Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0020600
Sequence Length
655 nt
GC Content
0.5588
GUCUGGGGCCAGGGAUGGGGCGGGCCUGAAAACAUUCAUCCCAGGUGAUGCUGCUGGUCUAGGGACCACACUCCGGCUCCCUUUGAGAACCAGUGAAUAGAUGAUCCCUGUGAAGAGCUGCUGGAGUGAUGAUGAGGGGAGGGGGUUUGCUGUUUGUCCCUGGCCAUCAGUGUCCACAGCAGGUUUUAUUCUUGGCACAGGGCCCAUGGGCCUGGGGCUUACAGGACUGGUCUCCCCUUGUUUUAAGCAUGCUAAAAAAAGGGCUCCAGGAGGGGCCAGCUGUGCCCUAACCAUAUGCCAGGCUCUGGGCCUAGGGAACAACAUCGCACCCUGGGUCUGUGUCAUCCCAGGACACAUGAUGAAGCCUGUAGUCCCUCCUCUGCGGGACCCACAGUCUUGUGGGAGAGAUGAGACUCUCAAAGACAAGCAGAGAGACAAGCAUGAGGCUGCGCAUGGUGGCUCACACCUGUAAUCUCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCAGUUGAGGUCAAGAGUUCGAGACCAGUCUGGCCAACGUGGCGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAACUAACUGGGCGUGGUGGUGGUAAUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAACUGCUUGAACCUGGGAGGCGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-248.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -258.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 255.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((....)))..)))))(((..........((((((((...((((((((((....)))).(((((((((..((((((.....(((.((........)).)))))))).)..)))))))))..((((((((((((.((((..((((..(((((.((((....(.((((....((((.......)))).....)))))....)))).)))))..))))))))..))))))))))))...)))).)).........((((((....))))))(((((.(.....(((((..((((.((((.((((((((((..(......)..))))))))))(((((.......))))).........(((((((........))))))).((((((....))))))(((((((...(((((((((....((.((((.(((.(..((((.((((.....))))))))..).)))..)))).)).)))))))))(((((..(....)..)))))...((((..(....)..)))).((.(.((((...)))).).))..)))))))......................)))).)))).)))))....)))))).(((((....)))))((((.....))))....))))))))....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({(((({((({(({{(({({{{{({{({......,|||{{,{{({,,,,,|||,(((((,,,,||||}(((((((((.,|((({.,,..,|{{,{{........)).)))}}})),}..)))))))))..|||||{{{{{{{|||||,,||,|..|||||}||||.,}}|.{{((,.,{({((,......))}|||,,.||||{{..,}}||{|||||..}|||||||,,|||||||||,||{{,,|,,..}),}},.,}}||||||,,,.)))))),,}}}}))),...,,.,,,|}}|}))||}}|{(((((((..{......}..))))))))|((((((.(((((((,|,{{{{.{{.{{(((,,.({...{{{{{{{{,,|.{(((((....)))))|{((({.....|)))}.....,..}))))),)}...}}.,,}))}},|}))}}})}||||,,.(((({...((((((.(({...)))))))))))))).|{,{({{....((((..{....}..)))).,,}|,((({...}))).,.{{{{|{||,|,.{{,.................})),.},))))),))}..|||{||||.,,.}},,}}))}{(((((.....))))))...))))))))))))))
Back