Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0005200
Sequence Length
779 nt
GC Content
0.6033
UUCGAAAGGGAUCUCCAAGCCCGGGACGAGCAGAAUGAGGAGAAGAGGAGGCAACUGCAGAGACAGCUUCACGAGUAUGAGACGGAACUGGAAGACGAGCGAAAGCAACGUGCCCUGGCAGCUGCAGCAAAGAAGAAGCUGGAAGGGGACCUGAAAGACCUGGAGCUUCAGGCCGACUCUGCCAUCAAGGGGAGGGAGGAAGCCAUCAAGCAGCUACGCAAACUGCAGGCUCAGAUGAAGGACUUUCAAAGAGAGCUGGAAGAUGCCCGUGCCUCCAGAGAUGAGAUCUUUGCCACAGCCAAAGAGAAUGAGAAGAAAGCCAAGAGCUUGGAAGCAGACCUCAUGCAGCUACAAGAGGACCUCGCCGCCGCUGAGAGGGCUCGCAAACAAGCGGACCUCGAGAAGGAGGAACUGGCAGAGGAGCUGGCCAGUAGCCUGUCGGGAAGGAACGCACUCCAGGACGAGAAGCGCCGCCUGGAGGCCCGGAUCGCCCAGCUGGAGGAGGAGCUGGAGGAGGAGCAGGGCAACAUGGAGGCCAUGAGCGACCGGGUCCGCAAAGCCACACAGCAGGCCGAGCAGCUCAGCAACGAGCUGGCCACAGAGCGCAGCACGGCCCAGAAGAAUGAGAGUGCCCGGCAGCAGCUCGAGCGGCAGAACAAGGAGCUCCGGAGCAAGCUCCACGAGAUGGAGGGGGCCGUCAAGUCCAAGUUCAAGUCCACCAUCGCGGCGCUGGAGGCCAAGAUUGCACAGCUGGAGGAGCAGGUCGAGCAGGAGGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-265.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -278.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 195.61
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((((((((((.((((((..((..((..((..(..((((..(..((....)).....)..)))).)..)).))...))...)))).......((....))...((.((((..(((((.............)))))..)))).)).((((((.(((...(((((...((..((((.......))))..))...)))))((((..(.((((..(((...))).))))).)))).))).))))))......))))).)))).)))((.(((((((...((.((((((.(((.(((((...((...((.((..........(((((((((.((((.((((.((......)).))))..)).))((..((((((...(((((.......(((((((((((..(((....((((((((.....)).))))))..))).))))).......((.(((((((.((........)))))))))))((((.((((((((((........)))))).......((...))..(((((...))))).))))))))))))))...(((........))))))))..))))))..)).((((((......)).))))(((((((.............(((((((.(((..((.(..(....)..).))..))))))).)))..(((((.....))))).)))))))....)))))))))...))))...))...).))))..))).)))))).))...))))))).))...)))))(.((...)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({..{({{(((((,,{((({{{.{,..(({.....{,.,....,{((((..||,}.....,.})))).{.,{{.,....,,,.}))|}....,..((....))...((.((((..(((((.............)))))..)))).))|||...|.||||}.{{{{{...((..((((.,,....})))..)),..)}})){{((..{,((({..{{,...})).}))}|.}}}},,|}.||})},....}})}))},,}}}.}}|((.(((((((...((.((((((.(((.(((({...{,...{{.{,..........(((((((((......((((.((......)).))))..((((..(((((((.{..((((.({......(((,,(((({{.,,((.,..((((((((.....)),})))))..))).))},,..}}..}||.(((((((.((........)))))))))((((((.((((((((((........))))))........{..,}}..(((((...))))).))))))))))},))..)))).,.)))).)))))))((((((......))))))(({.,.{{{{{{.({,((((((............,,||||||}.}}.}||}..}.}}}.......{{{|||,,,,.,,.}})|||,...{{|||,,.,,,)))))...)))))))))..|}}},...))..,).))))..))).)))))).))...))))))).)).,,))}})|.{{...)).)
Back