Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYBL2_0000200
Sequence Length
1720 nt
GC Content
0.6087
GCGCUUGGCGGGAGAUAGAAAAGUGCUUCAACCCGCGCCGGCGGCGACUGCAGUUCCUGCGAGCGAGGAGCGCGGGACCUGCUGACACGCUGACGCCUUCGAGCGCGGCCCGGGGCCCGGAGCGGCCGGAGCAGCCCGGGUCCUGACCCCGGCCCGGCUCCCGCUCCGGGCUCUGCCGGCGGGCGGGCGAGCGCGGCGCGGUCCGGGCCGGGGGGAUGUCUCGGCGGACGCGCUGCGAGGAUCUGGAUGAGCUGCACUACCAGGACACAGAUUCAGAUGUGCCGGAGCAGAGGGAUAGCAAGUGCAAGGUCAAAUGGACCCAUGAGGAGGACGAGCAGCUGAGGGCCCUGGUGAGGCAGUUUGGACAGCAGGACUGGAAGUUCCUGGCCAGCCACUUCCCUAACCGCACUGACCAGCAAUGCCAGUACAGGUGGCUGAGAGUUUUGAAUCCAGACCUUGUCAAGGGGCCAUGGACCAAAGAGGAAGACCAAAAAGUCAUCGAGCUGGUUAAGAAGUAUGGCACAAAGCAGUGGACACUGAUUGCCAAGCACCUGAAGGGCCGGCUGGGGAAGCAGUGCCGUGAACGCUGGCACAACCACCUCAACCCUGAGGUGAAGAAGUCUUGCUGGACCGAGGAGGAGGACCGCAUCAUCUGCGAGGCCCACAAGGUGCUGGGCAACCGCUGGGCCGAGAUCGCCAAGAUGUUGCCAGGGAGGACAGACAAUGCUGUGAAGAAUCACUGGAACUCUACCAUCAAAAGGAAGGUGGACACAGGAGGCUUCUUGAGCGAGUCCAAAGACUGCAAGCCCCCAGUGUACUUGCUGCUGGAGCUCGAGGACAAGGACGGCCUCCAGAGUGCCCAGCCCACGGAAGGCCAGGGAAGUCUUCUGACCAACUGGCCCUCCGUCCCUCCUACCAUAAAGGAGGAGGAAAACAGUGAGGAGGAACUUGCAGCAGCCACCACAUCGAAGGAACAGGAGCCCAUCGGUACAGAUCUGGACGCAGUGCGAACACCAGAGCCCUUGGAGGAAUUCCCGAAGCGUGAGGACCAGGAAGGCUCCCCACCAGAAACGAGCCUGCCUUACAAGUGGGUGGUGGAGGCAGCUAACCUCCUCAUCCCUGCUGUGGGUUCUAGCCUCUCUGAAGCCCUGGACUUGAUCGAGUCGGACCCUGAUGCUUGGUGUGACCUGAGUAAAUUUGACCUCCCUGAGGAACCAUCUGCAGAGGACAGUAUCAACAACAGCCUAGUGCAGCUGCAAGCGUCACAUCAGCAGCAAGUCCUGCCACCCCGCCAGCCUUCCGCCCUGGUGCCCAGUGUGACCGAGUACCGCCUGGAUGGCCACACCAUCUCAGACCUGAGCCGGAGCAGCCGGGGCGAGCUGAUCCCCAUCUCCCCCAGCACUGAAGUCGGGGGCUCUGGCAUUGGCACACCGCCCUCUGUGCUCAAGCGGCAGAGGAAGAGGCGUGUGGCUCUGUCCCCUGUCACUGAGAAUAGCACCAGUCUGUCCUUCCUGGAUUCCUGUAACAGCCUCACGCCCAAGAGCACACCUGUUAAGACCCUGCCCUUCUCGCCCUCCCAGUUUCUGAACUUCUGGAACAAACAGGACACAUUGGAGCUGGAGAGCCCCUCGCUGACAUCCACCCCAGUGUGCAGCCAGAAGGUGGUGGUCACCACACCACUGCACCGGGACAAGACACCCCUGCACCAGAAACAUGCUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-712.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -737.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((.(((((.((.(((......)))...(((((((((.((((...((((.(((((((..(...)..))))))).))))...........)))).))).))))))..((((((((((.((.((....)).)))))))))))).(((((((((((...((((.(((.((((..(((.....)))..)))).))).)))).)))))))))))..)).))))).))).)))((.(((.(..(((((.((.(((((((..((.((.((((........))))))))(((.(((((...((....))..((((.....))))...(((((((....((((....((((....(((((((...((((.((((((((((.....(((((((((.(((.((((...........((((((((...((((.......))))......(((((..((((..((((....))))....)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))((..((.(((((.....((((....))))..))))).))..))))))))).)))))))))....(((((((....)).)))))...(((((((....)))))))....))))))))))..))))(..(.((((..(((.(((((((((((((((...(((((...)).)))..))))))....))))..))))).)))((((((((((((((..((((((((....))))......((((((.((.....)).))))))((((((.(((..(((((.((((((((..(.(((((((...........))))).(((((.((((((((.(......).))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.......(((((.((.........)).))))).....(((((.(((...)))....)))))...(((.(.((....))).))).(((((((...((..(((((((((((........((((((.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).)))..)))))))).)))))..((((..((.((((.((((((((((..(((.......((((...))))......(((((.(((.(.((.......)).))))..))))).))).)).)))))))))))).)).))))(((((....(((((.(((((((..((((((((((.(((.........)))))))..(((..(.((..((((....))))..)).)..)))((((.(((.((.....)).))))))).))))))..).))))))..)))))..)))))....))).))))))((((.(.(((((.(((((((.(....).)))).))).))))).)))))...))))...))))))))))))))...)))).)..).)))))))))))...((((....))))......)))))))))))((.((((.((((((.....(((((.......)))))......)))))))))).))))))))))...............)))))))))...(((((((.......)))))))(((..(((........))).))).)))))..).))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((.(((((.((.{{,......}}}...(((((((((,((((.,.((((.(((((((..(...)..))))))).)))).,...,,,.,.)))).})).))))))..((((((((((.((.((....)).)))))))))))).(((((((((((...((((.(((.((((.{(({.....)}),,)))).))).)))).)))))))))))..}).))))).))).)))((.(((.(..(((((.((.(((((((..({.((.((((........))))))}}(((.(((((...((....))..((((.....))))...(((((((....(((({{..((((....(((((((.{{((((.((((((((((,....{((((((((.(((.((((.......,...((((((((...((((.,...|.))))......{((((..((((,.((((....))))....)))).}})),..((.(((......))).))..)))))))},{..((.(((((.....((((....))))..))))).))..}}))))))).)))))))))..,.((((((,....,}})))))...(((((((....)))))))....))))))))))..)))}{.{({({,...(((.(((((((((((((((...(((((...)),}))..))))))....))))..))))).))|((((((((((((((..((((((({....||}|,,....((((((.((.....)).)))))){{{{((.(((..(((((.((((((((..,.{{(((((........,..))))).(((((.((((((((.{......,.))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.,.,,..{(({{.((.....,..,||.}}}||.....(((((.(((...)))....)))))||,,{{{(.{{....})),}.},(((((({..,((..(((((((((((........{(((({.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).,,,..)))))))).)))))..((((..((.((({{((((((((((..{,........((((...}}))......|{(({,{|(.{.{{.......,|.|}}}..)))}),))}.)).)))))))))))).)).)))),(({{....(((((,{||{{({,{{((({{{{{({(({.{,{.,{.,||}||||{{((,..,.||}}|{||,...|},||,)).|||}}}||||||,(,((,....|}.},|||||.||.,,...)},)))))..,)))}..))))}....))),)}}}))({{..{,{{|{{,||{{{{|,|,.,,),)))),))).))))).)))}).}}))))...))))))))))))))}..)))).}.,).)))))))))))..,|||,....}}}}......))))))))))){{.(((((((((((.....(((((.......)))))......))))))))}),)})))))))).............}}))))))))}...{((((((.......))))))|(((..(((........))).))),)))))..).))).))
Back