Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MTO1_0002400

Sequence Length

627 nt

GC Content

0.4402

UGGAUGGAAGCACAGUAUAUGCAGAGAGUGUGAUUCUGACUACUGGGACAUUUCUGAGAGGCAUGAUUGUAAUUGGAUUGGAGACGCAUCCAGCAGGACGUUUAGGGGAUCAGCCUUCUAUAGGAUUGGCUCAGACACUGGAGAAGUUAGGGUUUGUGGUGGGAAGGUUGAAGACUGGGACUCCACCCCGAAUUGCCAAAGAGUCCAUUAAUUUCAGUAUUCUAAACAAGCAUAUACCGGACAAUCCAUCCAUACCAUUCAGCUUUACCAAUGAGACAGUAUGGAUUAAGCCAGAAGAUCAGCUGCCAUGUUACUUGACUCACACCAACCCUAGAGUGGAUGAGAUUGUCCUUAAGAACCUUCACCUUAAUAGUCAUGUUAAAGAAACGACAAGAGGACCUCGAUACUGUCCCUCCAUUGAAUCAAAAGUUUUGCGUUUUCCAAACCGUCUACAUCAGGUUUGGUUGGAACCUGAAGGAAUGGAUUCUGACCUUAUCUACCCACAGGGGUUAUCUAUGACGCUACCAGCUGAGUUACAAGAGAAAAUGAUCACAUGCAUCAGAGGCUUGGAGAAAGCUAAAGUGAUUCAGCCAGGUAAAGAAGAUCACAAGUGCCCUUCAGUAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-159.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -171.14

Frequency: 0.0000

Diversity: 128.67

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((...........((((((((....((((((........((((((.......((((..(..((((...(((((((....)).)))))(((.(((..((((((((..((..((((..(((((...((((..((((.......((((((((.(((..((..(((((((((....((((((.................)))))).....)))))((((.((.....)).))))...(((...)))((((((((..((((..........))))...))))))))...(.(((........))).).....))))..))..))).))))))))))))..))))...)))))..)))).)))).))))))..))).)))..........))))..)..)))).....))))))......))))))....))))))))........)))))))(.((((((((.....)))))))).(..((((((...((((((...........))))))))))))..)..((((.((((((((((..((....(((....)))...))...(((((.....)))))...))))))))))..))))..((((..((....))..)))).......)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.{(((,.((((.,........,.,.)))).|))),.)))((...,,....(((((.((((({{{((({..(((.(((((((((({,,.{(((.(((..((((((((..{(..((((..(((((...((((..((((.......((((((((.((({((((.((((((((,.,,,((((((...........,.....)))))).....,}}))||,|,|,.....,|.,.,,...(((...)))((((((((..((((..........))))...))))))))...{,,{{.......,))},...,,,})))..)))}))).))))))))))))..))))...)))))..)))).}})).))))))..))).)))}........,||,,({((,|,........))})))}..,})..}}.....,,,)))))}}})))).)))..)))}||((((..((((((({|(,,.....,.)).})))))))..)))},(((...,)))},|||,.}..|..((((.((((((((((...,....,((,{,.,,,,.,))...(((((.....)))))...))))))))))..))))..|.,|,,,,...})))).)))))....))