Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MTO1_0000400
Sequence Length
608 nt
GC Content
0.4523
GUCAGAUGUCAUGUAAUCCUUCCUUUGGUGGCAUCGGAAAGGGACAUUUAAUGAGGGAAGUAGAUGCCUUGGAUGGCCUGUGUUCUCGCAUCUGUGACCAGUCUGGUGUACAUUAUAAAGUAUUAAACCGGCGUAAGGGACCAGCUGUGUGGGGUCUGAGAGCUCAGAUUGAUAGGAAACUCUAUAAACAGAACAUGCAGAAAGAAAUCUUGAAUACACCACUGCUUACUGUUCAGGAGGGAGCUGUAGAAGAUCUUAUUCUUACAGAACCAGAGCCUGAACACACUGGGAAAUGCCGUGUCAGUGGGGUUGUUUUGGUGGAUGGAAGCACAGUAUAUGCAGAGAGUGUGAUUCUGACUACUGGGACAUUUCUGAGAGGCAUGAUUGUAAUUGGAUUGGAGACGCAUCCAGCAGGACGUUUAGGGGAUCAGCCUUCUAUAGGAUUGGCUCAGACACUGGAGAAGUUAGGGUUUGUGGUGGGAAGGUUGAAGACUGGGACUCCACCCCGAAUUGCCAAAGAGUCCAUUAAUUUCAGUAUUCUAAACAAGCAUAUACCGGACAAUCCAUCCAUACCAUUCAGCUUUACCAAUGAGACAGUAUGGAUUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-166.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -178.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((...((((.(((....(((((((((((((..((..(((...(((.(((((.((.(.(((......))).).))))))).)))..))).))..)))))))).)))))..))).))))....)))))....)))((((((.(((((((((((....))))))).(((((....)))))...(((((((.(((((......)))........((((((......(((((((..((..((((((((.......))).)))))..))....)))))))((((.((......)))))))))))).)))))))))(((((((((.(..(.((((((((..(((((...))))).....(((((.((.(((((((((((.(((((....((((((((((......)))).......))))))..)))))))).))).))))).)).))))).(((((.(((........))).)))))((((..((((((....((((((.................)))))).....))))))..))))......)))))))).)..)..))))))))).)))).)))))...(((((......)).))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((((...((((.(((.,..(((({{(((((({..{(,.(({...{((.(((((.((.{.(((......))).).}}))))).)))..))).))..}))))))|,}}}}}..}}).))}}..,,)))}}....)}){(((((.(((({((((((....))))))}.(((({....}))))...(((((((.,{{{,.,,...,)),.....,.((((((.....,(((((((..((..((((((((,,.....})))}))))..))....)))))))|(((.((......)))))})))))),}})))))))(((((((((.{..(.((((((((..((((({,{{||{{,,.,.(((((.((.(((((((((((.(((((.{..,(({{((({{.....,)))),..,,.,}}}},,}.))))))))}})}.})))).)).)))))...,({{{...,||.|{|||{{,{{{{({,,{{((,,.,,,}.,{,||}}}}).)}}}},.}}..,},}))),.....,)))},,))))......)))))))).)..}..))))))))).)))).)))))...|{,.{{,..,..,.))}.,,..)
Back