Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0013100
Sequence Length
1787 nt
GC Content
0.5713
UGGACCGCAUCGUGGGCCUGGACCAGAUGGCCAAGAUGACGGAGAGCUCGCUGCCCAGCGCCUCCAAGACCAAGAAGGGCAUGUUCCGCACAGUGGGGCAGCUGUACAAGGAGCAGCUGGGCAAGCUGAUGACCACGCUACGCAACACCACGCCCAACUUCGUGCGCUGCAUCAUCCCCAACCACGAGAAGAGGUCCGGCAAGCUGGAUGCGUUCCUGGUGCUGGAGCAGCUGCGGUGCAAUGGGGUGCUGGAAGGCAUUCGCAUCUGCCGGCAGGGCUUCCCCAACCGGAUCGUCUUCCAGGAGUUCCGCCAACGCUACGAGAUCCUGGCGGCGAAUGCCAUCCCCAAAGGCUUCAUGGACGGGAAGCAGGCCUGCAUUCUCAUGAUCAAAGCCCUGGAACUUGACCCCAACUUAUACAGGAUAGGGCAGAGCAAAAUCUUCUUCCGAACUGGCGUCCUGGCCCACCUAGAGGAGGAGCGAGAUUUGAAGAUCACCGAUGUCAUCAUGGCCUUCCAGGCGAUGUGUCGUGGCUACUUGGCCAGAAAGGCUUUUGCCAAGAGGCAGCAGCAGCUGACCGCCAUGAAGGUGAUUCAGAGGAACUGCGCCGCCUACCUCAAGCUGCGGAACUGGCAGUGGUGGAGGCUUUUCACCAAAGUGAAGCCACUGCUGCAGGUGACACGGCAGGAGGAGGAGAUGCAGGCCAAGGAGGAUGAACUGCAGAAGACCAAGGAGCGGCAGCAGAAGGCAGAGAAUGAGCUUAAGGAGCUGGAACAGAAGCACUCGCAGCUGACCGAGGAGAAGAACCUGCUACAGGAACAGCUGCAGGCAGAGACAGAGCUGUAUGCAGAGGCUGAGGAGAUGCGGGUGCGGCUGGCGGCCAAGAAGCAGGAGCUGGAGGAGAUACUGCAUGAGAUGGAGGCCCGCCUGGAGGAGGAGGAAGACAGGGGCCAGCAGCUACAGGCUGAAAGGAAGAAGAUGGCCCAGCAGAUGCUGGACCUUGAAGAACAGCUGGAGGAGGAGGAAGCUGCCAGGCAGAAGCUGCAACUUGAGAAGGUCACGGCUGAGGCCAAGAUCAAGAAACUGGAGGAUGAGAUCCUGGUCAUGGAUGAUCAGAACAAUAAACUAUCAAAAGAACGAAAACUCCUUGAGGAGAGGAUUAGUGACUUAACGACAAAUCUUGCAGAAGAGGAAGAAAAGGCCAAGAAUCUUACCAAGCUGAAAAACAAGCAUGAAUCUAUGAUUUCAGAACUGGAAGUGCGGCUAAAGAAGGAAGAGAAGAGCCGACAGGAGCUGGAGAAGCUGAAACGGAAGCUGGAGGGUGAUGCCAGCGACUUCCACGAGCAGAUCGCUGACCUCCAGGCGCAGAUCGCAGAGCUCAAGAUGCAGCUGGCCAAGAAGGAGGAGGAGCUGCAGGCGGCCCUGGCCAGGCUUGACGAUGAAAUCGCUCAGAAGAACAAUGCCCUGAAGAAGAUCCGGGAGCUGGAGGGCCACAUCUCAGACCUCCAGGAGGACCUGGACUCAGAGCGGGCCGCCAGGAACAAGGCUGAAAAGCAGAAGCGAGACCUCGGCGAGGAGCUGGAGGCCCUAAAGACAGAGCUGGAAGACACACUGGACAGCACAGCCACUCAGCAGGAGCUCAGGGCCAAGAGGGAGCAGGAGGUGACGGUGCUGAAGAAGGCCCUGGAUGAAGAGACGCGGUCCCAUGAGGCUCAGGUCCAGGAGAUGAGGCAGAAACACGCACAGGCGGUGGAGGAGCUCACAGAGCAGCUUGAGCAGUUCAAGAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-636.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -665.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 548.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((((((((((((.((((..((((...........((((((((((((((((..((((..(((.......(((.((((((((...))))))))))))).)..))))..))))))))(((((.(((((..((...))....((((((((.......(((((((((...(((...((((.(.(((...((((((....))))))...))))))))...))).....)))))))))...))))).)))...(((...((.((((((((((..((((((((....)).((.((((((((..((((((((...((((........))))))))....((.((((((...(((((........))))).(((((.(((.(((((.......((((((...((((.............)))).))))))...(((..(((((((((......(((.(((((((((.((....)).)).))..((((....)))).((.(((.((.(((.((((...)))).))))).)))))((.(((((((......(((.(((((....))))).)))..((((.((((.....))))..)))).....(((((((((((.((((..((((.(..(((.((((((((((.....((((((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))).((...(((((..((.......))..))))).....))..)).))))).)))).............(((((...)))))....(((..(((((((((.((..((..((.......((((...))))..(..(((((.((((........)))).)))))..)))..)))).)))))))))..)))..))))))).)))))))))))))))))))..))))))))))).)))))....))).))))).......(((((.(((((((((...((((..............)))).)))...)))))).)))))..))))..)))))))).)))))))))))).)))))).)))))..........))))))))))........((((......(((((((.((((((((((((((....)))))))...........................((((....))))((((((..((.(((.........((((....))))........))).))..))))))..((.(((........))).)).......)))))))....(((((((.(((((................)))))......(((((....(((....(((...)))...)))....))))).)))))))..(((.....)))..))))))).....)))))).))))))....(((((((..((........))...)))))))...)))))))))))))))).))))))...)))((.....((((....(((.((......)).))).(((.(((.(((.((((((...((((...))))..(((((((..(((((((((.((((.......(((((...((....))......)))))......)))).)))))..........((((..((.....))...)))).......((((...(((.(((((((((.......((((...(....)..))))......))))))))............).)))..)))))))).))))))))))))).)))....((.(((....)))))......((((...))))..))).))).))))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{.(((((((,{,(((({{{.{{{,..||||..}}}}.}}}.((((((((((((((((..((((...,{.......(((.((((((((...))))))))))),}.,..))))..)))))))}|||{{.,,.,|..{{,..||....(((((((,.....,{(((((((({,(,(({{,.((((.{.({{...((((((....))))))...)))})))),,,}}|{,.,,|||}}}}}}.,||||||{|}}..}))}}}}||,|{|((({(({,,{((((({{..,,||.((.((((((((,.((((((((...((({.,....|,})))|||}...,((.(((((,..,(((((..,,..,,|}}||.{((((.((||(((((,......((((((...((((.............)))).))))))...{{{..((((((((((...{{(((.(((((((((.((....)).)).))..{,((,,..,|||,((.,{{.({.(((.((((...}))).)))}}{||||{({.(((((((,,....{{|,|{|||,,,.|||||,}}}.||||.|||||,|,,.}}}},|}}}}.,,..((((({({(((.((((..((((.(..(((.((((((((((..,{,(({(((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))),||...{((((..{{.......}}..))))}.....))..}}.))))).)))}....|......,.(((((...))))).,..(((..(((((((((.((..((..({.......((((...))))..(,,(((((.((((........)))).)))))..))),.))}).)))))))))..)))..)))))}).}})}}},})}))))))))}..))))))))))).)))))},}})}},)),}}.,,....||||{,|{||(((((...||||}...,,..,..,,}}))|{|||...}))))).))}))..)}}}..))))}))),)}))}})))))).))))}}{||{||{.((((({..((((..|||....)))..||}}......(((((((.{{{((({(((((({....}))))))............|{.............((((....))))((((((..((.(({.........((((....}})),...,...})}.))..))))))..{{.(((........))).||.,.,...}}}}})}....{(({{((,(((((................))))).}...,((({{...}|||....,{{..{|||,..},}....))))).})))))).,|,|,},}},}}..))))))){{{..,,,))).,,,)))}}}.|||||||.,((.....,..}}.||}}))|},,,}}))}))))))}}))||{|||||,..,})),||,...,......,{|{|||,,..,.|||}}|..(({((({,,,...,,,,...)))))))..{{{|((({,({{{,.{,((((({({,,......{((((,...((....))..,.{{|||||.....})))),))}}}..........((((..((.....))...)))).}}}}}.{{{,,,.,},)}|(((((((.......((((...{....)..))))......)))))))}..........)))))))}.)))),|})}))))).}).)}))},)),,...{.|||.,.,))}}))|.,,,||||...},)|..|||||}}.,)))},}..}
Back