Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYBL2_0001500
Sequence Length
2312 nt
GC Content
0.5852
AACCGCACUGACCAGCAAUGCCAGUACAGGUGGCUGAGAGUUUUGAAUCCAGACCUUGUCAAGGGGCCAUGGACCAAAGAGGAAGACCAAAAAGUCAUCGAGCUGGUUAAGAAGUAUGGCACAAAGCAGUGGACACUGAUUGCCAAGCACCUGAAGGGCCGGCUGGGGAAGCAGUGCCGUGAACGCUGGCACAACCACCUCAACCCUGAGGUGAAGAAGUCUUGCUGGACCGAGGAGGAGGACCGCAUCAUCUGCGAGGCCCACAAGGUGCUGGGCAACCGCUGGGCCGAGAUCGCCAAGAUGUUGCCAGGGAGGACAGACAAUGCUGUGAAGAAUCACUGGAACUCUACCAUCAAAAGGAAGGUGGACACAGGAGGCUUCUUGAGCGAGUCCAAAGACUGCAAGCCCCCAGUGUACUUGCUGCUGGAGCUCGAGGACAAGGACGGCCUCCAGAGUGCCCAGCCCACGGAAGGCCAGGGAAGUCUUCUGACCAACUGGCCCUCCGUCCCUCCUACCAUAAAGGAGGAGGAAAACAGUGAGGAGGAACUUGCAGCAGCCACCACAUCGAAGGAACAGGAGCCCAUCGGUACAGAUCUGGACGCAGUGCGAACACCAGAGCCCUUGGAGGAAUUCCCGAAGCGUGAGGACCAGGAAGGCUCCCCACCAGAAACGAGCCUGCCUUACAAGUGGGUGGUGGAGGCAGCUAACCUCCUCAUCCCUGCUGUGGGUUCUAGCCUCUCUGAAGCCCUGGACUUGAUCGAGUCGGACCCUGAUGCUUGGUGUGACCUGAGUAAAUUUGACCUCCCUGAGGAACCAUCUGCAGAGGACAGUAUCAACAACAGCCUAGUGCAGCUGCAAGCGUCACAUCAGCAGCAAGUCCUGCCACCCCGCCAGCCUUCCGCCCUGGUGCCCAGUGUGACCGAGUACCGCCUGGAUGGCCACACCAUCUCAGACCUGAGCCGGAGCAGCCGGGGCGAGCUGAUCCCCAUCUCCCCCAGCACUGAAGUCGGGGGCUCUGGCAUUGGCACACCGCCCUCUGUGCUCAAGCGGCAGAGGAAGAGGCGUGUGGCUCUGUCCCCUGUCACUGAGAAUAGCACCAGUCUGUCCUUCCUGGAUUCCUGUAACAGCCUCACGCCCAAGAGCACACCUGUUAAGACCCUGCCCUUCUCGCCCUCCCAGUUUCUGAACUUCUGGAACAAACAGGACACAUUGGAGCUGGAGAGCCCCUCGCUGACAUCCACCCCAGUGUGCAGCCAGAAGGUGGUGGUCACCACACCACUGCACCGGGACAAGACACCCCUGCACCAGAAACAUGCUGCGUUUGUAACCCCAGAUCAGAAGUACUCCAUGGACAACACUCCCCACACGCCAACCCCGUUCAAGAACGCCCUGGAGAAGUACGGACCCCUGAAGCCCCUGCCACAGACCCCGCACCUGGAGGAGGACUUGAAGGAGGUGCUGCGUUCUGAGGCUGGCAUCGAACUCAUCAUCGAGGACGACAUCAGGCCCGAGAAGCAGAAGAGGAAGCCUGGGCUGCGGCGGAGCCCCAUCAAGAAAGUCCGGAAGUCUCUGGCUCUUGACAUUGUGGAUGAGGAUGUGAAGCUGAUGAUGUCCACACUGCCCAAGUCUCUAUCCUUGCCGACAACUGCCCCUUCAAACUCUUCCAGCCUCACCCUGUCAGGUAUCAAAGAAGACAACAGCUUGCUCAACCAGGGCUUCUUGCAGGCCAAGCCCGAGAAGGCAGCAGUGGCCCAGAAGCCCCGAAGCCACUUCACGACACCUGCCCCUAUGUCCAGUGCCUGGAAGACGGUGGCCUGCGGGGGGACCAGGGACCAGCUUUUCAUGCAGGAGAAAGCCCGGCAGCUCCUGGGCCGCCUGAAGCCCAGCCACACAUCUCGGACCCUCAUCUUGUCCUGAGGUGUUGAGGGUGUCACGAGCCCAUUCUCAUGUUUACAGGGGUUGUGGGGGCAGAGGGGGUCUGUGAAUCUGAGAGUCAUUCAGGUGACCUCCUGCAGGGAGCCUUCUGCCACCAGCCCCUCCCCAGACUCUCAGGUGGAGGCAACAGGGCCAUGUGCUGCCCUGUUGCCGAGCCCAGCUGUGGGCGGCUCCUGGUGCUAACAACAAAGUUCCACUUCCAGGUCUGCCUGGUUCCCUCCCCAAGGCCACAGGGAGCUCCGUCAGCUUCUCCCAAGCCCACGUCAGGCCUGGCCUCAUCUCAGACCCUGCUUAGGAUGGGGGAUGUGGCCAGGGGUGCUCCUGUGCUCACCCUCUCUUGGUGCAUUUUUUUGGAAGAAUAAAAUUGCCUCUCUCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-885.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -925.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 530.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((.(((((..((...))..)).))))))).)(((((...........(((...))).((((((.(((.((((((((((..(((((....(....)....))))).....((.(((((.....((((....))))..))))).)).(((((.((((.(((((((((....(((((((....)).)))))...(((((((....))))))).....((((...((((.(((((((((((...(((.(((((((((((((((...(((((...)).)))..))))))....))))..))))).)))((((((((((((((..((((((((....))))......((((((.((.....)).))))))((((((.(((..(((((.((((((((..(.(((((((...........))))).(((((.((((((((.(......).))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.......(((((.((.........)).))))).....(((((.(((...)))....)))))...(((.(.((....))).))).(((((((...((..(((((((((((........((((((.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).)))..)))))))).)))))..((((..((.((((.((((((((((..(((.......((((...))))......(((((.(((.(.((.......)).))))..))))).))).)).)))))))))))).)).))))(((((....(((((.(((((((..((((((((((.(((.........)))))))..(((..(.((..((((....))))..)).)..)))((((.(((.((.....)).))))))).))))))..).))))))..)))))..)))))....))).))))))((((.(.(((((.(((((((.(....).)))).))).))))).)))))...))))...)))))))))))))).....((.((((((.(((........))).....))))))))..)))..))))))))........(((((((..(((((((.........(.((((((((.(.((((((((.....)))..).)))).))))))))))..)))))))((((((.......))))))((((..(((........))).)))).)))))))...(((.(((((......))))))))......)))).)))).....))))))...))).....((((....))))....(((((((((((((((((((..(((((((..((((.........(((((((((...(((((((.(((.((((.((((..((((((..(((..(((......)))..)))..))).)))..))))))))...(((...)))(((((.(...).)))))..((((((..(.(((((....))))))))))))..((((((.((((((((.((.(((......((....))......))).)))))))))))).))))..)))))))))).))))))))).......)))))))).....((((((.(.....((((......)))))))))))((((((((...(((....(((((.((((((...(......)...)))))).........)))))......(((((...)))))...)))))))))))((((((((((((((((.((.......))(((((...(((((.(((((..(((((((..(((.((((...((.(((((((((((.........)))).))))))))).)))).))))).))))).......((((..((((((((.(..(((((((((..(((.((.....(((.(((((....))))))))...)).))).))))))))).)))))))))....)))).....(((...(((((((((((........)))))))))))..))).))))))))))..)))))((.(((........))).)).......))))..)))))))))))).....)))..))))).).)))))..))))))))...))))...)))))(((((((.((((((....(((....)))....)))))).)))))))(((((....)))))...))))).))))).)))..(((((......)))))..)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((.(((((..((...))..)).))))))).)(((((..{{(..((((,.((((....}))),...)))).}}}{((((..(((,,....|}}..,..{{||||}.{,..((.(((((.....((((....))))..))))).))..||,,.(((..(((((((((.,..((((((,....,},)))))...(((((((....)))))))..,..{{||,{{{(({.(((((((((((...(((.(((((((((((((((...(((((...)),}))..))))))....))))..))))).))|((((((((((((((..((((((({....||}|,,....((((((.((.....)).)))))){{{{((.(((..(((((.((((((((..,.{{(((((........,..))))).(((((.((((((((.{......,.))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.,.,,..{(({{.((.....,..,||.}}}||.....(((((.(((...)))....)))))||,,{{{(.{{....})),}.},(((((({..,((..(((((((((((........{(((({.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).,,,..)))))))).)))))..((((..((.((({{((((((((((..{,........((((...}}))......|{(({,{|(.{.{{.......,|.|}}}..)))}),))}.)).)))))))))))).)).)))),(({{....(((((,{||{{({,{{((({{{{{({(({.{,{.,{.,||}||||{{((,..,.||}}|{||,...|},||,)).|||}}}||||||,(,((,....|}.},|||||.||.,,...)},)))))..,)))}..))))}....))),)}}}))({{..{,{{|{{,||{{{{|,|,.,,),)))),))).))))).)))}).}}))))...))))))))))))))}....{{.((((((.(((........))).....))))))})..)))..))))))))...},},}||(((((,.{{(((((.,,,,,,..(.((((((((.(.((((,(((.....)))..,.)))),}))))))))}..))}}}}|((((((.......))))))|(({..(((........))).}))|.||}}}}}.}}{||,|||||,....,)))))))),,,,..,...,}},,.....))))))...)))..,))|.|||{{{{{.((((.(((((((((((({.....{..((((((((((((..(((((..((({{((.(((..((((.,(((((.((((.((((..((((((..(((..(((......)))..)))..)))}}))..))))))))...(((..((|(((((((((((((((((((.((((({..(.(((((....)))))))))))),,(((({(.((((((((.((.(((......({....}}......))).))))))))))}).)))).}}..........,(((((((({{{,{,...{.(((((.((...((((......{{|||.,......((((((({,{..(((((.((({.....)),.}}..)))))})))))))).||||}..))))..)).))))).......},..}).),}))))))).,((((((({.((((((((((((((((.((.......)}(((((...(((({{(((({..{(((((({{(((.{{{{...{,.(((((((((((.........)))).)))))))||,||||,,,,.|,|,,}},,}}}..{,,,..(((((({,,({.((((((((({.(((.((.....(((.(((((....))))))))...)).))).))))))))).)))))))))....,}}}..))}))})}.(((((((((((........)))))))))))..})))))))))))))..)))))((,({{........})).}),......))))..))))))))))})).}.))))))).))).)))))))).))........)))))}.,}..}})}}.))))).,.))))..))).)))))).)))))..)))))}}))))))..)))}))))).....))))).)).))...}}}}}}}}............))))})))))
Back