Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MYH11_0018600

Sequence Length

656 nt

GC Content

0.5884

UGGACCGCAUCGUGGGCCUGGACCAGAUGGCCAAGAUGACGGAGAGCUCGCUGCCCAGCGCCUCCAAGACCAAGAAGGGCAUGUUCCGCACAGUGGGGCAGCUGUACAAGGAGCAGCUGGGCAAGCUGAUGACCACGCUACGCAACACCACGCCCAACUUCGUGCGCUGCAUCAUCCCCAACCACGAGAAGAGGUCCGGCAAGCUGGAUGCGUUCCUGGUGCUGGAGCAGCUGCGGUGCAAUGGGGUGCUGGAAGGCAUUCGCAUCUGCCGGCAGGGCUUCCCCAACCGGAUCGUCUUCCAGGAGUUCCGCCAACGCUACGAGAUCCUGGCGGCGAAUGCCAUCCCCAAAGGCUUCAUGGACGGGAAGCAGGCCUGCAUUCUCAUGAUCAAAGCCCUGGAACUUGACCCCAACUUAUACAGGAUAGGGCAGAGCAAAAUCUUCUUCCGAACUGGCGUCCUGGCCCACCUAGAGGAGGAGCGAGAUUUGAAGAUCACCGAUGUCAUCAUGGCCUUCCAGGCGAUGUGUCGUGGCUACUUGGCCAGAAAGGCUUUUGCCAAGAGGCAGCAGCAGCUGACCGCCAUGAAGGUGAUUCAGAGGAACUGCGCCGCCUACCUCAAGCUGCGGAACUGGCAGUGGUGGAGGCUUUUCACCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-245.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -257.58

Frequency: 0.0000

Diversity: 151.22

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((.(((((((...((((..........))))..)))).)))..((((...((((((((..((((..(((.......(((.((((((((...))))))))))))).)..))))..))))))))))))..............((..(((((((((..(((((((((((((((...(((...((((.(.(((...((((((....))))))...))))))))...))).....)))))))).))))))).(((((((((...........((((..(((....)))..))))...))))))))).((((((((....(((..(((.....(((((((....((.((......(.((((((((.(((..(((..((.(((..((((.(((((...((((((...((((.............)))).))))))....((((.(((((((((.....(((......)))........))))))).))..))))..)))))...(((.((.(((.((((...)))).))))).)))((((....)))).....(((....)))..))))..))))).)))..))))))))))).)......)))).....)))))))...))).))).))))))))))).))))))...))......))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((.(((((((...((((..........))))..)))).))){((((({((((((((((..((((...,{.......(((.((((((((...))))))))))),}.,..))))..)))))))}|)),{.....,..||,..||..(((((((((..(((((((((((((((.,.(((...((((.(.(((...((((((....))))))...)))}))))...)))...,.))))))))},)))))).(((((((((..,,,,....,{(((..(((....)))..)))),..))))))))).((((((((....(((..(((.....(((((((....((.((......(.((((((((.(((..(((..({{(((..{{{{.{{{{{...((((((...((((.............}))).)})))),||......||{(((((,,,.{{{((.{,,,.}||......,.)))))))}.)),))}}},)),}..{,(((.{{,({|.((({...)))).)))})}))}|(((.,{{|||||{{,.{{{}}},)))}})}))}.))))).)))..))))))))))).)......)))).....)))))))...))).))),))))))))))).))))))},}))))),,.})...