Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0023900
Sequence Length
1417 nt
GC Content
0.5300
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-447.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -476.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 490.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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