Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MYH11_0015500

Sequence Length

1043 nt

GC Content

0.5455

AUCAAAGCCCUGGAACUUGACCCCAACUUAUACAGGAUAGGGCAGAGCAAAAUCUUCUUCCGAACUGGCGUCCUGGCCCACCUAGAGGAGGAGCGAGAUUUGAAGAUCACCGAUGUCAUCAUGGCCUUCCAGGCGAUGUGUCGUGGCUACUUGGCCAGAAAGGCUUUUGCCAAGAGGCAGCAGCAGCUGACCGCCAUGAAGGUGAUUCAGAGGAACUGCGCCGCCUACCUCAAGCUGCGGAACUGGCAGUGGUGGAGGCUUUUCACCAAAGUGAAGCCACUGCUGCAGGUGACACGGCAGGAGGAGGAGAUGCAGGCCAAGGAGGAUGAACUGCAGAAGACCAAGGAGCGGCAGCAGAAGGCAGAGAAUGAGCUUAAGGAGCUGGAACAGAAGCACUCGCAGCUGACCGAGGAGAAGAACCUGCUACAGGAACAGCUGCAGGCAGAGACAGAGCUGUAUGCAGAGGCUGAGGAGAUGCGGGUGCGGCUGGCGGCCAAGAAGCAGGAGCUGGAGGAGAUACUGCAUGAGAUGGAGGCCCGCCUGGAGGAGGAGGAAGACAGGGGCCAGCAGCUACAGGCUGAAAGGAAGAAGAUGGCCCAGCAGAUGCUGGACCUUGAAGAACAGCUGGAGGAGGAGGAAGCUGCCAGGCAGAAGCUGCAACUUGAGAAGGUCACGGCUGAGGCCAAGAUCAAGAAACUGGAGGAUGAGAUCCUGGUCAUGGAUGAUCAGAACAAUAAACUAUCAAAAGAACGAAAACUCCUUGAGGAGAGGAUUAGUGACUUAACGACAAAUCUUGCAGAAGAGGAAGAAAAGGCCAAGAAUCUUACCAAGCUGAAAAACAAGCAUGAAUCUAUGAUUUCAGAACUGGAAGUGCGGCUAAAGAAGGAAGAGAAGAGCCGACAGGAGCUGGAGAAGCUGAAACGGAAGCUGGAGGGUGAUGCCAGCGACUUCCACGAGCAGAUCGCUGACCUCCAGGCGCAGAUCGCAGAGCUCAAGAUGCAGCUGGCCAAGAAGGAGGAGGAGCUGCAGGCGGCCCUGGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-346.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -361.86

Frequency: 0.0000

Diversity: 237.35

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((((...((((.............)))).))))))........((((((((((...(((((.(((((((((.((....)).)).))..((((....)))).((.(((....))))).((((((((((..((.((...(((.(((((((......(((.(((((....))))).)))..((((.((((.....))))..)))).....(((((((((((.((((..((((.(..(((.((((((((((.....((((((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))).((...(((((..((.......))..))))).....))..)).))))).)))).............(((((...)))))....(((..(((((((((.((..((..((.......((((...))))..(..(((((.((((........)))).)))))..)))..)))).)))))))))..)))..))))))).)))......((.((......)).)).......)).)).))))))))))..........))))))))))(((((...)))))...))))))))))((.(((((....))))).))...........((((......(((..((((((..((((.(((((((.((((((..((((..(((....)))..))))......(((((((.((((((((((((((....)))))))...........................((((....))))((((((..((.(((.........((((....))))........))).))..))))))..((.(((........))).)).......)))))))....(((((((.(((((................)))))......(((((....(((....(((...)))...)))....))))).)))))))..(((.....)))..)))))))(((.....)))....)))))).)))))))..((........)).....)))).)))))))))..))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

......((((((...((((.............)))).)))))).,.,....((((((((((...(((((.(((({((((.((....)).)).)).,|{{{....,}}}.{{.,(({{.,|,}.,{((((((((((..{(.((,{.(((.(((((((......(((.{((((....}))}|,}}}.|(((,|((((.,...|||,.|||},.,{..((((({({(((.((((..((((.(..(((.((((((((((..,{,(({(((....)))))))))))))))).)))..).))))..))))}||...|||||.,|,.,.,,..,}..))})}.....))..,}.))))),))}}....|......|.(((((...))))).,..(((..(((((((((.((..((..({.......((((...))))..(,,(((((.((((........)))).)))))..))),.))}).)))))))))..))).,)))))}).}||{,...{(,.,,.,}...))}),.....,,)}.)),)))))))))).}...},.,,))))))))))(((((...)))))...))))))))))((,(((((....))))).||{{......,,,{{,|,.,..,{{,..{(((({.,(({{.(((((((.((((((..((((..(((....)))..))))......(((((((.,{,(((((((((({....}}}}}}}............|{.............((((....))))((((((..((.(({.........((((....}})),...,...})}.))..))))))..{{.(((........))).}|.,.....}}})))}....{(({{((,(((((................))))).}...,((({{...,|||....,{{..{|||,..},}....))))).})))))).}|.|.},}},},..)))))))(((.....)))....)))))).))))))).,((.....,..,..,,.,|}|}.))))))))),,))},