Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MYBL2_0000100

Sequence Length

2713 nt

GC Content

0.6015

GCGCUUGGCGGGAGAUAGAAAAGUGCUUCAACCCGCGCCGGCGGCGACUGCAGUUCCUGCGAGCGAGGAGCGCGGGACCUGCUGACACGCUGACGCCUUCGAGCGCGGCCCGGGGCCCGGAGCGGCCGGAGCAGCCCGGGUCCUGACCCCGGCCCGGCUCCCGCUCCGGGCUCUGCCGGCGGGCGGGCGAGCGCGGCGCGGUCCGGGCCGGGGGGAUGUCUCGGCGGACGCGCUGCGAGGAUCUGGAUGAGCUGCACUACCAGGACACAGAUUCAGAUGUGCCGGAGCAGAGGGAUAGCAAGUGCAAGGUCAAAUGGACCCAUGAGGAGGACGAGCAGCUGAGGGCCCUGGUGAGGCAGUUUGGACAGCAGGACUGGAAGUUCCUGGCCAGCCACUUCCCUAACCGCACUGACCAGCAAUGCCAGUACAGGUGGCUGAGAGUUUUGAAUCCAGACCUUGUCAAGGGGCCAUGGACCAAAGAGGAAGACCAAAAAGUCAUCGAGCUGGUUAAGAAGUAUGGCACAAAGCAGUGGACACUGAUUGCCAAGCACCUGAAGGGCCGGCUGGGGAAGCAGUGCCGUGAACGCUGGCACAACCACCUCAACCCUGAGGUGAAGAAGUCUUGCUGGACCGAGGAGGAGGACCGCAUCAUCUGCGAGGCCCACAAGGUGCUGGGCAACCGCUGGGCCGAGAUCGCCAAGAUGUUGCCAGGGAGGACAGACAAUGCUGUGAAGAAUCACUGGAACUCUACCAUCAAAAGGAAGGUGGACACAGGAGGCUUCUUGAGCGAGUCCAAAGACUGCAAGCCCCCAGUGUACUUGCUGCUGGAGCUCGAGGACAAGGACGGCCUCCAGAGUGCCCAGCCCACGGAAGGCCAGGGAAGUCUUCUGACCAACUGGCCCUCCGUCCCUCCUACCAUAAAGGAGGAGGAAAACAGUGAGGAGGAACUUGCAGCAGCCACCACAUCGAAGGAACAGGAGCCCAUCGGUACAGAUCUGGACGCAGUGCGAACACCAGAGCCCUUGGAGGAAUUCCCGAAGCGUGAGGACCAGGAAGGCUCCCCACCAGAAACGAGCCUGCCUUACAAGUGGGUGGUGGAGGCAGCUAACCUCCUCAUCCCUGCUGUGGGUUCUAGCCUCUCUGAAGCCCUGGACUUGAUCGAGUCGGACCCUGAUGCUUGGUGUGACCUGAGUAAAUUUGACCUCCCUGAGGAACCAUCUGCAGAGGACAGUAUCAACAACAGCCUAGUGCAGCUGCAAGCGUCACAUCAGCAGCAAGUCCUGCCACCCCGCCAGCCUUCCGCCCUGGUGCCCAGUGUGACCGAGUACCGCCUGGAUGGCCACACCAUCUCAGACCUGAGCCGGAGCAGCCGGGGCGAGCUGAUCCCCAUCUCCCCCAGCACUGAAGUCGGGGGCUCUGGCAUUGGCACACCGCCCUCUGUGCUCAAGCGGCAGAGGAAGAGGCGUGUGGCUCUGUCCCCUGUCACUGAGAAUAGCACCAGUCUGUCCUUCCUGGAUUCCUGUAACAGCCUCACGCCCAAGAGCACACCUGUUAAGACCCUGCCCUUCUCGCCCUCCCAGUUUCUGAACUUCUGGAACAAACAGGACACAUUGGAGCUGGAGAGCCCCUCGCUGACAUCCACCCCAGUGUGCAGCCAGAAGGUGGUGGUCACCACACCACUGCACCGGGACAAGACACCCCUGCACCAGAAACAUGCUGCGUUUGUAACCCCAGAUCAGAAGUACUCCAUGGACAACACUCCCCACACGCCAACCCCGUUCAAGAACGCCCUGGAGAAGUACGGACCCCUGAAGCCCCUGCCACAGACCCCGCACCUGGAGGAGGACUUGAAGGAGGUGCUGCGUUCUGAGGCUGGCAUCGAACUCAUCAUCGAGGACGACAUCAGGCCCGAGAAGCAGAAGAGGAAGCCUGGGCUGCGGCGGAGCCCCAUCAAGAAAGUCCGGAAGUCUCUGGCUCUUGACAUUGUGGAUGAGGAUGUGAAGCUGAUGAUGUCCACACUGCCCAAGUCUCUAUCCUUGCCGACAACUGCCCCUUCAAACUCUUCCAGCCUCACCCUGUCAGGUAUCAAAGAAGACAACAGCUUGCUCAACCAGGGCUUCUUGCAGGCCAAGCCCGAGAAGGCAGCAGUGGCCCAGAAGCCCCGAAGCCACUUCACGACACCUGCCCCUAUGUCCAGUGCCUGGAAGACGGUGGCCUGCGGGGGGACCAGGGACCAGCUUUUCAUGCAGGAGAAAGCCCGGCAGCUCCUGGGCCGCCUGAAGCCCAGCCACACAUCUCGGACCCUCAUCUUGUCCUGAGGUGUUGAGGGUGUCACGAGCCCAUUCUCAUGUUUACAGGGGUUGUGGGGGCAGAGGGGGUCUGUGAAUCUGAGAGUCAUUCAGGUGACCUCCUGCAGGGAGCCUUCUGCCACCAGCCCCUCCCCAGACUCUCAGGUGGAGGCAACAGGGCCAUGUGCUGCCCUGUUGCCGAGCCCAGCUGUGGGCGGCUCCUGGUGCUAACAACAAAGUUCCACUUCCAGGUCUGCCUGGUUCCCUCCCCAAGGCCACAGGGAGCUCCGUCAGCUUCUCCCAAGCCCACGUCAGGCCUGGCCUCAUCUCAGACCCUGCUUAGGAUGGGGGAUGUGGCCAGGGGUGCUCCUGUGCUCACCCUCUCUUGGUGCAUUUUUUUGGAAGAAUAAAAUUGCCUCUCUCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1103.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1149.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 565.73

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.....))((((((.((...((((((((..(((((.(((.((((....((((.(((((((..(...)..))))))).))))......((((.(((......)))))))..((((((((((((((...((((.(((.((((....)))).)))...)))))))))))))))))))))).))))))))....(((((((((.(((..(((((((.....)))))))))))))))))))..(((((((.....((((....((.((.((((........)))))))).)))).((....(((((((((.((((.....))))..((.(((((.((((.....((((((....(((((((...((((.((((((((((.....(((((((((.(((.((((...........((((((((...((((.......))))......(((((..((((..((((....))))....)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))((..((.(((((.....((((....))))..))))).))..))))))))).)))))))))....(((((((....)).)))))...(((((((....)))))))....))))))))))..))))(..(.((((..(((.(((((((((((((((...(((((...)).)))..))))))....))))..))))).)))((((((((((((((..((((((((....))))......((((((.((.....)).))))))((((((.(((..(((((.((((((((..(.(((((((...........))))).(((((.((((((((.(......).))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.......(((((.((.........)).))))).....(((((.(((...)))....)))))...(((.(.((....))).))).(((((((...((..(((((((((((........((((((.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).)))..)))))))).)))))..((((..((.((((.((((((((((..(((.......((((...))))......(((((.(((.(.((.......)).))))..))))).))).)).)))))))))))).)).))))(((((....(((((.(((((((..((((((((((.(((.........)))))))..(((..(.((..((((....))))..)).)..)))((((.(((.((.....)).))))))).))))))..).))))))..)))))..)))))....))).))))))((((.(.(((((.(((((((.(....).)))).))).))))).)))))...))))...))))))))))))))...)))).)..).)))))))((......))....((....)).....)))))))))).)))))))(((((((..(((((((.........(.((((((((.(.((((((((.....)))..).)))).))))))))))..)))))))((((((.......))))))((((..(((........))).)))).)))))))....)))))))))..))))))))).))))))))....(((......)))................((((((((.((((.((((((((((((......((.((((((((((((..(((((..((((.((.(((..((((..(((((.((((.((((..((((((..(((..(((......)))..)))..))).)))..))))))))...(((..((.(((((((((((((((((((.((((((..(.(((((....))))))))))))((((((((.((((((((.((.(((......((....))......))).)))))))))))).)))).))...........(((((((((((((......(((((.((...((((......((((.........((((((((.(..(((((.((((.....))..))..))))))))))))))..))))..))))..)).)))))......))...)).).))))))))..(((((((..((((((((((((((((.((.......))(((((...(((((.(((((..(((((((..(((.((((...((.(((((((((((.........)))).))))))))).)))).))))).))))).......((((..((((((((.(..(((((((((..(((.((.....(((.(((((....))))))))...)).))).))))))))).)))))))))....)))).....(((...(((((((((((........)))))))))))..))).))))))))))..)))))((.(((........))).)).......))))..))))))))))))....))))))).))).)))))))).))........)))))).))....))).)))))...))))..))).)))))).)))))..))))).)))))))..))))))))).....))))).)).))...)))))))).............)).))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.....))((((((.((...((((((((..(((((.(((.((((,.,.((((.(((((((..(...)..))))))).)))).,....((((.(((......)))))))..(((((((((((((({,{(,||.(((.((({....}))).)))|||)},,}))))))))))))))))).))))))))....((((((((||(((,.{((((((.....)))))))))))))))))))..(((((((.....((((....((.((.((((........)))))))).)))).(((...(((((((((.((((.....))))..{(.(((((.((((.,,..,(((((....(((((((.{{((((.((((((((((,....{((((((((.(((.((((.......,...((((((((...((((.,...|.))))......{((((..((((,.((((....))))....)))).}})),..((.(((......))).))..)))))))},{..((.(((((.....((((....))))..))))).))..}}))))))).)))))))))..,.((((((,....,}})))))...(((((((....)))))))....))))))))))..)))}{.{({({,...(((.(((((((((((((((...(((((...)),}))..))))))....))))..))))).))|((((((((((((((..((((((({....||}|,,....((((((.((.....)).)))))){{{{((.(((..(((((.((((((((..,.{{(((((........,..))))).(((((.((((((((.{......,.))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.,.,,..{(({{.((.....,..,||.}}}||.....(((((.(((...)))....)))))||,,{{{(.{{....})),}.},(((((({..,((..(((((((((((........{(((({.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).,,,..)))))))).)))))..((((..((.((({{((((((((((..{,........((((...}}))......|{(({,{|(.{.{{.......,|.|}}}..)))}),))}.)).)))))))))))).)).)))),(({{....(((((,{||{{({,{{((({{{{{({(({.{,{.,{.,||}||||{{((,..,.||}}|{||,...|},||,)).|||}}}||||||,(,((,....|}.},|||||.||.,,...)},)))))..,)))}..))))}....))),)}}}))({{..{,{{|{{,||{{{{|,|,.,,),)))),))).))))).)))}).}}))))...))))))))))))))}..)))).}.,).)))))))||,,...,||,...,|,,,.,}.,,,,))}))})))).)))))}}(((((((..(((((((.........(.((((((((.(.((((,(((.....)))..,.)))),})))))))))..)))))))((((((.......))))))((((..(((........))).)))).)))))))....)))))))))..))))))))).))))))))....(({......}}}......,.......{,{(((((((.((((.((((((((((((,.....{..((((((((((((..(((((..((({{((.(((..((((..(((((.((((.((((..((((((..(((..(((......)))..)))..)))}}))..))))))))...(((..((,(((((((((((((((((((.((((({..(.(((((....)))))))))))),,(((({(.((((((((.((.(((......({....}}......))).))))))))))}).)))).}}..........,(((((((((({,(,...(.(((((.((...((((......{{{||.,......((((((({,{..(((((.((({.....)),.}}..)))))})))))))).||||}..))))..)).)))))......,),..}).),})))))))..((((((({.((((((((((((((((.((.......)}(((((...((((,{(((({..{(((((({{(((.{{{{...{,.(((((((((((.........)))).)))))))||,||||,.,,.|,|,,}},,}}}..{,,,..(((((({,,({.((((((((({.(((.((.....(((.(((((....))))))))...)).))).))))))))).)))))))))....,}}}..))}))})}.(((((((((((........)))))))))))..})))))))))))))..)))))((,({{........})).}),......))))..))))))))))})).}.))))))).))).)))))))).))........)))))}.},..}})}).))))).,.))))..))).)))))).)))))..)))))}}))))))..)))}))))).....))))).)).))...)))))))}.............)).))))))