Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0007400
Sequence Length
1410 nt
GC Content
0.5752
GCCCUGGAUGAAGAGACGCGGUCCCAUGAGGCUCAGGUCCAGGAGAUGAGGCAGAAACACGCACAGGCGGUGGAGGAGCUCACAGAGCAGCUUGAGCAGUUCAAGAGGGCCAAGGCGAACCUAGACAAGAAUAAGCAGACGCUGGAGAAAGAGAACGCAGACCUGGCCGGGGAGCUGCGGGUCCUGGGCCAGGCCAAGCAGGAGGUGGAACAUAAGAAGAAGAAGCUGGAGGCGCAGGUGCAGGAGCUGCAGUCCAAGUGCAGCGAUGGGGAGCGGGCCCGGGCGGAGCUCAAUGACAAAGUCCACAAGCUGCAGAAUGAAGUUGAGAGCGUCACAGGGAUGCUUAACGAGGCCGAGGGGAAGGCCAUUAAGCUGGCCAAGGACGUGGCGUCCCUCAGUUCCCAGCUCCAGGACACCCAGGAGCUGCUUCAAGAAGAAACCCGGCAGAAGCUCAACGUGUCUACGAAGCUGCGCCAGCUGGAGGAGGAGCGGAACAGCCUGCAAGACCAGCUGGACGAGGAGAUGGAGGCCAAGCAGAACCUGGAGCGCCACAUCUCCACUCUCAACAUCCAGCUCUCCGACUCGAAGAAGAAGCUGCAGGACUUUGCCAGCACCGUGGAAGCUCUGGAAGAGGGGAAGAAGAGGUUCCAGAAGGAGAUCGAGAACCUCACCCAGCAGUACGAGGAGAAGGCGGCCGCUUAUGAUAAACUGGAAAAGACCAAGAACAGGCUUCAGCAGGAGCUGGACGACCUGGUUGUUGAUUUGGACAACCAGCGGCAACUCGUGUCCAACCUGGAAAAGAAGCAGAGGAAAUUUGAUCAGUUGUUAGCCGAGGAGAAAAACAUCUCUUCCAAAUACGCGGAUGAGAGGGACAGAGCUGAGGCAGAAGCCAGGGAGAAGGAAACCAAGGCCCUGUCCCUGGCUCGGGCCCUUGAAGAGGCCUUGGAAGCCAAAGAGGAACUCGAGCGGACCAACAAAAUGCUCAAAGCCGAAAUGGAAGACCUGGUCAGCUCCAAGGAUGACGUGGGCAAGAACGUCCAUGAGCUGGAGAAGUCCAAGCGGGCCCUGGAGACCCAGAUGGAGGAGAUGAAGACGCAGCUGGAAGAGCUGGAGGACGAGCUGCAAGCCACGGAGGACGCCAAACUGCGGCUGGAAGUCAACAUGCAGGCGCUCAAGGGCCAGUUCGAAAGGGAUCUCCAAGCCCGGGACGAGCAGAAUGAGGAGAAGAGGAGGCAACUGCAGAGACAGCUUCACGAGUAUGAGACGGAACUGGAAGACGAGCGAAAGCAACGUGCCCUGGCAGCUGCAGCAAAGAAGAAGCUGGAAGGGGACCUGAAAGACCUGGAGCUUCAGGCCGACUCUGCCAUCAAGGGGAGGGAGGAAGCCAUCAAGCAGCUACGCAAACUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-492.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -516.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 306.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((.((((...(((((...((((((((((((((((....((((......((.(((....))))).......)))).....((((((((((.((((...(((((....))...)))...........(((....))).........))))))...(((((((.((((.(....).)))).)))))))....((((...(((((...........((..(((.(.(((.(.(.(.(....((((((.......)))))).....).).)).)))).)))....))...........)))))...))))........(((..(((((((.....))))))))))..((((........)))).))))))))((((......))))(((..(((((((((((((((.((....)).)))))))((((................))))((((((.(((....(((((((((((((((((.......((((......))))....)))))))).)).(((((((..(((....(((...)))....))).)))))))..((((..(((.(.((((((((..((......))..)....(((((((.(((((.((.(((((.((((..............)))).)))))...)).(((((((..((((..((((..(((((((.........((((((..........(((......))).....((((((((((....)))))).).)))(((((((......)))))))))))))..)))))).)....))))..........))))...)))))))....((((.((..((((.....((..(((((((......(((.((((((((((((.(((..((......((........))...))..))).)))))))).(((((((.((((.....(((.......)))...))))..)))))))..............))))...)))...)))))))..)).....))))..)).))))((((((......))))))..))))).)))))))...(((((..(((((((((....................(((((.....))))).....(((((((...(((...(((..((((....((((..((........)))))))))))))...))))))))))...))).)))))).)))))))).)))).).)))..))))...(.((....)).).....)))))))))).)).))))..))))))))..)))..((....))...((.((((..(((((.............)))))..)))).)))))...))))).))))))))))))).))))..)))).))))((.((......)).))..((((.........))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.((((.((((...(((((...(((((((((((((((((...{({(,{....,(,(((....)))}),.....{|||}..|,||,{({{{{{{.{{{{.....{{({..,{|,..}}|...........,{{...,}|||,.......}}}}}}.{.(((((((.((((.(....).)))).))))))).,..((((...(((((.........,.{{..(((.(.(((.(.{.(.(,...((((((.,...,.))))))..},.).}.}).)))).)))....)),..........)))))...))))........{{{,.{((((((.....)))))))}}}..((((........}))}.,},}}}))|||,.,,,|,}}})|||,.{((((((((((((((.((....)).))))))){(((.....,.....,,,,.}}})|{{{{{,({(,,..(((((((((((((((((....({.((......}))).)....)))))))).)).(((((((..(((....(((...)))....))).)))))))..((((..(((.{.(((((((...((......}}.,|,...(((((((.(((((.,(,(((,{((((((...{,,({{.....(((((((..({......))..))))))).})).,,..{,{{{(,,...,,..((((((..........(((......))).....((((((((((....)))))).).)))(((((((......)))))))))))))..)))})}|||..,{{|,........|}|,}},..,|{,{||.{,|{{|..{{{{(({{,......||||}||{......,|})),})}},|,,|||,|||..{||.,.{((((((((.,.((...,....,}))).)))))))))|{(({({{....}.))|}|{{{..}}},..{{{,..}))(((({...........}))))...,||,...,}}..,,}}}}})}.}))))}.))....(((((((......))))))).))))).)))))))...(((((..(((((((((..................,.(((((.....))))).....(((((((...(((...(((..((((....((((,.((....,},.}.)))))))))))...))))))))))...))).)))))).)))))))).)))).).)))..)))}...(.((....)).).....)))))))}}}.)).}))},,))))))))..,||,.((....))..,||.((((..(((((.............)))))..)))).}))))...)))))}})))))))))))).))))..)))).)))){{,(,......)).}}..((((.........))))..
Back