Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MTO1_0006200

Sequence Length

1225 nt

GC Content

0.3698

AUCGGGGCUGCUAGUCGCAUACCCGGAGUAACACCUGCCGCCAUCAUCAAUCUGCUGAGAUUUGUGAAGACCACUCAACGAAGACAGUCGGCUAUGAAUGAAUCAUCCAAGACUGAUCAAUACUUAUGUGAUGCAGACAGACUUCAAGAGAGAGAGUUAUAGCUUUCAAUUCAUAAAAGAUUUUUAAAGAGCAUAUAAAUAAUUUGAUCAAUACAACAGUAUAGAUAAAAGAAUUAUUUAGCACAUGUUAAAAUAGCUUUAUUAGGUUACUAUGGGUUUGCCAUUAAUUUCUGAGUGGGACAGAAAUUAUAAUUGUGCUUUUUCGUGUAUAUGAAAAAACUAGUCGUAAACAAUUUGUACUCUUUCUUUAAGGAGCUGUAAUACAAAUAACUUUGUGCAGUGUUCAUCAAAGAGAGAGACAGUGAACCUAAAACUGAACCUGGAAUAAAACUCAACAUGCAGAUUUGCCUACUCAUAGGGACUUUGCCUAUUAAGUCUACCAAAUUAAAAGUCUUAUCAUUCAGCGUGUUUUGAGAGUUAAUAAUCUUUUGCUUGGUUAUACUAGGCUAGGAAGCAAUAUCAAAGCCCUUAAAUUCUCAAGACUAAAGACUUGAGAUUAUAUAAAAUUAUCCAGAAUCAUUCAGCUAAUACUAUUGGAAUAUAGUAUGUAGGGUGAAAGUUGACAGAAAUCUGUACUUCUUCAGGAAAUCCUCACUGGUAAUUGUUUUGAACAUUAAUGAAAGCCCUAUAAAAUAGAAAGAUUGGAAAUCACCAUUGUUUCCUAUUAUCCACAGUGUGGAUGGAUACUUAUUUGGUGACCUAGUUAUGGGAGAAUUGAGUAACGUUAGUUAUUUUAUAUCAUACCAUAAAAAUAUUUUCUUAAGAAAUUGUCAUGGCCAUCAUUUCUUAAUAAUGAAGACAGGUCCAUAGUAACUGGUGAGUGGUGUUUCCCUGUUUUUAAGUCAGAAUGACAGAAAAAACAGAAUAGUGGUAGUACCCCUCUUCCUCUCCAGUACUUCAAUGGUAUGUCUUCACAGGGGUUAGAGUGGGAUAAUCAGCUGGGCCUUUUGACUCAGAUACCUCAGAUACCUCAACCAUUCUAAAUAGACUAAGGGAUGAAUACAGCCAAAUGGGCCAGACAGCCCUGCUUGUCUCUGGAAUUCCAACCCAGAUCUCUGGUGUCAGCCUAGGGAGAAGCUCCCGUGUCACCUUCGGGCCAAAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-301.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -323.89

Frequency: 0.0000

Diversity: 321.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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