Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYBL2_0002000
Sequence Length
2219 nt
GC Content
0.5886
GUCAUCGAGCUGGUUAAGAAGUAUGGCACAAAGCAGUGGACACUGAUUGCCAAGCACCUGAAGGGCCGGCUGGGGAAGCAGUGCCGUGAACGCUGGCACAACCACCUCAACCCUGAGGUGAAGAAGUCUUGCUGGACCGAGGAGGAGGACCGCAUCAUCUGCGAGGCCCACAAGGUGCUGGGCAACCGCUGGGCCGAGAUCGCCAAGAUGUUGCCAGGGAGGACAGACAAUGCUGUGAAGAAUCACUGGAACUCUACCAUCAAAAGGAAGGUGGACACAGGAGGCUUCUUGAGCGAGUCCAAAGACUGCAAGCCCCCAGUGUACUUGCUGCUGGAGCUCGAGGACAAGGACGGCCUCCAGAGUGCCCAGCCCACGGAAGGCCAGGGAAGUCUUCUGACCAACUGGCCCUCCGUCCCUCCUACCAUAAAGGAGGAGGAAAACAGUGAGGAGGAACUUGCAGCAGCCACCACAUCGAAGGAACAGGAGCCCAUCGGUACAGAUCUGGACGCAGUGCGAACACCAGAGCCCUUGGAGGAAUUCCCGAAGCGUGAGGACCAGGAAGGCUCCCCACCAGAAACGAGCCUGCCUUACAAGUGGGUGGUGGAGGCAGCUAACCUCCUCAUCCCUGCUGUGGGUUCUAGCCUCUCUGAAGCCCUGGACUUGAUCGAGUCGGACCCUGAUGCUUGGUGUGACCUGAGUAAAUUUGACCUCCCUGAGGAACCAUCUGCAGAGGACAGUAUCAACAACAGCCUAGUGCAGCUGCAAGCGUCACAUCAGCAGCAAGUCCUGCCACCCCGCCAGCCUUCCGCCCUGGUGCCCAGUGUGACCGAGUACCGCCUGGAUGGCCACACCAUCUCAGACCUGAGCCGGAGCAGCCGGGGCGAGCUGAUCCCCAUCUCCCCCAGCACUGAAGUCGGGGGCUCUGGCAUUGGCACACCGCCCUCUGUGCUCAAGCGGCAGAGGAAGAGGCGUGUGGCUCUGUCCCCUGUCACUGAGAAUAGCACCAGUCUGUCCUUCCUGGAUUCCUGUAACAGCCUCACGCCCAAGAGCACACCUGUUAAGACCCUGCCCUUCUCGCCCUCCCAGUUUCUGAACUUCUGGAACAAACAGGACACAUUGGAGCUGGAGAGCCCCUCGCUGACAUCCACCCCAGUGUGCAGCCAGAAGGUGGUGGUCACCACACCACUGCACCGGGACAAGACACCCCUGCACCAGAAACAUGCUGCGUUUGUAACCCCAGAUCAGAAGUACUCCAUGGACAACACUCCCCACACGCCAACCCCGUUCAAGAACGCCCUGGAGAAGUACGGACCCCUGAAGCCCCUGCCACAGACCCCGCACCUGGAGGAGGACUUGAAGGAGGUGCUGCGUUCUGAGGCUGGCAUCGAACUCAUCAUCGAGGACGACAUCAGGCCCGAGAAGCAGAAGAGGAAGCCUGGGCUGCGGCGGAGCCCCAUCAAGAAAGUCCGGAAGUCUCUGGCUCUUGACAUUGUGGAUGAGGAUGUGAAGCUGAUGAUGUCCACACUGCCCAAGUCUCUAUCCUUGCCGACAACUGCCCCUUCAAACUCUUCCAGCCUCACCCUGUCAGGUAUCAAAGAAGACAACAGCUUGCUCAACCAGGGCUUCUUGCAGGCCAAGCCCGAGAAGGCAGCAGUGGCCCAGAAGCCCCGAAGCCACUUCACGACACCUGCCCCUAUGUCCAGUGCCUGGAAGACGGUGGCCUGCGGGGGGACCAGGGACCAGCUUUUCAUGCAGGAGAAAGCCCGGCAGCUCCUGGGCCGCCUGAAGCCCAGCCACACAUCUCGGACCCUCAUCUUGUCCUGAGGUGUUGAGGGUGUCACGAGCCCAUUCUCAUGUUUACAGGGGUUGUGGGGGCAGAGGGGGUCUGUGAAUCUGAGAGUCAUUCAGGUGACCUCCUGCAGGGAGCCUUCUGCCACCAGCCCCUCCCCAGACUCUCAGGUGGAGGCAACAGGGCCAUGUGCUGCCCUGUUGCCGAGCCCAGCUGUGGGCGGCUCCUGGUGCUAACAACAAAGUUCCACUUCCAGGUCUGCCUGGUUCCCUCCCCAAGGCCACAGGGAGCUCCGUCAGCUUCUCCCAAGCCCACGUCAGGCCUGGCCUCAUCUCAGACCCUGCUUAGGAUGGGGGAUGUGGCCAGGGGUGCUCCUGUGCUCACCCUCUCUUGGUGCAUUUUUUUGGAAGAAUAAAAUUGCCUCUCUCUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-853.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -893.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 475.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((..(((..((..((.(((((.....((((....))))..))))).))..))...(((..(((((((((....(((((((....)).)))))...(((((((....))))))).....((((...((((.(((((((((((...(((.(((((((((((((((...(((((...)).)))..))))))....))))..))))).)))((((((((((((((..((((((((....))))......((((((.((.....)).))))))((((((.(((..(((((.((((((((..(.(((((((...........))))).(((((.((((((((.(......).))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.......(((((.((.........)).))))).....(((((.(((...)))....)))))...(((.(.((....))).))).(((((((...((..(((((((((((........((((((.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).)))..)))))))).)))))..((((..((.((((.((((((((((..(((.......((((...))))......(((((.(((.(.((.......)).))))..))))).))).)).)))))))))))).)).))))(((((....(((((.(((((((..((((((((((.(((.........)))))))..(((..(.((..((((....))))..)).)..)))((((.(((.((.....)).))))))).))))))..).))))))..)))))..)))))....))).))))))((((.(.(((((.(((((((.(....).)))).))).))))).)))))...))))...)))))))))))))).....((.((((((.(((........))).....))))))))..)))..))))))))........(((((((..(((((((.........(.((((((((.(.((((((((.....)))..).)))).))))))))))..)))))))((((((.......))))))((((..(((........))).)))).)))))))...(((.(((((......))))))))......)))).)))).....))))))...)))..)))..((((((((.((((.((((((((((((......((.((((((((((((..(((((..((((.((.(((..((((..(((((.((((.((((..((((((..(((..(((......)))..)))..))).)))..))))))))...(((..((.(((((((((((((((((((.((((((..(.(((((....))))))))))))((((((((.((((((((.((.(((......((....))......))).)))))))))))).)))).))...........(((((((((((((......(((((.((...((((......((((.........((((((((.(..(((((.((((.....))..))..))))))))))))))..))))..))))..)).)))))......))...)).).))))))))..(((((((..((((((((((((((((.((.......))(((((...(((((.(((((..(((((((..(((.((((...((.(((((((((((.........)))).))))))))).)))).))))).))))).......((((..((((((((.(..(((((((((..(((.((.....(((.(((((....))))))))...)).))).))))))))).)))))))))....)))).....(((...(((((((((((........)))))))))))..))).))))))))))..)))))((.(((........))).)).......))))..))))))))))))....))))))).))).)))))))).))........)))))).))....))).)))))...))))..))).)))))).)))))..))))).)))))))..))))))))).....))))).)).))...))))))))...........)))...)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.....(((..(({.,{{..((.(((((.....((((....))))..))))).))..,|,,.(((..(((((((((.,..((((((,,...,},)))))...(((((((....)))))))..,..{,||,||{(({.(((((((((((...(((.(((((((((((((((...(((((...)),}))..))))))....))))..))))).))|((((((((((((((..((((((({....||}|,,....((((((.((.....)).)))))){{{{((.(((..(((((.((((((((..,.{{(((((........,..))))).(((((.((((((((.{......,.))))..))))..)))))..(((((.((((((....(((....)))...)))))).))))).((((((.((.....))))))))....(((.((((.((((((((((((((.,.,,..{(({{.((.....,..,||.}}}||.....(((((.(((...)))....)))))||,,{{{(.{{....})),}.},(((((({..,((..(((((((((((........{(((({.......))))))))))).)).))))..)))))))))..))))))))))))))..)))).))).,,,..)))))))).)))))..((((..((.((({{((((((((((..{,........((((...}}))......|{(({,{|(.{.{{.......,|.|}}}..)))}),))}.)).)))))))))))).)).)))),(({{....(((((,{||{{({,{{((({{{{{({(({.{,{.,{.,||}||||{{((,..,.||}}|{||,...|},||,)).|||}}}||||||,(,((,....|}.},|||||.||.,,...)},)))))..,)))}..))))}....))),)}}}))({{..{,{{|{{,||{{{{|,|,.,,),)))),))).))))).)))}).}}))))...))))))))))))))}....{{.((((((.(((........))).....))))))})..)))..))))))))...},},}||(((((,.{{(((((.,,,,,,..(.((((((((.(.((((,(((.....)))..,.)))),}))))))))}..))}}}}|((((((.......))))))|(({..(((........))).}))|.||}}}}}.}}|||,|||||,....,)))))))),,,,.......}},}.....))))))...)))..}))|.|||{((((.((((.((((((((((((,.....{..((((((((((((..(((((..((({{((.(((..((((..(((((.((((.((((..((((((..(((..(((......)))..)))..)))}}))..))))))))...(((..((,(((((((((((((((((((.((((({..(.(((((....)))))))))))),,(((({(.((((((((.((.(((......({....}}......))).))))))))))}).)))).}}..........,(((((((((({,(,...(.(((((.((...((((......{{{||.,......((((((({,{..(((((.((({.....)),.}}..)))))})))))))).||||}..))))..)).)))))......,),..}).),})))))))..((((((({.((((((((((((((((.((.......)}(((((...((((,{(((({..{(((((({{(((.{{{{...{,.(((((((((((.........)))).)))))))||,||||,.,,.|,|,,}},,}}}..{,,,..(((((({,,({.((((((((({.(((.((.....(((.(((((....))))))))...)).))).))))))))).)))))))))....,}}}..))}))})}.(((((((((((........)))))))))))..})))))))))))))..)))))((,({{........})).}),......))))..))))))))))})).}.))))))).))).)))))))).))........)))))}.},..}})}).))))).,.))))..))).)))))).)))))..)))))}}))))))..)))}))))).....))))).)).))...))}}}}}}.,.........)))...)}),,
Back