Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYBL2_0001300
Sequence Length
2384 nt
GC Content
0.5864
GACGAGCAGCUGAGGGCCCUGGUGAGGCAGUUUGGACAGCAGGACUGGAAGUUCCUGGCCAGCCACUUCCCUAACCGCACUGACCAGCAAUGCCAGUACAGGUGGCUGAGAGUUUUGAAUCCAGACCUUGUCAAGGGGCCAUGGACCAAAGAGGAAGACCAAAAAGUCAUCGAGCUGGUUAAGAAGUAUGGCACAAAGCAGUGGACACUGAUUGCCAAGCACCUGAAGGGCCGGCUGGGGAAGCAGUGCCGUGAACGCUGGCACAACCACCUCAACCCUGAGGUGAAGAAGUCUUGCUGGACCGAGGAGGAGGACCGCAUCAUCUGCGAGGCCCACAAGGUGCUGGGCAACCGCUGGGCCGAGAUCGCCAAGAUGUUGCCAGGGAGGACAGACAAUGCUGUGAAGAAUCACUGGAACUCUACCAUCAAAAGGAAGGUGGACACAGGAGGCUUCUUGAGCGAGUCCAAAGACUGCAAGCCCCCAGUGUACUUGCUGCUGGAGCUCGAGGACAAGGACGGCCUCCAGAGUGCCCAGCCCACGGAAGGCCAGGGAAGUCUUCUGACCAACUGGCCCUCCGUCCCUCCUACCAUAAAGGAGGAGGAAAACAGUGAGGAGGAACUUGCAGCAGCCACCACAUCGAAGGAACAGGAGCCCAUCGGUACAGAUCUGGACGCAGUGCGAACACCAGAGCCCUUGGAGGAAUUCCCGAAGCGUGAGGACCAGGAAGGCUCCCCACCAGAAACGAGCCUGCCUUACAAGUGGGUGGUGGAGGCAGCUAACCUCCUCAUCCCUGCUGUGGGUUCUAGCCUCUCUGAAGCCCUGGACUUGAUCGAGUCGGACCCUGAUGCUUGGUGUGACCUGAGUAAAUUUGACCUCCCUGAGGAACCAUCUGCAGAGGACAGUAUCAACAACAGCCUAGUGCAGCUGCAAGCGUCACAUCAGCAGCAAGUCCUGCCACCCCGCCAGCCUUCCGCCCUGGUGCCCAGUGUGACCGAGUACCGCCUGGAUGGCCACACCAUCUCAGACCUGAGCCGGAGCAGCCGGGGCGAGCUGAUCCCCAUCUCCCCCAGCACUGAAGUCGGGGGCUCUGGCAUUGGCACACCGCCCUCUGUGCUCAAGCGGCAGAGGAAGAGGCGUGUGGCUCUGUCCCCUGUCACUGAGAAUAGCACCAGUCUGUCCUUCCUGGAUUCCUGUAACAGCCUCACGCCCAAGAGCACACCUGUUAAGACCCUGCCCUUCUCGCCCUCCCAGUUUCUGAACUUCUGGAACAAACAGGACACAUUGGAGCUGGAGAGCCCCUCGCUGACAUCCACCCCAGUGUGCAGCCAGAAGGUGGUGGUCACCACACCACUGCACCGGGACAAGACACCCCUGCACCAGAAACAUGCUGCGUUUGUAACCCCAGAUCAGAAGUACUCCAUGGACAACACUCCCCACACGCCAACCCCGUUCAAGAACGCCCUGGAGAAGUACGGACCCCUGAAGCCCCUGCCACAGACCCCGCACCUGGAGGAGGACUUGAAGGAGGUGCUGCGUUCUGAGGCUGGCAUCGAACUCAUCAUCGAGGACGACAUCAGGCCCGAGAAGCAGAAGAGGAAGCCUGGGCUGCGGCGGAGCCCCAUCAAGAAAGUCCGGAAGUCUCUGGCUCUUGACAUUGUGGAUGAGGAUGUGAAGCUGAUGAUGUCCACACUGCCCAAGUCUCUAUCCUUGCCGACAACUGCCCCUUCAAACUCUUCCAGCCUCACCCUGUCAGGUAUCAAAGAAGACAACAGCUUGCUCAACCAGGGCUUCUUGCAGGCCAAGCCCGAGAAGGCAGCAGUGGCCCAGAAGCCCCGAAGCCACUUCACGACACCUGCCCCUAUGUCCAGUGCCUGGAAGACGGUGGCCUGCGGGGGGACCAGGGACCAGCUUUUCAUGCAGGAGAAAGCCCGGCAGCUCCUGGGCCGCCUGAAGCCCAGCCACACAUCUCGGACCCUCAUCUUGUCCUGAGGUGUUGAGGGUGUCACGAGCCCAUUCUCAUGUUUACAGGGGUUGUGGGGGCAGAGGGGGUCUGUGAAUCUGAGAGUCAUUCAGGUGACCUCCUGCAGGGAGCCUUCUGCCACCAGCCCCUCCCCAGACUCUCAGGUGGAGGCAACAGGGCCAUGUGCUGCCCUGUUGCCGAGCCCAGCUGUGGGCGGCUCCUGGUGCUAACAACAAAGUUCCACUUCCAGGUCUGCCUGGUUCCCUCCCCAAGGCCACAGGGAGCUCCGUCAGCUUCUCCCAAGCCCACGUCAGGCCUGGCCUCAUCUCAGACCCUGCUUAGGAUGGGGGAUGUGGCCAGGGGUGCUCCUGUGCUCACCCUCUCUUGGUGCAUUUUUUUGGAAGAAUAAAAUUGCCUCUCUCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-913.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -956.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 561.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)((..((((((...(((..(((.((.(((.((((((((((.....(((((((((.(((.((((...........((((((((...((((.......))))......(((((..((((..((((....))))....)))).)))))..((.(((......))).))..))))))))((..((.(((((.....((((....))))..))))).))..))))))))).)))))))))....(((((((....)).)))))...(((((((....)))))))....))))))))))...(((((((((((...(((.(((((((((((((((...(((((...)).)))..))))))....))))..))))).)))((((((((((((((..((((((((....))))......((((((.((.....)).))))))((((((.(((..(((((.((((((((..(.(((((((...........))))).(((((.((((((((.(......).))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.......(((((.((.........)).))))).....(((((.(((...)))....)))))...(((.(.((....))).))).(((((((...((..(((((((((((........((((((.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).)))..)))))))).)))))..((((..((.((((.((((((((((..(((.......((((...))))......(((((.(((.(.((.......)).))))..))))).))).)).)))))))))))).)).))))(((((....(((((.(((((((..((((((((((.(((.........)))))))..(((..(.((..((((....))))..)).)..)))((((.(((.((.....)).))))))).))))))..).))))))..)))))..)))))....))).))))))((((.(.(((((.(((((((.(....).)))).))).))))).)))))...))))...)))))))))))))).....((.((((((.(((........))).....))))))))..)))..))))))))........(((((((..(((((((.........(.((((((((.(.((((((((.....)))..).)))).))))))))))..)))))))((((((.......))))))((((..(((........))).)))).)))))))...(((.(((((......))))))))...........(((......)))))).))))).)))...((((((((.((((.((((((((((((......((.((((((((((((..(((((..((((.((.(((..((((..(((((.((((.((((..((((((..(((..(((......)))..)))..))).)))..))))))))...(((..((.(((((((((((((((((((.((((((..(.(((((....))))))))))))((((((((.((((((((.((.(((......((....))......))).)))))))))))).)))).))...........(((((((((((((......(((((.((...((((......((((.........((((((((.(..(((((.((((.....))..))..))))))))))))))..))))..))))..)).)))))......))...)).).))))))))..(((((((..((((((((((((((((.((.......))(((((...(((((.(((((..(((((((..(((.((((...((.(((((((((((.........)))).))))))))).)))).))))).))))).......((((..((((((((.(..(((((((((..(((.((.....(((.(((((....))))))))...)).))).))))))))).)))))))))....)))).....(((...(((((((((((........)))))))))))..))).))))))))))..)))))((.(((........))).)).......))))..))))))))))))....))))))).))).)))))))).))........)))))).))....))).)))))...))))..))).)))))).)))))..))))).)))))))..))))))))).....))))).)).))...))))))))...........))).)))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{{(({{,.((((((,{{,{,({{({,{{((((.((((((((((,....{{||(((((,(((.((((.......{,..(({(((((...((({.,...},)))),,....{{{{{..{(({|.((((....}))),,,.)))}.|}}},..({.(((......))).))..)))))))}{{..({.(((((.....((((....))))..))))).))..}})}}}))).))))))}}}....((((((,....,}})))))...(((((((....)))))))....})))))))))..)||{((((((((...(((.(((((((((((((((...(((((...)),}))..))))))....))))..))))).))|((((((((((((((..((((((({....||}|,,....((((((.((.....)).)))))){{{{((.(((..(((((.((((((((..,.{{(((((........,..))))).(((((.((((((((.{......,.))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.,.,,..{(({{.((.....,..,||.}}}||.....(((((.(((...)))....)))))||,,{{{(.{{....})),}.},(((((({..,((..(((((((((((........{(((({.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).,,,..)))))))).)))))..((((..((.((({{((((((((((..{,........((((...}}))......|{(({,{|(.{.{{.......,|.|}}}..)))}),))}.)).)))))))))))).)).)))),(({{....(((((,{||{{({,{{((({{{{{({(({.{,{.,{.,||}||||{{((,..,.||}}|{||,...|},||,)).|||}}}||||||,(,((,....|}.},|||||.||.,,...)},)))))..,)))}..))))}....))),)}}}))({{..{,{{|{{,||{{{{|,|,.,,),)))),))).))))).)))}).}}))))...))))))))))))))}....||.{(((((.{{{........}}),....)))))}}}..,})..))))))))}}})).,,(((((((..(((((((.........(.((((((((.(.((((,(((.....)))..,.)))),}))))))))}..)))))))((((((.......)))))){(((..(((........))).)))}.))))))).,}|||,|{{{{......)))))))),.,........({{......})),,,...},,.....|,{{{(((((.((((.((((((((((((,.....{..((((((((((((..(((((..((({{((.(((..((((..(((((.((((.((((..((((((..(((..(((......)))..)))..)))}}))..))))))))...(((..((,(((((((((((((((((((.((((({..(.(((((....)))))))))))),,(((({(.((((((((.((.(((......({....}}......))).))))))))))}).)))).}}..........,(((((((((({,(,...{.(((((.((...((((......{{{||.,......((((((({,{..(((((.((({.....)),.}}..)))))})))))))).||||}..))))..)).)))))......,),..}).),})))))))..((((((({.((((((((((((((((.((.......)}(((((...((((,{(((({..{(((((({{(((.{{{{...{,.(((((((((((.........)))).)))))))||,||||,.,,.|,|,,}},,}}}..{,,,..(((((({,,({.((((((((({.(((.((.....(((.(((((....))))))))...)).))).))))))))).)))))))))....,}}}..))}))})}.(((((((((((........)))))))))))..})))))))))))))..)))))((,({{........})).}),......))))..))))))))))})).}.))))))).))).)))))))).))........)))))}.}}..}})}).))))).,.))))..))).)))))).)))))..)))))}}))))))..)))}))))).....))))).)).))...)))})))}.,........}))}})}},,}}
Back