Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0019500
Sequence Length
2181 nt
GC Content
0.5452
GUCACGGUUGGGAAAGAUGACAUCCAGAAGAUGAACCCACCCAAGUUCUCCAAGGUGGAGGACAUGGCGGAGCUGACGUGCCUCAACGAAGCCUCCGUGCUACACAACCUGAGGGAGCGGUACUUCUCAGGGCUAAUAUAUACGUACUCUGGCCUCUUCUGCGUGGUGGUCAACCCCUAUAAACACCUGCCCAUCUACUCGGAGAAGAUCGUCGACAUGUACAAGGGCAAGAAGAGGCACGAGAUGCCGCCUCACAUCUACGCCAUCGCAGACACGGCCUACCGGAGCAUGCUUCAAGAUCGGGAGGACCAGUCCAUUCUAUGCACAGGCGAGUCUGGAGCCGGGAAAACCGAAAACACCAAGAAGGUCAUUCAGUACCUGGCCGUGGUGGCCUCCUCCCACAAGGGCAAGAAAGACACAAGUAUCACGCAAGGCCCAUCUUUUGCCUACGGAGAGCUGGAAAAGCAGCUUCUACAAGCAAACCCGAUUCUGGAGGCUUUCGGCAACGCCAAAACAGUGAAGAACGACAACUCCUCACGAUUCGGCAAAUUCAUCCGCAUCAACUUCGACGUCACGGGUUACAUCGUGGGAGCCAACAUUGAGACCUAUCUGCUAGAAAAAUCACGGGCAAUUCGCCAAGCCAGAGACGAGAGGACAUUCCACAUCUUUUACUACAUGAUUGCUGGAGCCAAGGAGAAGAUGAGAAGUGACUUGCUUUUGGAGGGCUUCAACAACUACACCUUCCUCUCCAAUGGCUUUGUGCCCAUCCCAGCAGCCCAGGAUGAUGAGAUGUUCCAGGAAACCGUGGAGGCCAUGGCAAUCAUGGGUUUCAGCGAGGAGGAGCAGCUAUCCAUAUUGAAGGUGGUAUCAUCGGUCCUGCAGCUUGGAAAUAUCGUCUUCAAGAAGGAAAGAAACACAGACCAGGCGUCCAUGCCAGAUAACACAGCUGCUCAGAAAGUUUGCCACCUCAUGGGAAUUAAUGUGACAGAUUUCACCAGAUCCAUCCUCACUCCUCGUAUCAAGGUUGGGCGAGAUGUGGUACAGAAAGCUCAGACAAAAGAACAGGCUGACUUUGCUGUAGAGGCUUUGGCCAAGGCAACAUAUGAGCGCCUUUUCCGCUGGAUACUCACCCGCGUGAACAAAGCCCUGGACAAGACCCAUCGGCAAGGGGCUUCCUUCCUGGGGAUCCUGGAUAUAGCUGGAUUUGAGAUCUUUGAGGUGAACUCCUUCGAGCAGCUGUGCAUCAACUACACCAACGAGAAGCUGCAGCAGCUCUUCAACCACACCAUGUUCAUCCUGGAGCAGGAGGAGUACCAGCGCGAGGGCAUCGAGUGGAACUUCAUCGACUUUGGGCUGGACCUACAGCCCUGCAUCGAGCUCAUCGAGCGACCGAACAACCCUCCAGGUGUGCUGGCCCUGCUGGACGAGGAAUGCUGGUUCCCCAAAGCCACGGACAAGUCUUUCGUGGAGAAGCUGUGCACGGAGCAGGGCAGCCACCCCAAGUUCCAGAAGCCCAAGCAGCUCAAGGACAAGACUGAGUUCUCCAUCAUCCAUUAUGCUGGGAAGGUGGACUAUAAUGCGAGUGCCUGGCUGACCAAGAAUAUGGACCCGCUGAAUGACAACGUGACUUCCCUGCUCAAUGCCUCCUCCGACAAGUUUGUGGCCGACCUGUGGAAGGACGUGGACCGCAUCGUGGGCCUGGACCAGAUGGCCAAGAUGACGGAGAGCUCGCUGCCCAGCGCCUCCAAGACCAAGAAGGGCAUGUUCCGCACAGUGGGGCAGCUGUACAAGGAGCAGCUGGGCAAGCUGAUGACCACGCUACGCAACACCACGCCCAACUUCGUGCGCUGCAUCAUCCCCAACCACGAGAAGAGGUCCGGCAAGCUGGAUGCGUUCCUGGUGCUGGAGCAGCUGCGGUGCAAUGGGGUGCUGGAAGGCAUUCGCAUCUGCCGGCAGGGCUUCCCCAACCGGAUCGUCUUCCAGGAGUUCCGCCAACGCUACGAGAUCCUGGCGGCGAAUGCCAUCCCCAAAGGCUUCAUGGACGGGAAGCAGGCCUGCAUUCUCAUGAUCAAAGCCCUGGAACUUGACCCCAACUUAUACAGGAUAGGGCAGAGCAAAAUCUUCUUCCGAACUGGCGUCCUGGCCCACCUAGAGGAGGAGCGAGAUUUGAAGAUCACCGAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-737.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -780.08
Frequency: 0.0000
Diversity: 437.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((.((((........((((.....))))..)))).))..((((((((...)))))))).(((((..(((((...(((((...((((((((((..........((((((((........))))))))...................((((...(((((((((((...................(((((...(((((((.((...)).))))...)))...)))))(((.(((((..........)))))...))).))))).))))))...))))...)))))...)))))..(((((((........((((..((.(((....)))))..))))((((((...((.(((...(((.....)))..))).)).)))))).((((.((...))..))))..((((......((........)).......))))....(((((....(((.(((((......))))))))....))))))))))))...)))))..)))))..))))).....((((.((........)).))))(((.(((.........))).)))..........(((((((((...((.(((.((((.......(((....)))..............(((((.(((((.((((((.....(((((((........(((...........)))((.(((((((....(((((.((((......)))))))))....))))))).)).........)))))))...)))))).((.(((.((((((((.....(((((((((((((((((((((..((((((...))))))....(((((........((((((..((((((.(((...(((((((((((((......(((........))).)))))))))))))...)))...............(((......))).(((..(((((((((((.(((((((...(((((((.((((......((((......))))((((((((...((((..(((((.(((....))))))))..))))(((((((((.((((.(.........).)))))))).)))))..(((....)))(((((...........))))).((((..(((...((.((((.(.(((..(((((((......((....)).....)))))))..)))))))))))))))))......))))))))...)))))))))))))))..)))))))))))))).)))................)))))).....)))))).......)))))....))))))))))(..((....))..)((..((((.((...((((((((..((((....((((((......))))))....))))((((...)))).................((((.((((.(((((((((((.((.....)).)))).......(((((((.......))))))).....(((....))))))))))))))))))..)))))))))).))))..)).(((((.(.......))))))))).))))))))....)))))))).)).).))......))))))))))))))..))).)).....)))))).))).))))(.(((((((((....(((....(((((((.........((((((((.(((.....)))...))).)))))..(((((((.((((......((((....((.(((((((((..((((((((..((((..(((.......(((.((((((((...))))))))))))).)..))))..))))))))(((((.....)).)))............((((.......(((((((((...(((...((((.(.(((...((((((....))))))...))))))))...))).....))))))))).((((((...(((.(((((((((.....((((..(((....)))..))))........((((((.(((.((....))...))).))))))..))))))))).)))(((..(((((((((...((((.(((....))).)))))))))....)))).)))......))))))..............)))).))))....))))).)).....)))))))).)))))))...)))))))...)))....)))).))).)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.((,((((.....,..((((.....))))..}||,,}}..((((((({...}))))))).(((((..(((((.{,({{{{..,{((((((((({{........(((((((({{.....}))))))))............,,.....((((...(((((((((((...................(((((.,.(((((((.((...}).))))...)))...))))){{{.(((((..........)))))...}}}.))))).))))))...))))...}))))...))))}.,{{{{((({{{,....((((..((.(((....))}))..))))((((((...{(.(({...(((.....)))..})).)).)))))).{{|{,||..,))}})),,..((((..,...,(,....,,.,,.......)))).,..{((((....((({(((((......))))))))....))))}}}}))},.,,))))),.)))))..))))).....((((.((........)).))))(((.(((........,))).)))..........{({((((((.||({.(((.((((,.....,{,.....}}|...,},....,}.,(((({,(((((.((((((..,..(((((((.......,{{{...........),|{{.(((((((....(((((.((((......)))))))))....))))))).)),........))))))),..)))))).((.(((.((((((((.....(((((((((({((((((((((..,(((((((.((((({...,))))).}}}},,}|,{(((,,{{,{{{.{({...{(((((((((({{..,,{{(.,....|||{||..,}}}}}|||||}}...}))..},........}},|||.....,))).(({..(((((((((((.(((((((...(((((((.{{,..,....|{{,.{{,,,||||((((((((,{{{(((..(((((.{((....))})))))..)))}(((((((((.((((.(.........,.)))))))).)))))..(((,,,,}}}(((((...........))))),(((((.((.......|)|))).))},,|||||{{{{,...,.{{{,..||.,,||}}}}}||}}}},)))},))),))),....}))),,}))}}}))).)))))))))))..)))))))))))))).}))............,,,.}||}}}..}.})))))).......}}}})},..)))))))))){..((....))..}((..((((.((...((((((((..((((....((((((......))))))....))))((((...)))).................((((.(((,{(((((((((((.{(...,.}}.)))),......(((((({.......})))))).....{|{,.,.})})))))))))))))))..)))))))))).))))..)).((((,,(.......)))))))))}})))))))....)))))))).)).).))......))))))))))))))..))).},...}})))))).))}.))))(.(((((((((....(((....(((((((.........((((((((.(((.....)))...))).)))))..(((((((.((((......((((.,..{{.(((((((((((((((((((..((((...,{.......(((.((((((((...))))))))))),}.,..))))..)))))))}|)),{.....,,.||...}}.......,((((...,,,,(((((((((.,.(((...((((.(.(((...((((((....))))))...)))}))))...)))...,.))))))))).||||||,..(((.(((((((((.....((((..(((....)))..))))..,,....((((((.{((.((....))...))}.)))))),}))))))))).)))(((..(((((((((,..((((,(({....))).))))))))}....)))).)))....,,,|||}}.,,.....}))...)))).))))....))))).)),,..,)))))))).)))))))...))))))),..)))....)))).)))},).)
Back