Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MTO1_0005500
Sequence Length
336 nt
GC Content
0.4435
GGUAUAAAGACGCUGGCUGUGUGUCCCAACAACGAUAUGAAAGAGCUUGUUGGAUGAAGUCUUCUUUAGAAGAAGGCAUUUCUGUGUUGAAAUCUAUUGAGUUUUUGAGCUCUAAAUGGAAAAAAUUAAUCCCAGAGGCUUCUAUAAGUACUAGUAGAAGUCUGCCUGUCAGGCGUGGUGGCAGACAUCUUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCAGAGGCAGGAGAAUCGUUUGAACCUGGGAAGCGGAGGUUGCAGUGAGCCGAGAUCAAGCCAUUGCACCCAAACCUGAGGGACAAGAGUGAGACUUCUCUCAAAAAAAAAGAAAAGACUCAUACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-90.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -96.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 85.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((((((.((.(((.(((((.((((((..(.....)..))))))......((((((((...)))))))).((((......))))(((((((((((....)))))..))))))...............((((((((((........))))))))))((((...))))..((((((.((........))...))))))))))).))).)).)))......)))))..)))((...(((....)))((((((.((.........)))))))).(((........)))......(((((.(((.(((.........))).))).))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.,..{(({{(((.((.(((.((((({(((({{..,.....,..)))))),.....((((((({...)))))))).{{((,,.,,,||,,((((({(((({....}))))..}))))).....,,,,|,,|}|{(((((((((........)))))))))}((((...}))),,(((({|.{,........}|||,})))))))))).))).)).))).....,)}))),.)))((,....,,,.((,(((((((.((.........)))))))))|)}...,}{,,|||,.....(({{{.|||,|||,,.......,}}.,}}.)))}}.))
Back