Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0016400
Sequence Length
1372 nt
GC Content
0.5583
GUGGACUAUAAUGCGAGUGCCUGGCUGACCAAGAAUAUGGACCCGCUGAAUGACAACGUGACUUCCCUGCUCAAUGCCUCCUCCGACAAGUUUGUGGCCGACCUGUGGAAGGACGUGGACCGCAUCGUGGGCCUGGACCAGAUGGCCAAGAUGACGGAGAGCUCGCUGCCCAGCGCCUCCAAGACCAAGAAGGGCAUGUUCCGCACAGUGGGGCAGCUGUACAAGGAGCAGCUGGGCAAGCUGAUGACCACGCUACGCAACACCACGCCCAACUUCGUGCGCUGCAUCAUCCCCAACCACGAGAAGAGGUCCGGCAAGCUGGAUGCGUUCCUGGUGCUGGAGCAGCUGCGGUGCAAUGGGGUGCUGGAAGGCAUUCGCAUCUGCCGGCAGGGCUUCCCCAACCGGAUCGUCUUCCAGGAGUUCCGCCAACGCUACGAGAUCCUGGCGGCGAAUGCCAUCCCCAAAGGCUUCAUGGACGGGAAGCAGGCCUGCAUUCUCAUGAUCAAAGCCCUGGAACUUGACCCCAACUUAUACAGGAUAGGGCAGAGCAAAAUCUUCUUCCGAACUGGCGUCCUGGCCCACCUAGAGGAGGAGCGAGAUUUGAAGAUCACCGAUGUCAUCAUGGCCUUCCAGGCGAUGUGUCGUGGCUACUUGGCCAGAAAGGCUUUUGCCAAGAGGCAGCAGCAGCUGACCGCCAUGAAGGUGAUUCAGAGGAACUGCGCCGCCUACCUCAAGCUGCGGAACUGGCAGUGGUGGAGGCUUUUCACCAAAGUGAAGCCACUGCUGCAGGUGACACGGCAGGAGGAGGAGAUGCAGGCCAAGGAGGAUGAACUGCAGAAGACCAAGGAGCGGCAGCAGAAGGCAGAGAAUGAGCUUAAGGAGCUGGAACAGAAGCACUCGCAGCUGACCGAGGAGAAGAACCUGCUACAGGAACAGCUGCAGGCAGAGACAGAGCUGUAUGCAGAGGCUGAGGAGAUGCGGGUGCGGCUGGCGGCCAAGAAGCAGGAGCUGGAGGAGAUACUGCAUGAGAUGGAGGCCCGCCUGGAGGAGGAGGAAGACAGGGGCCAGCAGCUACAGGCUGAAAGGAAGAAGAUGGCCCAGCAGAUGCUGGACCUUGAAGAACAGCUGGAGGAGGAGGAAGCUGCCAGGCAGAAGCUGCAACUUGAGAAGGUCACGGCUGAGGCCAAGAUCAAGAAACUGGAGGAUGAGAUCCUGGUCAUGGAUGAUCAGAACAAUAAACUAUCAAAAGAACGAAAACUCCUUGAGGAGAGGAUUAGUGACUUAACGACAAAUCUUGCAGAAGAGGAAGAAAAGGCCAAGAAUCUUACCAAGCUGAAAAACAAGCAUGAAUCUAUGAUUUCAGAACUGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-478.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -501.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.....((((..((...(((((....((((...(((.(((((...........))).(((((((((........(((((((.....(((((((((....((((...((.(((((.(((((((...((((..........))))..)))).)))..((((...((((((((..((((..(((.......(((.((((((((...))))))))))))).)..))))..)))))))))))).....))))))).))))...((((((((.......(((((((((...(((...((((.(.(((...((((((....))))))...))))))))...))).....)))))))))...))))).)))...((....)).((((((((((..((((((((....)).((.((((((((..((((((((...((((........))))))))....((.((((((...(((((........))))).(((((.(((.(((((.......((((((...((((.............)))).))))))...(((..(((((((((......(((.(((((((((.((....)).)).))..((((....)))).((.(((.((.(((.((((...)))).))))).)))))((.(((((((......(((.(((((....))))).)))..((((.((((.....))))..)))).....(((((((((((.((((..((((.(..(((.((((((((((.....((((((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))).((...(((((..((.......))..))))).....))..)).))))).)))).............(((((...)))))....(((..(((((((((.((..((..((.......((((...))))..(..(((((.((((........)))).)))))..)))..)))).)))))))))..)))..))))))).)))))))))))))))))))..))))))))))).)))))....))).))))).......(((((.(((((((((...((((..............)))).)))...)))))).)))))..))))..)))))))).)))))))))))).))))))(((((..((((....))))..)))))..)))))....))))....))))))).......(((((((....)))))))...........................((((....))))((((((.((.........)).))))))))))....)))))....)))))....))))....)))))....))..))))...)))))..(((((....))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({.....{(((((((((((((({,.,{{,{....|||.,,{{{{,........,}}}.,,|||,||,||,..}||((((((.,((.(((,{.,,,,}}}.}}}}).}))}(((((.(((((((...((((..........))))..)))).)))..{{{(.{{((((((((..((((...,{.......(((.((((((((...))))))))))),}.,..))))..))))))))))),.....))))),...,,....((((((((.....,,(((((((((.,.(((...((((.(.(((...((((((....))))))...)))}))))...)))...,.))))))))).,}))))).))).})))))))))}{(((((((({.,((((((((....}}.((.((((((((..((((((((...((((.{....,.))))))))...{((.(({((...,(((((......,,))}}}.(((((.(({{(((((,......((((((...((((.............)))).))))))...{{{..((((((((((...,,(((.(((((((((.((....)).)).))..{,((,,,.}|||,((.{{{.((.(((.((((...)))).))))){|||||(,.(((((((,,,...{{|,|||||,,,.|||||{,}}.||||.|||||,},,.)))},}))}}.,,..((((({({(((.((((..((((.(..(((.((((((((((..,{,(({(((....)))))))))))))))).)))..).))))..)))),||...|||||..|{....,..})..))))}.....))..}}.))))).))}}...,|......,.(((((...))))).,..(((..(((((((((.((..((..({.......((({...))))..(,,(((((.((((........)))).)))))..))),.))}).)))))))))..))).,)))))}).}})}))}})})))))))))..))))))))))).))))),,}})}}.))}}),,,....{{{|{.(((((((((...{||||............,)))|,|||...}))))).))}}}..))))..)))))))).)))))))))))).)))))}(((((..((((....))))..)))))..{|||..,,{{......{{|,{{{{{..,.||(((((({....}))))))............,,....,........,((({{..,,,}||||{{.{{.........}}.,))))).},,..,.}}},,....))))....,}|||.,{{.{((,.......})),},..}))))..{||||....))))),
Back