Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MYH11_0027600
Sequence Length
1383 nt
GC Content
0.4816
AAGAAACCCACAGGUGUCUUCCUUGGCUCCCGAAAAGAUCAUUCAAUCCAUCUUAGUUAGACCCUGGGUGACUGUGUUGCAGAUCAGAAGGAGAAUUACAGUUCUUAUUUGGGAUCUGCUUUUGUGUGACCUUGGCCGAGUCAGUUAACUCCUCGGGGCUAUGGUUUCAUCAUCUAUAAAAUUGAGGGUUUGAACCAGGUCCCCCGAUUUAAAGCUCUCUUGCCAAGACUUUUCAACCUUACCUGCCAGAAUCCCCAUUCUAGAAAGGGAGCCUUUUUCAGAGAGCAUGGAGACCCCAAGUUUAUGUGAACAAAAGUGAUUCCUUUAGUCGUCUUCCCACCAACAAAGAAAUGCCCGUGGUGCUCCUUGUAAAUUUCCACCAGUCUCAGCUGUGGUGAUUCCACUUGUAGCUGAGAUUUGUAUGCGGAUGAGGCUUUUGCUUCAUCUUUCUCUGGGAGCUACAAAAAGGAGGAUGUGUGGACAAAUCAAAACAGAAACAAAUAGCAGCUUCCUGCUUUGUCCUGUAGACCAGGUACCCUGAUGCCUUCCUAGCAUGCGGAGGAAUGAGGAGGAAGCCAUGCCCAUCCUUGUCCCCUCUAGACACUUUCCCGGCUCCUGUCCAGCCCAGCCCUGAUGCCUGGAAAAAUAAGGAAGGGAAAGCAGGAGGGGAGGACAAGGAGAAAAACUCCCAGAAUCCAGGGCCUGGAGGCCUCGGGGCCCAACUGCAGCCGCCAUGUUUUAGGGCUAGGCCAAGAGCAGCUCGUUUGCUUUCCCAGCUUAACUUACCACAUUGGCCCUUUCCUGCCAUGAUUAAUCACGUGACCGCGUUUGUGCAAAGGCAUCCCGGCAGAGGGGGCCGGUGGGCUGUGUACAGUCUCAGCUUCCUUUAACCCAAUGAAUGGAGCUCAGGCAACCUGCUUUGAAGCUUUAUUCCGCAGUCCGCUAAGAGGAUUCCUGGUGGGUUUUGUGCAUUCCUUACUUGUCUGCUGUAGAAGACUUCAGAAAACCAGUCCUGAGAAAGAAAAAAUUGCAACUUAAAAAAAAUUGCACUAAAAUAAUUAGAAGGAGGCUUGUAGUGGUUUAACUUGAAGAAGGCUGCUUGUUAAACAUGAACAGCAGCACGACUGCCAUGUACAGUGGGACAGGUGGUGCACUGCACAACUCCGGGGGGCACCAUUCAUCAUGAUGUAAAUGACAUCACCGACAUUGUGCAAGGCAGUGGCUUUGAGUGGCAGUGAUGUUGCACAGAUGAGCAGGCCCUGGUCUUGAAAAAAGUGACCUUCCUAGGGAGCAGAUGUCCUAGCUAUUAGAGAGCUCAGACAGUUGCUUCUCUUCUGAAAUCCUCCUGUAAAUCUGAACAUUAGCAUCAGGGUCUAAGAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-468.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -492.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 237.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((....))).))))(.((((...))))...((....))..(((.(((....((((((((((.((.(((((((.(((((....(((((.(((.(((.........(((.(((((((.(.((((..((((((.(((..((((......((((((...((((((.(((.((.........)).)))..))))))....)))))).....))))..)))))))))......((((.((((.((((....((((...........))))..(((((((((.((((.(((.....))).)))).............(((((..((((..(((((((((((...((......))...)))((((((((...........((.(((((((((((.((((....))))..))))))))))).))....(((((((((....)))))))))......)))))).)).....))))))))..))))..)))))..((((..((((..(((((....))))))))).)))).(((..(((...((((.(.((((...(((.(((((.((.(((((((...((((.(((((((((((((((((((.....(((((((...((((.......(((((......).)))).......)))).)))))))....))))).))))))))).........(((((((((.((((((.((....)).))))))....(((((((((.........)))(((((..(((((((.....)))))))....)))))........(((((((((((((.((((..........((((....))))..((((....))))...))))))))))))))))))))))).....((((.((((((.((((......)))).)))))).))))...((((...(((......))).))))..........))))).)))))))))..)).)).))))))).)).)))))))).)))).).))))...))).)))))))))))).......(((((.((.....)).)))))...((((.((((.(((....))).)))).)))).((((((((...((((((.(((.......))))))))).(.((((((.(((((((((.((..((((((((.((.(........).)).))))))))..)).((((((.....))))))....))))))))).)))))).))))))))))))))))).)))))))).).)))))))))).((((...........))))......((((((((.((((..((((.......))))..)))).))))))))...))).))).)))))....))))))))).))))))))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((....))).))))(.((((...)))}...{{....,}..{{{.((({..,(((((((((({((.(((((((.(((((....(((((.(((.(((.........(((.(((((((.(,((((..((((({,(((..((((......((((((...((((((((..,(({........}}})}}.}))))))....)))))).....))))..)))))))))......((((.(((,{((((,...{{((..,,.......)))}..(((((((((.((((.(((.....))).)))).............{((((..((((..(((((((({((({.{.......,....})))}|(((((.{,.......,({.(((((((((((.((((....))))..))))))))))).)}....(((((((((....)))))))))....,.)))))}.,,.....))))))))..))))..))))}..((((..((((..(((((....))))))))).)))).(((..(((...((((.(.((((...(((.(((((.((.(((((((...((,{.(((({((((((((((((((.....(((((((...((((.......(((({......),)))).......)))).)))))))....))))).)))))))))......,,,(((((((((.((((((.((....}).)))))).{{,(({(({{{,..,,....{|||({(({..{((((((.....})))))),..,))))}........({{(((((((((,{((((..{,.....,((((....))))..{(((....))))...)))))))))))))))))|||||||....||},,|}}},,............((((((((((((((({...}))}},)}}))))))))).))))}..,,.....)))))},)))})))),,}),}}.))))))).)).)))))))).)))).).))))...))).)))))))))))).......(((((.{{.....,}.)))))...(({{.((((.(((....))).)))).}))).((((((((...((((({,(((.......))))))))).(.((((((.(((((((((.({..((((((((.((.(........),}),))))))))..}}.((((((.....))))))....))))))))).)))))).))))))))))))))))).)))))))).).)))))))))).((((.,......,..)))).....,((((((({.((((..((((.......))))..)))).})))))))},.))).))).)))))....)))))))))},)))))))))))))))))))))
Back