Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0022500
Sequence Length
686 nt
GC Content
0.5219
GUGACUUGCUUUUGGAGGGCUUCAACAACUACACCUUCCUCUCCAAUGGCUUUGUGCCCAUCCCAGCAGCCCAGGAUGAUGAGAUGUUCCAGGAAACCGUGGAGGCCAUGGCAAUCAUGGGUUUCAGCGAGGAGGAGCAGCUAUCCAUAUUGAAGGUGGUAUCAUCGGUCCUGCAGCUUGGAAAUAUCGUCUUCAAGAAGGAAAGAAACACAGACCAGGCGUCCAUGCCAGAUAACACAGCUGCUCAGAAAGUUUGCCACCUCAUGGGAAUUAAUGUGACAGAUUUCACCAGAUCCAUCCUCACUCCUCGUAUCAAGGUUGGGCGAGAUGUGGUACAGAAAGCUCAGACAAAAGAACAGGCUGACUUUGCUGUAGAGGCUUUGGCCAAGGCAACAUAUGAGCGCCUUUUCCGCUGGAUACUCACCCGCGUGAACAAAGCCCUGGACAAGACCCAUCGGCAAGGGGCUUCCUUCCUGGGGAUCCUGGAUAUAGCUGGAUUUGAGAUCUUUGAGGUGAACUCCUUCGAGCAGCUGUGCAUCAACUACACCAACGAGAAGCUGCAGCAGCUCUUCAACCACACCAUGUUCAUCCUGGAGCAGGAGGAGUACCAGCGCGAGGGCAUCGAGUGGAACUUCAUCGACUUUGGGCUGGACCUACAGCCCUGCAUCGAGCUCAUCGAGCGACCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-218.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -233.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((((.((.((((((...............((((((.....(((.....)))(((((..........)))))......((((((((((..((((((...))))))....(((((........((((((..((((((.(((...(((((((((((((......(((........))).)))))))))))))...)))...............(((......))).(((..(((((((((((.(((((((...(((((((.((((......((((......))))((((((((...((((..(((((.(((....))))))))..))))(((((((((.((((.(.........).)))))))).)))))..(((....)))(((((...........))))).((((..(((...((.((((.(.(((..(((((((......((....)).....)))))))..)))))))))))))))))......))))))))...)))))))))))))))..)))))))))))))).)))................)))))).....)))))).......)))))....))))))))))))))))((.(((((.(((((...((((.(((....)))))))))))).)))))))....)))))).))..))))))))((......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...((((.((.((((((.............{{(((((({,,,,(((....,|||({(((..{,,,,{,,}|||}..,..,((((((({(,...|{|||||.{|||{,...})})))})),,.}}|.|||||.|||{{{.{||...,(((({(((((,,..,,(((.,,,..{{{{||...,,,,,|||||,,...,)).,}}........}},|||......))).{{{..(((((((((((.(((((((...(((((((.{{,..,....|{{,.{{,,,||||((((((((,{{{(((..(((((.{((....))})))))..)))}(((((((((.((((.(.........,.)))))))).)))))..(((,,,,}}}(((((...........))))),(((((.((.......|)|))).))},,|||||{{{{,...,.{{{,..||.,,||}}}}}||}}}},)))},))),))),....}))),,}))}}}))).)))))))))))..)))))))))))))).}}}............{{{.|||||,..}})))}))}......,}}}),}}},}}})))))})))))),||.(((((.(((((...((((.(({....}))))))))))).)))))......)))))).))..))))))))((......))
Back