Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0026700
Sequence Length
981 nt
GC Content
0.4862
GUUUCUUCCAGAACAAAUCUCCCCUUAACAGCAGGCAUUGUGGUGCAGUGGUUAUACAUGUGUGGACCGGACCCCUGGUUUGAACCCUAAACAAGCAGCCUAGGCUGCAUGUGAUGCUCAAAUGAUCUGUCCCUUAGCUGAGUGACCUUGGGCUGGUUACUCCACCUCUCUGUGCCUCAUCAGCAAAAUGGGGAUGAUAAUGAAUGGUACCUGCCUCAUAGAAAUGUGAGAAUAGAGUGAAUGAACUCAUAUAAAGCUCUAGGCACCAUGCGAGGUGCAGAGUAAGGGCUGGCUACGUAGUGUCUAUCGUAUGAUCUUCACUUCAUCCUUAUUCAGCCAUUGUCCGAGGCCAAAUUCUGGACCUGUCGUCCUCUUAGAGAGUUGGUCUGUGAUCGGCUCCACUUCUUAGGUAGGAAAUUGAUGAAAACAGAGUUUACCCAGAAGAAUGCUGGUAUCGCAAGGAACAAGUAGAGCAUCUCUUUCAUGAACCUGAGCGGUGAAGUGGAGCCAAGUUAGAAAUUUCUGGACGUGGGGGAACAACCAGGUCUAGAGUUCAGUGACUGAUCAGCCUCAGGAGCUUUGCAGGCGGCCCUAGGGCUCAGGCUUCCUGUGGAACACGUGCUUGGCAAUGUAUAGGACCUGGGGGCCUGACUUAGCUUCUUUCUGCACCUGAGGUCCUCUAGCAGCACCUAGUGGUCCCAUUUUUCCACGUUAUGUGCCCUGGAUAAGAGGGUGGGUUGUGGAGUAGCUUCCUCUCCACUGUACUUGUCUAAGCUGUGGGGAUUUGGGAAAAUCACUGAAGCUCUCUGGGCCUCAGUUUUGCCUCGGUAAAAUGGGGGUGAUUGCACCUAGUUUCUGGAGCUGGUGCAGGGGUUAAAUGAAAUAAUAUGCAUAAUAAUAUGCACAGCCCUUGGUACGGUACUGGGCCCAAAGUGAGCAUCUCAUAGGUGGUGGCUAUUGCGUUAACUCAAUGUUUUCUAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-342.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -357.89
Frequency: 0.0000
Diversity: 214.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((......(((.....)))......)))((.(((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((....))))))..........(((.(((((....))))).)))((((((((........((((.......((((((((.......))))))))((((((....(((.......)))....)))).)).........((((((...((((((....))))))....((((......))))......(((((((((((((......))))).(((((((((.(((......((((...(((....)))...))))))))))))))))..(((((..(((((((........((((.....)))).....(((.(((((((.......(((((((((((((((((..((((..((((........((((..((((.......)))).........))))........))))..))))....)))))).....))))))))))).(((((.....((((((((.(((........))).)))))))).....)))))))))))))))(((((((..((((((..(((((((((.(((((((((...)))).....)))))))...........)))))))))))).)..)))))))........(((((((((...((.(((...(((((((((((..((((((((......((..(((((((((.((((((..(.((((....)))).))))))).).)))))))).))))))))))..)))))...))))))..)))))..)))))))))....)))))))...)))))(((((....))))).....)))))))).(((((((((((.............((((((....)))))).))))))).))))))))))))))......)))))))).)))).))))))))))))))))))...)))))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((......(((.....)))......)))((.((((((((,((((((((((((((.(((.((((((((((....))))))..........(((.(((((....))))).)))((((((((........(((((,..,,,({{{{(((..{{{,{||}}||}},{{{,{,,,{((({{{{{{,}|,....)}})}))}.......,((({(({{{((((((....)))))).,,,((((......)))).,,,...(((((,,(((((......)))))})))|(((((((({......{{{{...{((||.,|||,,.}},,{{((((|||||,..{{{((..(((((((.(({....((((.....)))).....(((.(((((((.,.....(((((((((((...{,((((...{(.{(({{,..{{{{|||||{(((.......)))}.,{(,,..,|..,..},||||}.})),)}))}).,}))),.,),,.))))))))))).(((((.....((((((((.(((........))).)))))))).,...)))))))))))))))(((((((..((((((..(((((((((.,,,|}.(((((({....,,{{{{..,)}..},)))}))})))))))))))).)..)))))))........(((((((((...((.(((...{((((((((((..((((((((......((..(((((((((.((((((..{.((({....}))).})))))).).)))))))).))))))))))..)))))...))))))..)))))..))))))))).}),)))))))..,)))))))}))}.{(((((.(((({...))))))))))))}}}}},.,,,,.......((((((....)))))))))))))})))),))))}}))))......)))))))).)))).))))))))))))))},,,.}.)))))))).))..
Back