Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MYH11_0015400

Sequence Length

882 nt

GC Content

0.5499

GGCUUUUGCCAAGAGGCAGCAGCAGCUGACCGCCAUGAAGGUGAUUCAGAGGAACUGCGCCGCCUACCUCAAGCUGCGGAACUGGCAGUGGUGGAGGCUUUUCACCAAAGUGAAGCCACUGCUGCAGGUGACACGGCAGGAGGAGGAGAUGCAGGCCAAGGAGGAUGAACUGCAGAAGACCAAGGAGCGGCAGCAGAAGGCAGAGAAUGAGCUUAAGGAGCUGGAACAGAAGCACUCGCAGCUGACCGAGGAGAAGAACCUGCUACAGGAACAGCUGCAGGCAGAGACAGAGCUGUAUGCAGAGGCUGAGGAGAUGCGGGUGCGGCUGGCGGCCAAGAAGCAGGAGCUGGAGGAGAUACUGCAUGAGAUGGAGGCCCGCCUGGAGGAGGAGGAAGACAGGGGCCAGCAGCUACAGGCUGAAAGGAAGAAGAUGGCCCAGCAGAUGCUGGACCUUGAAGAACAGCUGGAGGAGGAGGAAGCUGCCAGGCAGAAGCUGCAACUUGAGAAGGUCACGGCUGAGGCCAAGAUCAAGAAACUGGAGGAUGAGAUCCUGGUCAUGGAUGAUCAGAACAAUAAACUAUCAAAAGAACGAAAACUCCUUGAGGAGAGGAUUAGUGACUUAACGACAAAUCUUGCAGAAGAGGAAGAAAAGGCCAAGAAUCUUACCAAGCUGAAAAACAAGCAUGAAUCUAUGAUUUCAGAACUGGAAGUGCGGCUAAAGAAGGAAGAGAAGAGCCGACAGGAGCUGGAGAAGCUGAAACGGAAGCUGGAGGGUGAUGCCAGCGACUUCCACGAGCAGAUCGCUGACCUCCAGGCGCAGAUCGCAGAGCUCAAGAUGCAGCUGGCCAAGAAGGAGGAGGAGCUGCAGGCGGCCCUGGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-289.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -300.54

Frequency: 0.0000

Diversity: 219.77

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((..((((....))))((.((((((..((.((.((((.....))))......(((((((((((.((((..((((.(..(((.((((((((((.....((((((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))).((...(((((..((.......))..))))).....))..)).))))).))))..(((((........(((....(((((...(((..(((((((((.((..((..((.......((((...))))..(..(((((.((((........)))).)))))..)))..)))).)))))))))..)))((..(((....((((...((.....))...))))......)))..))((.(((.....))).))....(((((.(((((((((...((((..............)))).)))...)))))).))))).....)))))....))).......))))).(((...(((((((.((((((..((((..(((....)))..))))......(((((((.((((((((((((((....)))))))...........................((((....))))((((((..((.(((.........((((....))))........))).))..))))))..((.(((........))).)).......)))))))....(((((((.(((((................)))))......(((((....(((....(((...)))...)))....))))).)))))))..(((.....)))..)))))))(((.....)))....)))))).))))))).))).....)).))...))))))..))))))((....))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((,{((((....||||((.{{,{((,.{(,((.{{{{,,,..}}}}..,,..(((((((((((.((((..((((.(..(((.((((((((((..,{,(({(((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))).|{...(((((..((.......))..))))).....))..}}.))))).))))..{(({{....,.,,(((...,({(((...(((..(((((((((.((..((..({.......((((...))))..(,,(((((.((((........)))).)))))..))),.))}).)))))))))..)))((..(((....((((...((.....))...)))).,....)))..)){(,(((,....}}}.}}....(((((.(((((((((...((((,.............)))).})}...)))))).))))).....)}}})....}}}.......))))).(((...{((((((.((((((..((((..(((....)))..}}))......(((((((.,,,((({(((((({....}))))}}............|{.............((((....))))((((((.,({.{{{.....,...((((....}})),,,.,...})}.)}..}})))).,|,.(((........))).||,,.,...}}})))}....{(({{((,(((((................))))).}...,((({{...}|||....,{{..{|||,..},,....))))).})))))).|{.|.,,}}})}..))))))){{{,.,..)})....)))))).)))}}||.|||........}}.,,})))))..})))))||,,,,))