((((((..((((......((((.(((((((((..((((((........((((((((((.......)))))))))).........((.(((((.(((........))).))))).))..((((......)))).((.((((((((((..(((..(((.((((((.((((((((....))))))).).)))))).))).((((.....)))).)))...)))...((((.(.(((((.(((((.((((....))))))))).))))).)))))......(((((((.((.((..(((.....)))..)))))).)))))..............((((.((((((((..(((((...........)))))..)))))))).)))).............)))))))))..))))))......))))))))).))))..(((.....)))........))))..))))....((.....))..((((((((((((...........((((...))))....(((((((((.....)))).....((((((.(((((...((((((((...))))))))..((((...))))........................(((.......(((.......))).....))).))))).))))))..)))))...))))))))))))((((((.(((((......((..(..(((...((((....)))))))..)..))......))))).))))))(((......)))))))))))(((((((((((((..((((((((....)))))))).........))))))))))))).)))))...)))))).....)))))((((.....))))((((((.......((((.((((...)))).))))......))))))....))))))))))))))).)))))).......(((((((((...))).))))))..................(((((((((......((((.((((......(((........)))))))...)))).....))..)))))))...)))))))....(((((((......(((....))).....)))))))))))))))))...)))))))(((((((((..((((((((((((((((((..((((((.......(((((.((((((((.((.((..(((((((((.(((...((((((.........(.(((........))).)..........(((((.....))))).....((.(((.((.(((((...(((((....((.(((((.((((..(((((......)))))......))))))))))).)))))....)))))...)).))).))))))))))).)))))))))......))...)).)))))))))))))........))))))...)))..........)))))))))))))))((((((((((((((....)).))).)))))))))...........((((.((((.......)))))))).(((((.((...)).))))).))))).))))......((.((((...))))))(((((........)))))....((((((((((((........((((((............)))))).................(((((...((.(((.(((((...........)))))..)))))))))).........)))))))))))))))))))))))................(((((((....(((....)))...))).))))..(((....)))........))).))))))).).)).))))))))))((((((((((((((..(((((((.....((((.....((((........))))))))......)))......))))))))...))))))..))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((((((.,(,((((((((,,(((((...((((((((((...(((.((({{(((...........,...))))))))))...)))))))))),{{|||||(((,....,,,.(((((((((((..........))).)))))))){((((({.{{{(((({((...{{(((((.((((((.(((((((...(((((((((((((.....((((((...(((((((((.(((..(((({((...})).))))..))).))))(((((((.(.(((((......))))).).,))))))){((((((({{,,.,{({,,,....{{{{||||{{{{{{..{{{,,,.{{,..,.{{{,,,,,,|}}}},}|||||||},||{{{,...,,||,{((((.(({,,.....)))).))))}.,}..,{||....,{||||{({.,,,,,,,(({{{{(({.{((,((({((.((((((((,,,,|}}}}}}.}.}}||||,}||.((((.....)))).{||...||}||.((((.(.(((((.((((,{((((....))))))))).))))).)))))......{{{{{{{.,{.({..(((.....})|..}}}}}},}}))),...{{.......,{(((.{(((((((..{(((({........,.)))))..)))))))).)))).............})))))}))}})))))),},,,,}})))}}}}.,,,...{{{,,...|||,,,,,,,.|}}}..}}}}|...|}}}}..}},,{(((((((((((,....,,,...{{,,...}))}....(((((({{(.....}}}}.....{(((((.(((((.,.((((((({...}))))))).,{(((...)))}........................{{{.......{{{.......}},.....))).))))).)))))},)))))}...})))))))))))||||||}}}|........}||}|}}||...,({({....,}}}})},,,.,,,,,||,.,||||{|,.,...))))},..,},)))))))}(((((((((((((.,((((((((....)))))))}....,,...))))))))))))).)))))...)))))).....))))){{((,....))))((((((.......((({.((((...)))).})))......))))))....))))))))))))))).))))))..,,,..(((((({((...})),))))}}.......,,,....}}}}|{((((((({,{,,.((({.{((({{{..,,{{,,,,,,,.,||,|||,..,))),..,.|||,|}|||,|,,,||||}}|,|..(((((((......(((....))).....)))))))||||}}}}||,,.}}}))))|{{{{{|||.,(((({((((((((({(((,{((((((....,.{(((({.{{{{{{{{,|||{,..{{{{((({{.{{|...,{{{,,.....,,|}},}}))))}..,}||}.}},.,,,....{(({{,{,..,,}}},..}}||.{{,,{{,(((((...{((({....{{.{{{{{.{{{{..{{({{....,.)))))......})))})))))),)})))....})))}...,,}))},))))})},})),)))}}}}}}..,,||||,,,||,|}}}}}}|||||,...})}}}}))|||...|||{.....,,,,|}}}}}}}}}}}|||((((((((((((((....}).))},))))))))).|||,|,....,{{|.||||,,..,,,)}},)))},||{{{.{{,.,|,.})))).}}}||,||||......((.((({...}))))){((((........))))}....((((((((((((........((((((............)))))).................((((({,,,{.{{,.{(({(.,.........}))))..))}})))))).........))))))))))))||||}||||}}.......,.}}}}}}}|{((((,.....,,..,})}.,,,))}}))),..,((....))}.,}}},,,}}}}|||{((|{,,.},}))),))}))}||}|||||||}}|,,,,||}}}}},,.,,}||....{{{{........)))}.,,,)},})))))))....,||........))))))),|},...,,,.
Back