Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0003100
Sequence Length
615 nt
GC Content
0.6309
GAACGCACUCCAGGACGAGAAGCGCCGCCUGGAGGCCCGGAUCGCCCAGCUGGAGGAGGAGCUGGAGGAGGAGCAGGGCAACAUGGAGGCCAUGAGCGACCGGGUCCGCAAAGCCACACAGCAGGCCGAGCAGCUCAGCAACGAGCUGGCCACAGAGCGCAGCACGGCCCAGAAGAAUGAGAGUGCCCGGCAGCAGCUCGAGCGGCAGAACAAGGAGCUCCGGAGCAAGCUCCACGAGAUGGAGGGGGCCGUCAAGUCCAAGUUCAAGUCCACCAUCGCGGCGCUGGAGGCCAAGAUUGCACAGCUGGAGGAGCAGGUCGAGCAGGAGGCCAGAGAGAAACAGGCGGCCACCAAGUCGCUGAAGCAGAAAGACAAGAAGCUGAAGGAAAUCUUGCUGCAGGUGGAGGACGAGCGCAAGAUGGCCGAGCAGUACAAGGAGCAGGCAGAGAAAGGCAAUGCCAGGGUCAAGCAGCUCAAGAGGCAGCUGGAGGAGGCAGAGGAGGAGUCCCAGCGCAUCAACGCCAACCGCAGGAAGCUGCAGCGGGAGCUGGAUGAGGCCACGGAGAGCAACGAGGCCAUGGGCCGCGAGGUGAACGCACUCAAGAGCAAGCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-218.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -227.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 148.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((.(((((((.((........)))))))))((((((.((((((((((........)))))).......((...))..(((((...))))).)))))))))).......((......)).((((....(((((......)))))))))...((((...(((((((((.............(((((((.(((..((.(..(....)..).))..))))))).)))..(((((.....))))).)))))))...))....))))..((.((((.(((((((.(....((((..(.((((...(((.((........)).))).((.((((..............)))).))..(((.(((...)))...))).....((((..((..(((((((.((..((.....))..)))))))))..))...))))..........((((..(.....)..)))).((.(((..((((((..(..((((((...((.(((.(..((...((....))...))..))))..))......))))))..)..))))))..)))..)).......)))))..))))..).))))))))))).))))..))..(((....)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((.(((((((.((........)))))))))((((((.((((((((((........))))))........{..,}}..(((((...))))).)))))))))),.,,...(((........))),,..((((((......)))))){{{.{.((((((.((.((((((,...........,,||||||}.}}.}||}..}.}}}.|,,|..|{{|||}|}|.||..,((({{.....|||}}.,||}}}},..})}}..})))..((.((((.(((((((.({{,.((((..,.((((.,.{((,,,....,,,.)}.})),|..|(((...........||||||}.}}..|||}|||...}}}...}}}.....((((..((..(((((((.((..((.....))..)))))))))..))...)))).....,..|.((((..{.....}..))))..,.(((..((((((..(..((((((...{(.(((.{.,((...,|,,..}},,.})..})))..)).,....))))))..)..))))))..))}{{||.{{....,,,,)}.))))..).))))))))))).}}))..))..(((....)))..
Back