Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0008800
Sequence Length
1244 nt
GC Content
0.5852
UGCGGCUAAAGAAGGAAGAGAAGAGCCGACAGGAGCUGGAGAAGCUGAAACGGAAGCUGGAGGGUGAUGCCAGCGACUUCCACGAGCAGAUCGCUGACCUCCAGGCGCAGAUCGCAGAGCUCAAGAUGCAGCUGGCCAAGAAGGAGGAGGAGCUGCAGGCGGCCCUGGCCAGGCUUGACGAUGAAAUCGCUCAGAAGAACAAUGCCCUGAAGAAGAUCCGGGAGCUGGAGGGCCACAUCUCAGACCUCCAGGAGGACCUGGACUCAGAGCGGGCCGCCAGGAACAAGGCUGAAAAGCAGAAGCGAGACCUCGGCGAGGAGCUGGAGGCCCUAAAGACAGAGCUGGAAGACACACUGGACAGCACAGCCACUCAGCAGGAGCUCAGGGCCAAGAGGGAGCAGGAGGUGACGGUGCUGAAGAAGGCCCUGGAUGAAGAGACGCGGUCCCAUGAGGCUCAGGUCCAGGAGAUGAGGCAGAAACACGCACAGGCGGUGGAGGAGCUCACAGAGCAGCUUGAGCAGUUCAAGAGGGCCAAGGCGAACCUAGACAAGAAUAAGCAGACGCUGGAGAAAGAGAACGCAGACCUGGCCGGGGAGCUGCGGGUCCUGGGCCAGGCCAAGCAGGAGGUGGAACAUAAGAAGAAGAAGCUGGAGGCGCAGGUGCAGGAGCUGCAGUCCAAGUGCAGCGAUGGGGAGCGGGCCCGGGCGGAGCUCAAUGACAAAGUCCACAAGCUGCAGAAUGAAGUUGAGAGCGUCACAGGGAUGCUUAACGAGGCCGAGGGGAAGGCCAUUAAGCUGGCCAAGGACGUGGCGUCCCUCAGUUCCCAGCUCCAGGACACCCAGGAGCUGCUUCAAGAAGAAACCCGGCAGAAGCUCAACGUGUCUACGAAGCUGCGCCAGCUGGAGGAGGAGCGGAACAGCCUGCAAGACCAGCUGGACGAGGAGAUGGAGGCCAAGCAGAACCUGGAGCGCCACAUCUCCACUCUCAACAUCCAGCUCUCCGACUCGAAGAAGAAGCUGCAGGACUUUGCCAGCACCGUGGAAGCUCUGGAAGAGGGGAAGAAGAGGUUCCAGAAGGAGAUCGAGAACCUCACCCAGCAGUACGAGGAGAAGGCGGCCGCUUAUGAUAAACUGGAAAAGACCAAGAACAGGCUUCAGCAGGAGCUGGACGACCUGGUUGUUGAUUUGGACAACCAGCGGCAACUCGUGUCCAACCUGGAAAAGAAGCAGAGGAAAUUUGAUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-437.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -456.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 362.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((................))))).)).((((((((((.(((...((((..((((((((((..(((.(((..((((..(((((((....))).((((((((((...((((..(((((.....(((((((..((........))...)))))))(((.......))).)))))..)))).....)))..............(((.((......)).)))..)))))))(((.((((((...((((...))))..(((((((..(((((((((.((((.......(((((...((....))......)))))......)))).)))))..........((((..((.....))...)))).......((((...(((.(((((((((.......((((...(....)..))))......))))))))............).)))..)))))))).))))))))))))).)))....((.(((....)))))(((((.((((...))))..(((((.....)))))(((((....))...)))..................((((((....((((.(((((.(((((((.((((.(....).)))).)))))))....((((...(((((...........((..(((.(.(((.(.(.(.(....((((((.......)))))).....).).)).)))).)))....))...........)))))...))))(((.....((((((((((((.....)))))).......((((.(((((((((((......)))))..(((((...))))).....))))(((((((.((....)).))))))).(((.....))).)))))).....))))))...)))......)))))((((((((.......((((......))))....))))))))....(((((((..(((....(((...)))....))).)))))))..))))....)))))))))))..))))..))))..))))))..))))).))))).))))...))))))...............(((((((..((......))..)))))))..)))))..((((((.........((((((..........(((......))).....((((((((((....)))))).).)))(((((((......)))))))))))))..))))))((((...)))).......((((.....)))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,(((((................))))),|,.{,(((((,{.{(((...((((..((((((((((..((,{(((..((((..((((({(,,,{|||.(((((,{((,{...{{{|.{,({{{....{{{((((,,((.....,,.}}.,,}}|||}}{{{{{((({{{{{{{{|{(({(({{...}))).))}..........{({({(,......{{{|{|..|{||{{{,,{.,,,,,,...||||}}},.,,.)))))}||}}|.||{|||||||{{.......((({,...{{....))..,..,))})).....,)))),))}}}........,.((((..,{.....||,..}}}}.,,|||.{{{{,|.,|,}||{|||||{.......((({...{....},.)}))......)))}}|||,,,..,,,..,,|{|||{.||||||||{|||}},,,,},||,|}|....,(.(((....)))})},,,..{|||,..}}}}.})))}}})..}))}.},))))}..{||...}}|.,,,.......{{{....{({{{,....,,,,.|,|,{.(((((((.((((.(....).)))).))))))),}..((((...(((((.........,.,{..(((.(.(((.(.{.(.(,...((((((.,.....))))))..},.}.}.}).)))).)))....)),..........)))))...)))).....,..(((({(((((((...,,|}}||||,,,,,,(((,.,,,,..{(({{.....,})}))..{{,||}}})))))}},.,})},{((((((.((....)).))))))}{{{{.....},..,}))))....))),..,,}}))),.}.,})),|{((((((((....{{.((......}))).)....)))))))).}}.(((((((..(((....(((...)))....))).))))))).,))))..}.))))))}})}},.))))..))))..))))))..))))).))))).))))...))))||........,......(((((((..((......))..)))))))..)))))..{{({{(.........((((((..........(((......)))....,((((((((((....)))))).).)))(((((((......)))))))))))))..)))))}|||,..||},,.......||{{.....}}}}.}).,
Back