Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MYH11_0021800

Sequence Length

1116 nt

GC Content

0.5215

GGAGAGCUGGAAAAGCAGCUUCUACAAGCAAACCCGAUUCUGGAGGCUUUCGGCAACGCCAAAACAGUGAAGAACGACAACUCCUCACGAUUCGGCAAAUUCAUCCGCAUCAACUUCGACGUCACGGGUUACAUCGUGGGAGCCAACAUUGAGACCUAUCUGCUAGAAAAAUCACGGGCAAUUCGCCAAGCCAGAGACGAGAGGACAUUCCACAUCUUUUACUACAUGAUUGCUGGAGCCAAGGAGAAGAUGAGAAGUGACUUGCUUUUGGAGGGCUUCAACAACUACACCUUCCUCUCCAAUGGCUUUGUGCCCAUCCCAGCAGCCCAGGAUGAUGAGAUGUUCCAGGAAACCGUGGAGGCCAUGGCAAUCAUGGGUUUCAGCGAGGAGGAGCAGCUAUCCAUAUUGAAGGUGGUAUCAUCGGUCCUGCAGCUUGGAAAUAUCGUCUUCAAGAAGGAAAGAAACACAGACCAGGCGUCCAUGCCAGAUAACACAGCUGCUCAGAAAGUUUGCCACCUCAUGGGAAUUAAUGUGACAGAUUUCACCAGAUCCAUCCUCACUCCUCGUAUCAAGGUUGGGCGAGAUGUGGUACAGAAAGCUCAGACAAAAGAACAGGCUGACUUUGCUGUAGAGGCUUUGGCCAAGGCAACAUAUGAGCGCCUUUUCCGCUGGAUACUCACCCGCGUGAACAAAGCCCUGGACAAGACCCAUCGGCAAGGGGCUUCCUUCCUGGGGAUCCUGGAUAUAGCUGGAUUUGAGAUCUUUGAGGUGAACUCCUUCGAGCAGCUGUGCAUCAACUACACCAACGAGAAGCUGCAGCAGCUCUUCAACCACACCAUGUUCAUCCUGGAGCAGGAGGAGUACCAGCGCGAGGGCAUCGAGUGGAACUUCAUCGACUUUGGGCUGGACCUACAGCCCUGCAUCGAGCUCAUCGAGCGACCGAACAACCCUCCAGGUGUGCUGGCCCUGCUGGACGAGGAAUGCUGGUUCCCCAAAGCCACGGACAAGUCUUUCGUGGAGAAGCUGUGCACGGAGCAGGGCAGCCACCCCAAGUUCCAGAAGCCCAAGCAGCUCAAGGACAAGACUGAGUUCUCCAUCAUCCAUUAUGCUGGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-355.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -379.50

Frequency: 0.0000

Diversity: 255.36

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((...(((.....))).((((((((.....((((((...((.((((.....(((...)))......((((.((........)).))))(((.(((.........))).)))..)))).).)...)))))).....)))))))).......((......))((((.(........).))))...(((.((((((.....(((((((........(((...........)))((.(((((((....(((((.((((......)))))))))....))))))).)).........)))))))...)))))).)))))(.((((((((.....(((((((((((((((((((((..((((((...))))))....(((((........((((((..((((((.(((...(((((((((((((......(((........))).)))))))))))))...)))...............(((......))).(((..(((((((((((.(((((((...(((((((.((((......((((......))))((((((((...((((..(((((.(((....))))))))..))))(((((((((.((((.(.........).)))))))).)))))..(((....)))(((((...........))))).((((..(((...((.((((.(.(((..(((((((......((....)).....)))))))..)))))))))))))))))......))))))))...)))))))))))))))..)))))))))))))).)))................)))))).....)))))).......)))))....))))))))))(..((....))..)((..((((.((...((((((((..((((....((((((......))))))....))))((((...)))).................((((.((((.(((((((((((.((.....)).)))).......(((((((.......))))))).....(((....))))))))))))))))))..)))))))))).))))..)).(((((.(.......))))))))).))))))))....)))))))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.,,(((,....}}),||{{((((.,...{(((((.,.,{{((({.,,,{((,...(((.,,...((((.((........)).)))),.|,.|}}........))).,,,..)))),,.}...}))))}...,.)))))))),......|{,.....}}|{{{.{,....,,.,.})},...{((.((((((..,..(((((((.......,{{{...........),|{{.(((((((....(((((.((((......)))))))))....))))))).)},........))))))),..)))))).)))))(.((((((((.....(((((((((({((((((((((..,(((((((.((((({...,))))).}}}},,}|,{(((,,{{,{{{.{({...{(((((((((({{..,,{{(.,....|||{||..,}}}}}|||||}}...}))..},........}},|||.....,))).(({..(((((((((((.(((((((...(((((((.{{,..,....|{{,.{{,,,||||((((((((,{{{(((..(((((.{((....))})))))..)))}(((((((((.((((.(.........,.)))))))).)))))..(((,,,,}}}(((((...........))))),(((((.((.......|)|))).))},,|||||{{{{,...,.{{{,..||.,,||}}}}}||}}}},)))},))),))),....}))),,}))}}}))).)))))))))))..)))))))))))))).}))............,,,.}||}}}..}.})))))).......}}}})},..)))))))))){..((....))..}((..((((.((...((((((((..((((....((((((......))))))....))))((((...)))).................((((.(((,{(((((((((((.{(...,.}}.)))),......(((((({.......})))))).....{|{,.,.})})))))))))))))))..)))))))))).))))..)).((((,,(.......)))))))))}})))))))....)))))))).)