Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0007800
Sequence Length
573 nt
GC Content
0.5550
CAGUACGAGGAGAAGGCGGCCGCUUAUGAUAAACUGGAAAAGACCAAGAACAGGCUUCAGCAGGAGCUGGACGACCUGGUUGUUGAUUUGGACAACCAGCGGCAACUCGUGUCCAACCUGGAAAAGAAGCAGAGGAAAUUUGAUCAGUUGUUAGCCGAGGAGAAAAACAUCUCUUCCAAAUACGCGGAUGAGAGGGACAGAGCUGAGGCAGAAGCCAGGGAGAAGGAAACCAAGGCCCUGUCCCUGGCUCGGGCCCUUGAAGAGGCCUUGGAAGCCAAAGAGGAACUCGAGCGGACCAACAAAAUGCUCAAAGCCGAAAUGGAAGACCUGGUCAGCUCCAAGGAUGACGUGGGCAAGAACGUCCAUGAGCUGGAGAAGUCCAAGCGGGCCCUGGAGACCCAGAUGGAGGAGAUGAAGACGCAGCUGGAAGAGCUGGAGGACGAGCUGCAAGCCACGGAGGACGCCAAACUGCGGCUGGAAGUCAACAUGCAGGCGCUCAAGGGCCAGUUCGAAAGGGAUCUCCAAGCCCGGGACGAGCAGAAUGAGGAGAAGAGGAGGCAACUGCAGAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-180.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -190.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 140.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.........((((((..........(((......))).....((((((((((....)))))).).)))(((((((......)))))))))))))..))))).(((...(((.........))).)))...((((((((..(((..(((((((((......)))))))........(((.((((((((((((.(((..((......((........))...))..))).)))))))).(((((((.((((.....(((.......)))...))))..)))))))..............))))...)))....))..)))))))))))((((........(((((((......)))))))..(((.....((((...(((((..(((((((((....................(((((.....))))).....(((((((...(((...(((..((((....((((..((........)))))))))))))...))))))))))...))).)))))).)))))))))...))).............))))...))))(.......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(((.{...{..{(((((({........,(((......))}.....{(((((({{(,,,.|}||||,|.}||(((((((......)))))))))))}},.}||,|||||,.|{||.......,,|||.,|...,||,,||,|}||||.{{{,,((,,.......{{((,{((........))).}))).},,,,,.,})..})).,.{((((((((.,,((...,....,,))).)))))))))|((((({{...,}.))))},{|..,)),..{{{...)))|}}}}}.}}..,....),)))...{((....,}}....{{{,||{.{((({..,.....(((((((......))))))).,|||||...{|||...(((((..(((((((((..................,.(((((.....))))).....(((((((...(((...(((..((((....((((,.((....,},.}.)))))))))))...))))))))))...))).)))))).)))))))}},,}),}..}.,}}.........})).))))(.......)
Back