Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MTO1_0004800
Sequence Length
668 nt
GC Content
0.4461
UGCUCUUGUAGGGUGUGAUAGCCGGAAUCAACGCCAGUCUUCGGGUCAGUCGCAAGCCUCCCUUUGUGGUUAGCCGAACAGAAGGUUACAUAGGAGUCUUGAUUGAUGACCUCACUACUCUGGGCACCAGUGAACCAUACCGCAUGUUUACCAGCCGAGUAGAGUUCCGUUUGUCACUGCGCCCUGAUAAUGCUGACAGCCGGCUCACACUGCGAGGGUAUAAAGACGCUGGCUGUGUGUCCCAACAACGAUAUGAAAGAGCUUGUUGGAUGAAGUCUUCUUUAGAAGAAGGCAUUUCUGUGUUGAAAUCUAUUGAGUUUUUGAGCUCUAAAUGGAAAAAAUUAAUCCCAGAGGCUUCUAUAAGUACUAGUAGAAGUCUGCCUGUCAGAGCUCUCGAUGUUCUGAAGUAUGAGGAAGUUGACAUGGAUUCAUUAGCCAAGGCUGUUCCAGAGCCCUUGAAGAAGUAUACUAAAUGUAGAGAGCUGGCUGAAAGACUGAAAAUAGAAGCCACUUAUGAAUCAGUGUUGUUCCAUCAACUACAAGAAAUAAAGGGAGUUCAGCAAGAUGAAGCUCUCCAACUGCCAAAAGACCUAGAUUAUUUGACUAUCAGGGAUGUGUCUUUGUCCCAUGAAGUUCGAGAGAAACUACAUUUUAGUCGUCCACAGACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-191.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -204.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 118.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.(((((((((((((.((((((..((....))....((((((....((((.((((...((((..(((((........))))))))))))).)))).....))))))..((((((..(((....((((((..........))))))..))))))))).)))))).)))))))...)))))).........(((((((((((....(((....)))....)).)))))))))(((((........)))))..)))))).((((((((((.((((((((...)))))))).((((......))))(((((((((((....)))))..))))))............(((((((((((((........))))))))))..)))...((((((((....(((((.(((.(((((((...(((((.(((((((....(((((((.......)).)))))........(((.....)))..(((.(((((.................))))))))))))))).))))).)))).)))))).).)))).....))))))))...((((((.(((((((.((((..((...(((..((((..(((((...))))).....))))..)))...)).)))).)))))...)).))))))..)))))))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.(((((((((((((.((((((..,{....},....((((((.{{,((((.((((...((((..{((((........))))))))))))).))))..,}}))))))..((((((..(((....((((({.{,.....,}))))))..))))))))).)))))).))))))}..,)))))).........(((((((((((....{((....))}....)).))))))))){{{{{........}}}}}..)))))).((((((((({.((((((({...)))))))),((((,,.,,,||},{(((({(((({....}))))..}))))}............{{{((((((((((........))))))))))..})),,.((((((((..,|((((|.(((.(((((((..,(((((.(((((((.,{.(((((((.......))))})))........{((.....)))..,,{.(((((.................))))))),))))))).))))),)))).)))))).),})))}},..))))))))..,{{((((.{{(((((.{(((..{{...{{,..{{,{,.{{{{{,..|||{{{{{{.,,,,.,)))}}.)),)))).)))))...)).)))))).,))))))}..,)))
Back