Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0011000
Sequence Length
1447 nt
GC Content
0.5701
GGCUUUUGCCAAGAGGCAGCAGCAGCUGACCGCCAUGAAGGUGAUUCAGAGGAACUGCGCCGCCUACCUCAAGCUGCGGAACUGGCAGUGGUGGAGGCUUUUCACCAAAGUGAAGCCACUGCUGCAGGUGACACGGCAGGAGGAGGAGAUGCAGGCCAAGGAGGAUGAACUGCAGAAGACCAAGGAGCGGCAGCAGAAGGCAGAGAAUGAGCUUAAGGAGCUGGAACAGAAGCACUCGCAGCUGACCGAGGAGAAGAACCUGCUACAGGAACAGCUGCAGGCAGAGACAGAGCUGUAUGCAGAGGCUGAGGAGAUGCGGGUGCGGCUGGCGGCCAAGAAGCAGGAGCUGGAGGAGAUACUGCAUGAGAUGGAGGCCCGCCUGGAGGAGGAGGAAGACAGGGGCCAGCAGCUACAGGCUGAAAGGAAGAAGAUGGCCCAGCAGAUGCUGGACCUUGAAGAACAGCUGGAGGAGGAGGAAGCUGCCAGGCAGAAGCUGCAACUUGAGAAGGUCACGGCUGAGGCCAAGAUCAAGAAACUGGAGGAUGAGAUCCUGGUCAUGGAUGAUCAGAACAAUAAACUAUCAAAAGAACGAAAACUCCUUGAGGAGAGGAUUAGUGACUUAACGACAAAUCUUGCAGAAGAGGAAGAAAAGGCCAAGAAUCUUACCAAGCUGAAAAACAAGCAUGAAUCUAUGAUUUCAGAACUGGAAGUGCGGCUAAAGAAGGAAGAGAAGAGCCGACAGGAGCUGGAGAAGCUGAAACGGAAGCUGGAGGGUGAUGCCAGCGACUUCCACGAGCAGAUCGCUGACCUCCAGGCGCAGAUCGCAGAGCUCAAGAUGCAGCUGGCCAAGAAGGAGGAGGAGCUGCAGGCGGCCCUGGCCAGGCUUGACGAUGAAAUCGCUCAGAAGAACAAUGCCCUGAAGAAGAUCCGGGAGCUGGAGGGCCACAUCUCAGACCUCCAGGAGGACCUGGACUCAGAGCGGGCCGCCAGGAACAAGGCUGAAAAGCAGAAGCGAGACCUCGGCGAGGAGCUGGAGGCCCUAAAGACAGAGCUGGAAGACACACUGGACAGCACAGCCACUCAGCAGGAGCUCAGGGCCAAGAGGGAGCAGGAGGUGACGGUGCUGAAGAAGGCCCUGGAUGAAGAGACGCGGUCCCAUGAGGCUCAGGUCCAGGAGAUGAGGCAGAAACACGCACAGGCGGUGGAGGAGCUCACAGAGCAGCUUGAGCAGUUCAAGAGGGCCAAGGCGAACCUAGACAAGAAUAAGCAGACGCUGGAGAAAGAGAACGCAGACCUGGCCGGGGAGCUGCGGGUCCUGGGCCAGGCCAAGCAGGAGGUGGAACAUAAGAAGAAGAAGCUGGAGGCGCAGGUGCAGGAGCUGCAGUCCAAGUGCAGCGAUGGGGAGCGGGCCCGGGCGGAGCUCAAUGACAAAGUCCACAAGCUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-491.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -512.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 342.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((....)))))...(..((((.((((.....))))..))))..)..(((((((((((.((((..((((.(..(((.((((((((((.....((((((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))).((...(((((..((.......))..))))).....))..)).))))).))))..(((((........(((....(((((...(((..(((((((((.((..((..((.......((((...))))..(..(((((.((((........)))).)))))..)))..)))).)))))))))..)))((..(((....((((...((.....))...))))......)))..))((.(((.....))).))....(((((.(((((((((...((((..............)))).)))...)))))).))))).....)))))....))).......))))).(((...(((((((.((((((..((((..(((....)))..))))......(((((((.((((((((((((((....)))))))...........................((((....))))((((((..((.(((.........((((....))))........))).))..))))))..((.(((........))).)).......)))))))....(((((((.(((((................)))))......(((((....(((....(((...)))...)))....))))).)))))))..(((.....)))..)))))))(((.....)))....)))))).))))))).))).....((...((((.((((((....(((((((((((.(((.((.........(((...........(((((........(((((...)))))..(((.((((((...((((...))))..(((((((..(((((((((.((((.......(((((...((....))......)))))......)))).)))))..........((((..((.....))...)))).......((((...(((.(((((((((.......((((...(....)..))))......))))))))............).)))..)))))))).))))))))))))).)))....((.(((....)))))......((((...))))..(((((.....))))))))))..(((....)))...........(((....))).)))........))))).)))))))))))..)))))).))))...)))))))..((((...(((((...........((..(((.(.(((.(.(.(.(....((((((.......)))))).....).).)).)))).)))....))...........)))))...))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((....|||||{..,.||||,|({((.,...}}|,.|||},.,}..(((((((((((.((((..((((.(..(((.((((((((((..,{,(({(((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))),||...(((((..({.......})..))))).....))..}}.))))).))))..|||||....,.,{(((...,||||{...(((..(((((((((.((..((..({.......((((...))))..(,,(((((.((((........)))).)))))..))),.))}).)))))))))..))),{.,||,....((((...((.....))...)))).,....}|,.{||(({((({{...,,,.,,....(((((.(((((((((...((((,.............)))).})}...)))))).))))).....|||||....,.,.....,}))))),|||...(((((((.((((((..((((..(((....)))..))))......(((((((.,{,(((((((((({....}}}}}}}............|{.............((((....))))((((((..((.(({.........((((....}})),...,...})}.))..))))))..{{.(((........))).}|.,.....}}})))}....{(({{((,(((((................))))).}...,((({{...,|||....,{{..{|||,..},}....))))).})))))).||.|.},}},},..)))))))(((.....)))....)))))).))))))).}||.....||...((((.((((({,{..(((((((((((,(((,(({{...,}}},||}..........(({(({.......{((({|..|||||{{{{{.{{{{{{...|||||}},.,,.||||||{||||,||(((((.((((.......(((({...((....))......|))))......)))).)))))..........((((..{(.....})...)))).}}||,.(({,.,.||,}|{(((((((.......((((...(....)..))))......)))))))}..........}}||||||.|||}|||||||}}},,},},||.|}}.....(,(((....)))})},,,..{|||,..}}}}.,)))}}})..}))}.},))))}.,{|,,..})}...........{((....))).,.,........}})}}.))))))))))).})))))).)))),}}))}))))..((((...(((((.........,.{{..(((.(.(((.(.{.(.(,...((((((.,...,.))))))..},.).}.}).)))).)))....)),..........)))))...))))..
Back